RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 NOMO2Q5JPE7 1267 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 TSHZ3Q63HK5 1081 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF783Q6ZMS7 281 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 GDF7Q7Z4P5 450 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZFPM1Q8IX07 1006 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC17A8Q8NDX2 589 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR6B3Q8NGW1 331 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANKS1AQ92625 1134 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 APIPQ96GX9 242 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 KLHL32Q96NJ5 620 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 NEU1Q99519 415 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 CNPPD1Q9BV87 410 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 APOL5Q9BWW9 433 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 TLR10Q9BXR5 811 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRIM54Q9BYV2 358 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 SIK2Q9H0K1 926 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 NUP62CLQ9H1M0 184 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 GPR35Q9HC97 309 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 SRRDQ9UH36 339 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 USP25Q9UHP3 1055 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 OGDHLQ9ULD0 1010 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 MED16Q9Y2X0 877 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 A0A1B0GTW7 788 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRSS29PA6NIE9 313 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 GRXCR1A8MXD5 290 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 ISM1B1AKI9 464 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 M0QYG6 137 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 MYO1FO00160 1098 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 TBX3O15119 743 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM20BO75063 409 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 RPS6KA4O75676 772 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRSS23O95084 383 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 UNC5CO95185 931 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 CKBP12277 381 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 MYF5P13349 255 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 EN2P19622 333 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 ADAM17P78536 824 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 MXRA7P84157 204 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF844Q08AG5 666 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPATS1Q496A3 300 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC44A4Q53GD3 710 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 RABL3Q5HYI8 236 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 CRB2Q5IJ48 1285 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPDYAQ5MJ70 313 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 IL31Q6EBC2 164 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 FOXR2Q6PJQ5 311 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 C11orf96Q7Z7L8 435 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMPRSS6Q8IU80 811 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 C1orf210Q8IVY1 113 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 KRT78Q8N1N4 520 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 PDPRQ8NCN5 879 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 FBXO41Q8TF61 875 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 SUCLG2Q96I99 432 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 PNKPQ96T60 521 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZSWIM1Q9BR11 485 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 BTBD1Q9H0C5 482 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF287Q9HBT7 754 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 KIAA1586Q9HCI6 787 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 KLHL11Q9NVR0 708 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 PARPBPQ9NWS1 579 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 RNF181Q9P0P0 153 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 CHST2Q9Y4C5 530 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 TESMINQ9Y4I5 508 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 SNX13Q9Y5W8 968 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 XDHP47989 1333 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 GAGE12BA1L429 117 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 GAGE12HA6NDE8 117 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 RHPN2P1A8MT19 583 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 E9PLN8 166 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF185O15231 689 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 ERN1O75460 977 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 GPANK1O95872 356 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 GRPP07492 148 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 MYL3P08590 195 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 RPL17P18621 184 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 FGFR4P22455 802 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 NEK3P51956 506 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARFIP2P53365 341 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 HSD11B2P80365 405 aa3.35□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms