RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 SPATA1Q5VX52 437 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 SHC4Q6S5L8 630 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 CD302Q8IX05 232 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC65Q8IXS2 484 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 FBXL6Q8N531 539 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 IQUBQ8NA54 791 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 BEST2Q8NFU1 509 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 DHX58Q96C10 678 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC34Q96HJ3 373 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 MYADMQ96S97 322 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 LRRC27Q9C0I9 530 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 ASB7Q9H672 318 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 KCNK12Q9HB15 430 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 KBTBD4Q9NVX7 518 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 EPS15L1Q9UBC2 864 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 FBXL5Q9UKA1 691 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 POLIQ9UNA4 740 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 DERAQ9Y315 318 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 C2CD2Q9Y426 696 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 MIA3Q5JRA6 1907 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF292O60281 2723 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 PPEF2O14830 753 aa8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 TBC1D4O60343 1298 aa8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 ABLIM3O94929 683 aa8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 IL18RAPO95256 599 aa8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 ODC1P11926 461 aa8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 CPB1P15086 417 aa8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 ATF2P15336 505 aa8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 ELF1P32519 619 aa8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 MRE11P49959 708 aa8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 LILRA4P59901 499 aa8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 ASIC1P78348 528 aa8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 NTHL1P78549 312 aa8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 AMPD3Q01432 767 aa8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
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SGMS1-201ENST00000361543 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 TDGQ13569 410 aa8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 POSTNQ15063 836 aa8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 C9orf57Q5W0N0 161 aa8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 RESP18Q5W5W9 173 aa8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 TPGS2Q68CL5 300 aa8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 DSTYKQ6XUX3 929 aa8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 RTL10Q7L3V2 364 aa8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 USP37Q86T82 979 aa8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 TCEAL8Q8IYN2 117 aa8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 SYCP3Q8IZU3 236 aa8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF461Q8TAF7 563 aa8.3□□□□□ -1.08
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SGMS1-201ENST00000361543 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 FAM13BQ9NYF5 915 aa8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 IGSF9Q9P2J2 1179 aa8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 PCDHA7Q9UN72 937 aa8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 DUSP12Q9UNI6 340 aa8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 ZDHHC9Q9Y397 364 aa8.3□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 DMXL1Q9Y485 3027 aa8.3□□□□□ -1.08
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SGMS1-201ENST00000361543 DENND4CQ5VZ89 1909 aa8.29□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 ANO9A1A5B4 782 aa8.29□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 ARHGEF37A1IGU5 675 aa8.29□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 OAZ2O95190 189 aa8.29□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 LRG1P02750 347 aa8.29□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 LAMP2P13473 410 aa8.29□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 TYMPP19971 482 aa8.29□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 GARTP22102 1010 aa8.29□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 PAX3P23760 479 aa8.29□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 VCPP55072 806 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 HTR4Q13639 388 aa8.29□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 OVOS1Q6IE37 1185 aa8.29□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 CNNM4Q6P4Q7 775 aa8.29□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 BRSK2Q8IWQ3 736 aa8.29□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 EFCAB13Q8IY85 973 aa8.29□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 GLIS3Q8NEA6 775 aa8.29□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa8.29□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 RSAD2Q8WXG1 361 aa8.29□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 HPS3Q969F9 1004 aa8.29□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 SPATA32Q96LK8 384 aa8.29□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 CBWD1Q9BRT8 395 aa8.29□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 KCNH6Q9H252 994 aa8.29□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM206Q9H813 350 aa8.29□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 CYP4F11Q9HBI6 524 aa8.29□□□□□ -1.08
SGMS1-201ENST00000361543 DPP3Q9NY33 737 aa8.29□□□□□ -1.08
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