RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa16.15■□□□□ 0.18
CSAG1-201ENST00000361211 FBXL5Q9UKA1 691 aa16.15■□□□□ 0.18
CSAG1-201ENST00000361211 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
CSAG1-201ENST00000361211 DENND4AQ7Z401 1863 aa16.14■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa16.14■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 WDR27A2RRH5 827 aa16.14■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF233A6NK53 670 aa16.14■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 LOC730098B7Z3J9 87 aa16.14■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 C1RP00736 705 aa16.14■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 ITGB3P05106 788 aa16.14■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 MTHFRP42898 656 aa16.14■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 ARPP19P56211 112 aa16.14■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 KCNB1Q14721 858 aa16.14■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 CTXN3Q4LDR2 81 aa16.14■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 SLC8B1Q6J4K2 584 aa16.14■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF280DQ6N043 979 aa16.14■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 XXYLT1Q8NBI6 393 aa16.14■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 APPL2Q8NEU8 664 aa16.14■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 OR5B17Q8NGF7 314 aa16.14■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 RIPOR3Q96MK2 946 aa16.14■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 H7C4K7 107 aa16.13■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 ZMYND10O75800 440 aa16.13■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 C8AP07357 584 aa16.13■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 TAF6P49848 677 aa16.13■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 CYP24A1Q07973 514 aa16.13■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 ATAT1Q5SQI0 421 aa16.13■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa16.13■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 BORCS6Q96GS4 357 aa16.13■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 NECTIN4Q96NY8 510 aa16.13■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 INTS13Q9NVM9 706 aa16.13■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 DPP7Q9UHL4 492 aa16.13■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 SIX4Q9UIU6 781 aa16.13■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa16.13■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 C2CD4DB7Z1M9 353 aa16.12■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 PAPLNO95428 1278 aa16.12■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 OR4Q2P0C623 313 aa16.12■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM191BP0C7N4 346 aa16.12■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 ODC1P11926 461 aa16.12■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 TYMPP19971 482 aa16.12■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 LIN9Q5TKA1 542 aa16.12■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa16.12■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 SLC7A14Q8TBB6 771 aa16.12■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 PLEKHO2Q8TD55 490 aa16.12■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM209Q96SK2 561 aa16.12■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 KIAA1586Q9HCI6 787 aa16.12■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa16.12■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 DMAC2Q9NW81 257 aa16.12■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa16.12■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 AGAP1Q9UPQ3 857 aa16.12■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 PDXKO00764 312 aa16.11■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 CYB561D2O14569 222 aa16.11■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 EXOC3O60645 756 aa16.11■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 ABLIM3O94929 683 aa16.11■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 OAZ2O95190 189 aa16.11■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 DLATP10515 647 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 PSMD6Q15008 389 aa16.11■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 SURF1Q15526 300 aa16.11■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 PPM1LQ5SGD2 360 aa16.11■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 OVOS1Q6IE37 1185 aa16.11■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 USP37Q86T82 979 aa16.11■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 RNF135Q8IUD6 432 aa16.11■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 WDR49Q8IV35 697 aa16.11■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa16.11■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 GOLGA5Q8TBA6 731 aa16.11■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 CCDC34Q96HJ3 373 aa16.11■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa16.11■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF560Q96MR9 790 aa16.11■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 TIGD1Q96MW7 591 aa16.11■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 CGRRF1Q99675 332 aa16.11■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 PRKD2Q9BZL6 878 aa16.11■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 EPHX3Q9H6B9 360 aa16.11■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 ITGA11Q9UKX5 1188 aa16.11■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 KPNA7A9QM74 516 aa16.1■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 CCL16O15467 120 aa16.1■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 SEC24AO95486 1093 aa16.1■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 VNN2O95498 520 aa16.1■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 NR3C1P04150 777 aa16.1■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 CYP11A1P05108 521 aa16.1■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 KRT19P08727 400 aa16.1■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 CPB1P15086 417 aa16.1■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 CASP4P49662 377 aa16.1■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 BFSP1Q12934 665 aa16.1■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 SV2CQ496J9 727 aa16.1■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 WSCD1Q658N2 575 aa16.1■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa16.1■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 CCDC149Q6ZUS6 474 aa16.1■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 SLC9A9Q8IVB4 645 aa16.1■□□□□ 0.17
CSAG1-201ENST00000361211 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms