RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360046.9

HOXA4-201, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA4, Length 1,747 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-201ENST00000360046 KLHL30Q0D2K2 578 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP23.46■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP23.46■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 ABI1Q8IZP0 508 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 URGCPQ8TCY9 931 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 ZNF560Q96MR9 790 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 VRTNQ9H8Y1 702 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
HOXA4-201ENST00000360046 SERPING1P05155 500 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 PFKMP08237 780 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 ASPAP45381 313 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 TNNC1P63316 161 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 CDK17Q00537 523 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 NAB2Q15742 525 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 PIRO00625 290 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 STAU1O95793 577 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 CCDC172P0C7W6 258 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 LRPAP1P30533 357 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 PNPLA4P41247 253 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 MTF1Q14872 753 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 NOMO2Q5JPE7 1267 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 HGSNATQ68CP4 663 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 JAKMIP2Q96AA8 810 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 DEF6Q9H4E7 631 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 CACNG4Q9UBN1 327 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 CASTOR2A6NHX0 329 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 INPPL1O15357 1258 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 UPP2O95045 317 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 CD58P19256 250 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 RAD9BQ6WBX8 426 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 FAM71AQ8IYT1 594 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 MMS19Q96T76 1030 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 LTBP2Q14767 1821 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 WEE2P0C1S8 567 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 RAP1GAPP47736 663 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 OTOP2Q7RTS6 562 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 NPAS4Q8IUM7 802 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 CCDC42Q96M95 316 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 HAUS4Q9H6D7 363 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 SMYD3Q9H7B4 428 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 SNX9Q9Y5X1 595 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 PODXLO00592 558 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 CYP26A1O43174 497 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 HOXA2O43364 376 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 FGBP02675 491 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 ACO1P21399 889 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 TAF6P49848 677 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 CLCNKBP51801 687 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 TUSC3Q13454 348 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 SV2CQ496J9 727 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 TMEM270Q6UE05 265 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 FAXDC2Q96IV6 333 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 BCO2Q9BYV7 579 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 CISHQ9NSE2 258 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 PRKCIP41743 596 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 ZNF365Q70YC5 407 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 C16orf59Q7L2K0 433 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 ZSCAN30Q86W11 494 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 RABGGTAQ92696 567 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 KANSL3Q9P2N6 904 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 ZBBXA8MT70 800 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 KPNA7A9QM74 516 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 AMHP03971 560 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 RPL9P32969 192 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 GATMP50440 423 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 PTK2Q05397 1052 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 TBC1D13Q9NVG8 400 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 SPTLC1O15269 473 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 AKR1B10O60218 316 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 EFCAB14O75071 495 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 CLCN1P35523 988 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 CDH8P55286 799 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 LILRA4P59901 499 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 CCDC170Q8IYT3 715 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 CRIPAKQ8N1N5 446 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 UBR7Q8N806 425 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 UROC1Q96N76 676 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 PAAF1Q9BRP4 392 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP23.4■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 CYP3A43Q9HB55 503 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 BAIAP3O94812 1187 aa23.39■■□□□ 1.34
HOXA4-201ENST00000360046 KCNJ6P48051 423 aa23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms