RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358813.4

CCL20-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 800 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-201ENST00000358813 PTPN18Q99952 460 aa6.47□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 ADI1Q9BV57 179 aa6.47□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 SAGE1Q9NXZ1 904 aa6.47□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 POLKQ9UBT6 870 aa6.47□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 PRSS50Q9UI38 385 aa6.47□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 CDC23Q9UJX2 597 aa6.47□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 CORO2BQ9UQ03 480 aa6.47□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa6.47□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 CDY2AQ9Y6F7 541 aa6.47□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 A0A087WV62 115 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 NUDT19A8MXV4 375 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 PRLP01236 227 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 FTLP02792 175 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 NTRK1P04629 796 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 FAM163BP0C2L3 166 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 ALDH1B1P30837 517 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 MAPK9P45984 424 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 STT3AP46977 705 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 SLC6A3Q01959 620 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 ZNF543Q08ER8 600 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 PPFIA1Q13136 1202 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 SLC39A6Q13433 755 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 MYBPC3Q14896 1274 aa6.46□□□□□ -1.38
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CCL20-201ENST00000358813 ADRM1Q16186 407 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 CCDC38Q502W7 563 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 SLFN12LQ6IEE8 588 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 MZT2AQ6P582 158 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 TTC7BQ86TV6 843 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 BRI3BPQ8WY22 251 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 KCNN1Q92952 543 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 PPP1R16BQ96T49 567 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 AP5M1Q9H0R1 490 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 PRDM12Q9H4Q4 367 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 KIAA1586Q9HCI6 787 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 MYPNQ86TC9 1320 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 PASKQ96RG2 1323 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 ABLIM1O14639 778 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 ADAMTS3O15072 1205 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 PEX10O60683 326 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 C8AP07357 584 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 LDHCP07864 332 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 NPR1P16066 1061 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 GPR15P49685 360 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 MAP2K6P52564 334 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 MAPK10P53779 464 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 PPARAQ07869 468 aa6.45□□□□□ -1.38
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CCL20-201ENST00000358813 FGL2Q14314 439 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 TBC1D9BQ66K14 1250 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 OLFML2BQ68BL8 750 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 PRR5LQ6MZQ0 368 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 LYSMD2Q8IV50 215 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 GPC2Q8N158 579 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 TMTC2Q8N394 836 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 CLEC4DQ8WXI8 215 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 C22orf23Q9BZE7 217 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 MCOLN1Q9GZU1 580 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 GREM2Q9H772 168 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 KNSTRNQ9Y448 316 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 ACOT7O00154 380 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP6.44□□□□□ -1.382e-23■■□□□ 11.7
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CCL20-201ENST00000358813 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 NCK2O43639 380 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 MAP2K2P36507 400 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 MCAMP43121 646 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 RAB1AP62820 205 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 DSC2Q02487 901 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 IL10RAQ13651 578 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 NR1I3Q14994 352 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 ZNF124Q15973 351 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 DACT2Q5SW24 774 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 HYIQ5T013 277 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 FAM180AQ6UWF9 173 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 BTNL9Q6UXG8 535 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 DRC7Q8IY82 874 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 SYTL1Q8IYJ3 562 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 TTLL11Q8NHH1 800 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 CALML6Q8TD86 181 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 TMEM41AQ96HV5 264 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CCL20-201ENST00000358813 ZNF287Q9HBT7 754 aa6.44□□□□□ -1.38
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