RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301886.3

ARL2-SNX15-201, Transcript of ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ARL2-SNX15, Length 2,392 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 EML1O00423 815 aa24■■□□□ 1.43
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PLS3P13797 630 aa24■■□□□ 1.43
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PPP2R5CQ13362 524 aa23.98■■□□□ 1.43
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RASA3Q14644 834 aa23.98■■□□□ 1.43
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CCDC142Q17RM4 750 aa23.98■■□□□ 1.43
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 EPC2Q52LR7 807 aa23.98■■□□□ 1.43
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IWS1Q96ST2 819 aa23.98■■□□□ 1.43
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa23.98■■□□□ 1.43
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SLC1A1P43005 524 aa23.97■■□□□ 1.43
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 USP46P62068 366 aa23.97■■□□□ 1.43
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MYBPC2Q14324 1141 aa23.97■■□□□ 1.43
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 VAV1P15498 845 aa23.96■■□□□ 1.43
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KRT4P19013 534 aa23.96■■□□□ 1.43
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ADRA1DP25100 572 aa23.96■■□□□ 1.43
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MAP7Q14244 749 aa23.96■■□□□ 1.43
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SLC47A2Q86VL8 602 aa23.96■■□□□ 1.43
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FAM178BQ8IXR5 827 aa23.96■■□□□ 1.43
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP23.96■■□□□ 1.434e-7■■□□□ 11.9
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KAT5Q92993 513 aa23.96■■□□□ 1.43
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PHACTR1Q9C0D0 580 aa23.96■■□□□ 1.43
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MANSC1Q9H8J5 431 aa23.96■■□□□ 1.43
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ARHGEF4Q9NR80 690 aa23.96■■□□□ 1.43
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