RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 USP38Q8NB14 1042 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 RNF149Q8NC42 400 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 ABCF3Q9NUQ8 709 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 GID8Q9NWU2 228 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 TEX33O43247 280 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 FGFR2P21802 821 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 TYK2P29597 1187 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 RGS4P49798 205 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 GALCP54803 685 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 SNAP25P60880 206 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 STX19Q8N4C7 294 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 PPM1NQ8N819 430 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 ENGASEQ8NFI3 743 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 ANKRD7Q92527 254 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 ZBED2Q9BTP6 218 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 AGXT2Q9BYV1 514 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 GRID1Q9ULK0 1009 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 A0A0G2JND7 137 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 SLCO1B7G3V0H7 640 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 NCAM2O15394 837 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 MAP3K13O43283 966 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 POLBP06746 335 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 TAF6P49848 677 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 HIC1Q14526 733 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 NCAPHQ15003 741 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 ADRM1Q16186 407 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 WDR93Q6P2C0 686 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 FAM83AQ86UY5 434 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 AFG1LQ8WV93 481 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 ZFATQ9P243 1243 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 TBX20Q9UMR3 447 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 FAM47DPA6NHR8 397 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 CYP26A1O43174 497 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 CREB3O43889 395 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 NPTXRO95502 500 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 ADORA2BP29275 332 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 RGS2P41220 211 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 ACTR2P61160 394 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 WDR49Q8IV35 697 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 SCN4BQ8IWT1 228 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 ACTRT1Q8TDG2 376 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 MYOZ2Q9NPC6 264 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 KCND1Q9NSA2 647 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 ABCC6O95255 1503 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 ZMYND10O75800 440 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 LRRC8BQ6P9F7 803 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 C4orf19Q8IY42 314 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 NCLNQ969V3 563 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 SAAL1Q96ER3 474 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 BTBD6Q96KE9 485 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 COLEC11Q9BWP8 271 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 BLOC1S6Q9UL45 172 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 TMCO1Q9UM00 188 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 HPSEQ9Y251 543 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 HEY1Q9Y5J3 304 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 CLGNO14967 610 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 GPR182O15218 404 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 SUPT3HO75486 399 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 PPP1R37O75864 691 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 MAPK1P28482 360 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 KRT72Q14CN4 511 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 TMCO4Q5TGY1 634 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 SLC44A5Q8NCS7 719 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 ASIC4Q96FT7 647 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 NMRK1Q9NWW6 199 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 O00370 1275 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 SRP72O76094 671 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 HLA-DRAP01903 254 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 HIST1H2ADP20671 130 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 PTK2BQ14289 1009 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 EEPD1Q7L9B9 569 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 YAF2Q8IY57 180 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 HIST1H2AJQ99878 128 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 H2AFJQ9BTM1 129 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 SPATA16Q9BXB7 569 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 DPP7Q9UHL4 492 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 AGAP1Q9UPQ3 857 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 FAM205AQ6ZU69 1335 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 MST1RQ04912 1400 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 CFAP99D6REC4 459 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 FCGRTP55899 365 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 SCARF1Q14162 830 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 TC2NQ8N9U0 490 aa9.46□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms