RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 ATP5HO75947 161 aa23.47■■□□□ 1.35
HTATSF1-201ENST00000218364 YARSP54577 528 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
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HTATSF1-201ENST00000218364 P3H1Q32P28 736 aa23.47■■□□□ 1.35
HTATSF1-201ENST00000218364 STYK1Q6J9G0 422 aa23.47■■□□□ 1.35
HTATSF1-201ENST00000218364 TRIM72Q6ZMU5 477 aa23.47■■□□□ 1.35
HTATSF1-201ENST00000218364 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
HTATSF1-201ENST00000218364 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa23.47■■□□□ 1.35
HTATSF1-201ENST00000218364 ATP11AP98196 1134 aa23.47■■□□□ 1.35
HTATSF1-201ENST00000218364 MAMLD1Q13495 774 aa23.47■■□□□ 1.35
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HTATSF1-201ENST00000218364 C2CD6Q53TS8 623 aa23.47■■□□□ 1.35
HTATSF1-201ENST00000218364 TTC25Q96NG3 672 aa23.47■■□□□ 1.35
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM118BQ9BPY3 351 aa23.47■■□□□ 1.35
HTATSF1-201ENST00000218364 CLRN2A0PK11 232 aa23.46■■□□□ 1.35
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HTATSF1-201ENST00000218364 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
HTATSF1-201ENST00000218364 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa23.46■■□□□ 1.35
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HTATSF1-201ENST00000218364 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
HTATSF1-201ENST00000218364 DIAPH2O60879 1101 aa23.46■■□□□ 1.35
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HTATSF1-201ENST00000218364 NAA25Q14CX7 972 aa23.46■■□□□ 1.35
HTATSF1-201ENST00000218364 PGM5Q15124 567 aa23.46■■□□□ 1.35
HTATSF1-201ENST00000218364 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
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HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF570Q96NI8 536 aa23.46■■□□□ 1.35
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HTATSF1-201ENST00000218364 ETNK1Q9HBU6 452 aa23.46■■□□□ 1.35
HTATSF1-201ENST00000218364 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa23.46■■□□□ 1.35
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HTATSF1-201ENST00000218364 MOGSQ13724 837 aa23.46■■□□□ 1.35
HTATSF1-201ENST00000218364 CYP4F22Q6NT55 531 aa23.46■■□□□ 1.35
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM47EQ6ZV65 393 aa23.46■■□□□ 1.35
HTATSF1-201ENST00000218364 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
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HTATSF1-201ENST00000218364 FAM213AQ9BRX8 229 aa23.46■■□□□ 1.35
HTATSF1-201ENST00000218364 MYLK2Q9H1R3 596 aa23.46■■□□□ 1.35
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HTATSF1-201ENST00000218364 SLC5A4Q9NY91 659 aa23.46■■□□□ 1.35
HTATSF1-201ENST00000218364 USH1CQ9Y6N9 552 aa23.46■■□□□ 1.35
HTATSF1-201ENST00000218364 LIASO43766 372 aa23.45■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 GSTA5Q7RTV2 222 aa23.45■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 RDM1Q8NG50 284 aa23.45■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 C11orf70Q9BRQ4 267 aa23.45■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 KIAA1586Q9HCI6 787 aa23.45■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 SAYSD1Q9NPB0 183 aa23.45■■□□□ 1.34
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HTATSF1-201ENST00000218364 ZACNQ401N2 412 aa23.45■■□□□ 1.34
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HTATSF1-201ENST00000218364 SETDB1Q15047 1291 aa23.44■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 ABRAQ8N0Z2 381 aa23.44■■□□□ 1.34
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HTATSF1-201ENST00000218364 PSMD6Q15008 389 aa23.44■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 RASA2Q15283 850 aa23.44■■□□□ 1.34
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HTATSF1-201ENST00000218364 CFHP08603 1231 aa23.43■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 RTP1P59025 263 aa23.43■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 PDK4Q16654 411 aa23.43■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 RCOR2Q8IZ40 523 aa23.43■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM84AQ96KN4 292 aa23.43■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 TMEM237Q96Q45 408 aa23.43■■□□□ 1.34
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HTATSF1-201ENST00000218364 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa23.43■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 CHKBQ9Y259 395 aa23.43■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 SPAG7O75391 227 aa23.43■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 HLA-DRAP01903 254 aa23.43■■□□□ 1.34
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HTATSF1-201ENST00000218364 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa23.43■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP23.43■■□□□ 1.343e-9■■■■□ 19.9
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HTATSF1-201ENST00000218364 PPCSQ9HAB8 311 aa23.43■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 EXTL3O43909 919 aa23.42■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 TAS1R3Q7RTX0 852 aa23.42■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 GLIS1Q8NBF1 620 aa23.42■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 ANKRD27Q96NW4 1050 aa23.42■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 PDLIM7Q9NR12 457 aa23.42■■□□□ 1.34
HTATSF1-201ENST00000218364 H0YIN7 160 aa23.42■■□□□ 1.34
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