RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636566.1

EFHC1-222, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 4

Gene EFHC1, Length 552 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-222	ENST00000636566	NUP155	O75694	1391 aa		7.44	□□□□□ -1.22
EFHC1-222	ENST00000636566	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		7.44	□□□□□ -1.22
EFHC1-222	ENST00000636566	ADGRL2	O95490	1459 aa		7.43	□□□□□ -1.22
EFHC1-222	ENST00000636566	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		7.43	□□□□□ -1.22
EFHC1-222	ENST00000636566	PREX2	Q70Z35	1606 aa		7.43	□□□□□ -1.22
EFHC1-222	ENST00000636566	ASTL	Q6HA08	431 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
EFHC1-222	ENST00000636566	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
EFHC1-222	ENST00000636566	BCAN	Q96GW7	911 aa		7.43	□□□□□ -1.22
EFHC1-222	ENST00000636566	STAC3	Q96MF2	364 aa		7.43	□□□□□ -1.22
EFHC1-222	ENST00000636566	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
EFHC1-222	ENST00000636566	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
EFHC1-222	ENST00000636566	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		7.43	□□□□□ -1.22
EFHC1-222	ENST00000636566	KIF15	Q9NS87	1388 aa		7.43	□□□□□ -1.22
EFHC1-222	ENST00000636566	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		7.43	□□□□□ -1.22
EFHC1-222	ENST00000636566	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	7.42	□□□□□ -1.22
EFHC1-222	ENST00000636566	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		7.42	□□□□□ -1.22
EFHC1-222	ENST00000636566	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
EFHC1-222	ENST00000636566	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
EFHC1-222	ENST00000636566	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		7.42	□□□□□ -1.22
EFHC1-222	ENST00000636566	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		7.42	□□□□□ -1.22
EFHC1-222	ENST00000636566	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		7.41	□□□□□ -1.22
EFHC1-222	ENST00000636566	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
EFHC1-222	ENST00000636566	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		7.41	□□□□□ -1.22
EFHC1-222	ENST00000636566	PLCH2	O75038	1416 aa		7.41	□□□□□ -1.22
EFHC1-222	ENST00000636566	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		7.41	□□□□□ -1.22
EFHC1-222	ENST00000636566	POTEJ	P0CG39	1038 aa		7.4	□□□□□ -1.22
EFHC1-222	ENST00000636566	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	7.4	□□□□□ -1.22
EFHC1-222	ENST00000636566	NBR1	Q14596	966 aa		7.4	□□□□□ -1.22
EFHC1-222	ENST00000636566	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
EFHC1-222	ENST00000636566	METRN	Q9UJH8	293 aa		7.4	□□□□□ -1.22
EFHC1-222	ENST00000636566	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		7.4	□□□□□ -1.22
EFHC1-222	ENST00000636566	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		7.4	□□□□□ -1.22
EFHC1-222	ENST00000636566	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		7.4	□□□□□ -1.22
EFHC1-222	ENST00000636566	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		7.4	□□□□□ -1.22
EFHC1-222	ENST00000636566	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
EFHC1-222	ENST00000636566	ATMIN	O43313	823 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
EFHC1-222	ENST00000636566	ANP32C	O43423	234 aa		7.39	□□□□□ -1.23
EFHC1-222	ENST00000636566	C7	P10643	843 aa		7.39	□□□□□ -1.23
EFHC1-222	ENST00000636566	SLC39A7	Q92504	469 aa		7.39	□□□□□ -1.23
EFHC1-222	ENST00000636566	MS4A3	Q96HJ5	214 aa		7.39	□□□□□ -1.23
EFHC1-222	ENST00000636566	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		7.39	□□□□□ -1.23
EFHC1-222	ENST00000636566	MBD5	Q9P267	1494 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFHC1-222	ENST00000636566	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFHC1-222	ENST00000636566	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
EFHC1-222	ENST00000636566	MAMSTR	Q6ZN01	415 aa		7.38	□□□□□ -1.23
EFHC1-222	ENST00000636566	PZP	P20742	1482 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFHC1-222	ENST00000636566	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
EFHC1-222	ENST00000636566	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		7.37	□□□□□ -1.23
EFHC1-222	ENST00000636566	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
EFHC1-222	ENST00000636566	ASXL2	Q76L83	1435 aa		7.36	□□□□□ -1.23
EFHC1-222	ENST00000636566	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
EFHC1-222	ENST00000636566	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
EFHC1-222	ENST00000636566	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
EFHC1-222	ENST00000636566	USP35	Q9P2H5	1018 aa		7.36	□□□□□ -1.23
EFHC1-222	ENST00000636566	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		7.36	□□□□□ -1.23
EFHC1-222	ENST00000636566	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		7.35	□□□□□ -1.23
EFHC1-222	ENST00000636566	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
EFHC1-222	ENST00000636566	FKBP8	Q14318	412 aa		7.35	□□□□□ -1.23
EFHC1-222	ENST00000636566	LCE2D	Q5TA82	110 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
EFHC1-222	ENST00000636566	AFAP1	Q8N556	730 aa		7.35	□□□□□ -1.23
EFHC1-222	ENST00000636566	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		7.35	□□□□□ -1.23
EFHC1-222	ENST00000636566	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		7.35	□□□□□ -1.23
EFHC1-222	ENST00000636566	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
EFHC1-222	ENST00000636566	KANK1	Q14678	1352 aa		7.34	□□□□□ -1.23
EFHC1-222	ENST00000636566	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
EFHC1-222	ENST00000636566	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
EFHC1-222	ENST00000636566	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		7.34	□□□□□ -1.23
EFHC1-222	ENST00000636566	TICAM2	Q86XR7	235 aa		7.34	□□□□□ -1.23
EFHC1-222	ENST00000636566	FANCA	O15360	1455 aa		7.34	□□□□□ -1.23
EFHC1-222	ENST00000636566	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		7.34	□□□□□ -1.23
EFHC1-222	ENST00000636566	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		7.34	□□□□□ -1.23
EFHC1-222	ENST00000636566	ADGRL1	O94910	1474 aa		7.33	□□□□□ -1.24
EFHC1-222	ENST00000636566	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		7.33	□□□□□ -1.24
EFHC1-222	ENST00000636566	RGL3	Q3MIN7	710 aa		7.33	□□□□□ -1.24
EFHC1-222	ENST00000636566	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		7.33	□□□□□ -1.24
EFHC1-222	ENST00000636566	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		7.33	□□□□□ -1.24
EFHC1-222	ENST00000636566	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		7.33	□□□□□ -1.24
EFHC1-222	ENST00000636566	ABCC1	P33527	1531 aa		7.32	□□□□□ -1.24
EFHC1-222	ENST00000636566	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		7.32	□□□□□ -1.24
EFHC1-222	ENST00000636566	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		7.32	□□□□□ -1.24
EFHC1-222	ENST00000636566	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		7.32	□□□□□ -1.24
EFHC1-222	ENST00000636566	CCER2	I3L3R5	266 aa		7.32	□□□□□ -1.24
EFHC1-222	ENST00000636566	RGS3	P49796	1198 aa		7.32	□□□□□ -1.24
EFHC1-222	ENST00000636566	PROM2	Q8N271	834 aa		7.32	□□□□□ -1.24
EFHC1-222	ENST00000636566	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		7.32	□□□□□ -1.24
EFHC1-222	ENST00000636566	CD109	Q6YHK3	1445 aa		7.32	□□□□□ -1.24
EFHC1-222	ENST00000636566	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		7.32	□□□□□ -1.24
EFHC1-222	ENST00000636566	PLXNC1	O60486	1568 aa		7.32	□□□□□ -1.24
EFHC1-222	ENST00000636566	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		7.32	□□□□□ -1.24
EFHC1-222	ENST00000636566	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		7.31	□□□□□ -1.24
EFHC1-222	ENST00000636566	KIF3B	O15066	747 aa		7.31	□□□□□ -1.24
EFHC1-222	ENST00000636566	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
EFHC1-222	ENST00000636566	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		7.31	□□□□□ -1.24
EFHC1-222	ENST00000636566	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
EFHC1-222	ENST00000636566	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
EFHC1-222	ENST00000636566	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
EFHC1-222	ENST00000636566	CNPY4	Q8N129	248 aa		7.3	□□□□□ -1.24
EFHC1-222	ENST00000636566	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		7.3	□□□□□ -1.24
EFHC1-222	ENST00000636566	SCUBE2	Q9NQ36	999 aa		7.29	□□□□□ -1.24
EFHC1-222	ENST00000636566	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		7.29	□□□□□ -1.24

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