RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616306.1

UBXN8-208, Transcript of UBX domain protein 8, humanhuman

TSL 5

Gene UBXN8, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8-208ENST00000616306 MROH1Q8NDA8 1641 aa15.65■□□□□ 0.1
UBXN8-208ENST00000616306 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
UBXN8-208ENST00000616306 PTPRTO14522 1441 aa15.65■□□□□ 0.1
UBXN8-208ENST00000616306 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa15.65■□□□□ 0.1
UBXN8-208ENST00000616306 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa15.64■□□□□ 0.09
UBXN8-208ENST00000616306 ABCC3O15438 1527 aa15.64■□□□□ 0.09
UBXN8-208ENST00000616306 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa15.64■□□□□ 0.09
UBXN8-208ENST00000616306 CCDC61Q9Y6R9 512 aa15.64■□□□□ 0.09
UBXN8-208ENST00000616306 A2ML1A8K2U0 1454 aa15.64■□□□□ 0.09
UBXN8-208ENST00000616306 PLA2R1Q13018 1463 aa15.63■□□□□ 0.09
UBXN8-208ENST00000616306 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
UBXN8-208ENST00000616306 TNRQ92752 1358 aa15.62■□□□□ 0.09
UBXN8-208ENST00000616306 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
UBXN8-208ENST00000616306 FAM212AQ96EL1 285 aa15.62■□□□□ 0.09
UBXN8-208ENST00000616306 ADGRL2O95490 1459 aa15.62■□□□□ 0.09
UBXN8-208ENST00000616306 DEPDC5O75140 1603 aa15.61■□□□□ 0.09
UBXN8-208ENST00000616306 CEP152O94986 1710 aa15.61■□□□□ 0.09
UBXN8-208ENST00000616306 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
UBXN8-208ENST00000616306 FBXO41Q8TF61 875 aa15.61■□□□□ 0.09
UBXN8-208ENST00000616306 DCBLD2Q96PD2 775 aa15.61■□□□□ 0.09
UBXN8-208ENST00000616306 CHIC2Q9UKJ5 165 aa15.6■□□□□ 0.09
UBXN8-208ENST00000616306 NLRP1Q9C000 1473 aa15.59■□□□□ 0.09
UBXN8-208ENST00000616306 PKD2Q13563 968 aa15.59■□□□□ 0.09
UBXN8-208ENST00000616306 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa15.58■□□□□ 0.09
UBXN8-208ENST00000616306 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa15.58■□□□□ 0.08
UBXN8-208ENST00000616306 DCAF8Q5TAQ9 597 aa15.57■□□□□ 0.08
UBXN8-208ENST00000616306 CERKQ8TCT0 537 aa15.57■□□□□ 0.08
UBXN8-208ENST00000616306 MS4A3Q96HJ5 214 aa15.57■□□□□ 0.08
UBXN8-208ENST00000616306 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
UBXN8-208ENST00000616306 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
UBXN8-208ENST00000616306 KANK1Q14678 1352 aa15.56■□□□□ 0.08
UBXN8-208ENST00000616306 ERVK-7P63135 1459 aa15.56■□□□□ 0.08
UBXN8-208ENST00000616306 VWDEQ8N2E2 1590 aa15.55■□□□□ 0.08
UBXN8-208ENST00000616306 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP15.55■□□□□ 0.08
UBXN8-208ENST00000616306 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa15.55■□□□□ 0.08
UBXN8-208ENST00000616306 LMTK2Q8IWU2 1503 aa15.54■□□□□ 0.08
UBXN8-208ENST00000616306 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
UBXN8-208ENST00000616306 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
UBXN8-208ENST00000616306 UGGT1Q9NYU2 1555 aa15.53■□□□□ 0.08
UBXN8-208ENST00000616306 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa15.53■□□□□ 0.08
UBXN8-208ENST00000616306 KIF12Q96FN5 646 aa15.53■□□□□ 0.08
UBXN8-208ENST00000616306 ROCK1Q13464 1354 aa15.52■□□□□ 0.08
UBXN8-208ENST00000616306 POTEIP0CG38 1075 aa15.52■□□□□ 0.08
UBXN8-208ENST00000616306 LTBP4Q8N2S1 1624 aa15.5■□□□□ 0.07
UBXN8-208ENST00000616306 MAP3K13O43283 966 aa15.5■□□□□ 0.07
UBXN8-208ENST00000616306 ANKLE2Q86XL3 938 aa15.49■□□□□ 0.07
UBXN8-208ENST00000616306 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
UBXN8-208ENST00000616306 NEURL4Q96JN8 1562 aa15.49■□□□□ 0.07
UBXN8-208ENST00000616306 UBR1Q8IWV7 1749 aa15.48■□□□□ 0.07
UBXN8-208ENST00000616306 EFCAB6Q5THR3 1501 aa15.48■□□□□ 0.07
UBXN8-208ENST00000616306 IQSEC2Q5JU85 1478 aa15.47■□□□□ 0.07
UBXN8-208ENST00000616306 MED14O60244 1454 aa15.46■□□□□ 0.07
UBXN8-208ENST00000616306 UNC13BO14795 1591 aa15.46■□□□□ 0.07
UBXN8-208ENST00000616306 SPOCK2Q92563 424 aa15.46■□□□□ 0.07
UBXN8-208ENST00000616306 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
UBXN8-208ENST00000616306 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
UBXN8-208ENST00000616306 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
UBXN8-208ENST00000616306 TET3O43151 1660 aa15.44■□□□□ 0.06
UBXN8-208ENST00000616306 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
UBXN8-208ENST00000616306 NOS1P29475 1434 aa15.43■□□□□ 0.06
UBXN8-208ENST00000616306 PYGBP11216 843 aa15.43■□□□□ 0.06
UBXN8-208ENST00000616306 GCC2Q8IWJ2 1684 aa15.43■□□□□ 0.06
UBXN8-208ENST00000616306 PIK3C2BO00750 1634 aa15.43■□□□□ 0.06
UBXN8-208ENST00000616306 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
UBXN8-208ENST00000616306 SYNMO15061 1565 aa15.42■□□□□ 0.06
UBXN8-208ENST00000616306 ARHGAP23Q9P227 1491 aa15.42■□□□□ 0.06
UBXN8-208ENST00000616306 ITGAEP38570 1179 aa15.42■□□□□ 0.06
UBXN8-208ENST00000616306 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa15.42■□□□□ 0.06
UBXN8-208ENST00000616306 SLIT1O75093 1534 aa15.42■□□□□ 0.06
UBXN8-208ENST00000616306 IQGAP1P46940 1657 aa15.41■□□□□ 0.06
UBXN8-208ENST00000616306 GSE1Q14687 1217 aa15.41■□□□□ 0.06
UBXN8-208ENST00000616306 IQGAP3Q86VI3 1631 aa15.4■□□□□ 0.06
UBXN8-208ENST00000616306 SLC52A1Q9NWF4 448 aa15.4■□□□□ 0.06
UBXN8-208ENST00000616306 IDI1Q13907 227 aa15.39■□□□□ 0.05
UBXN8-208ENST00000616306 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
UBXN8-208ENST00000616306 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
UBXN8-208ENST00000616306 CPS1P31327 1500 aa15.38■□□□□ 0.05
UBXN8-208ENST00000616306 TRPC6Q9Y210 931 aa15.37■□□□□ 0.05
UBXN8-208ENST00000616306 EID1Q9Y6B2 187 aa15.37■□□□□ 0.05
UBXN8-208ENST00000616306 E9PCH4 1651 aa15.37■□□□□ 0.05
UBXN8-208ENST00000616306 TMEM2Q9UHN6 1383 aa15.36■□□□□ 0.05
UBXN8-208ENST00000616306 LTKP29376 864 aa15.36■□□□□ 0.05
UBXN8-208ENST00000616306 TXNDC2Q86VQ3 553 aa15.36■□□□□ 0.05
UBXN8-208ENST00000616306 ADGRB3O60242 1522 aa15.36■□□□□ 0.05
UBXN8-208ENST00000616306 NUP155O75694 1391 aa15.36■□□□□ 0.05
UBXN8-208ENST00000616306 NAIPQ13075 1403 aa15.33■□□□□ 0.04
UBXN8-208ENST00000616306 IFNL1Q8IU54 200 aa15.32■□□□□ 0.04
UBXN8-208ENST00000616306 SGIP1Q9BQI5 828 aa15.32■□□□□ 0.04
UBXN8-208ENST00000616306 MYO5BQ9ULV0 1848 aa15.31■□□□□ 0.04
UBXN8-208ENST00000616306 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
UBXN8-208ENST00000616306 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
UBXN8-208ENST00000616306 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa15.31■□□□□ 0.04
UBXN8-208ENST00000616306 STRCP1A6NGW2 1772 aa15.3■□□□□ 0.04
UBXN8-208ENST00000616306 HFM1A2PYH4 1435 aa15.29■□□□□ 0.04
UBXN8-208ENST00000616306 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
UBXN8-208ENST00000616306 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
UBXN8-208ENST00000616306 UBAP1LF5GYI3 381 aa15.28■□□□□ 0.04
UBXN8-208ENST00000616306 ZFYVE9O95405 1425 aa15.27■□□□□ 0.04
UBXN8-208ENST00000616306 HDGFP51858 240 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
UBXN8-208ENST00000616306 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms