RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598594.1

PAF1-208, Transcript of PAF1 homolog, Paf1/RNA polymerase II complex component, human

TSL 2

Gene PAF1, Length 280 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PAF1-208	ENST00000598594	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		7.44	□□□□□ -1.22
PAF1-208	ENST00000598594	SIRT1	Q96EB6	747 aa		7.44	□□□□□ -1.22
PAF1-208	ENST00000598594	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
PAF1-208	ENST00000598594	RFX1	P22670	979 aa		7.43	□□□□□ -1.22
PAF1-208	ENST00000598594	PDE4A	P27815	886 aa		7.43	□□□□□ -1.22
PAF1-208	ENST00000598594	UBXN4	Q92575	508 aa		7.43	□□□□□ -1.22
PAF1-208	ENST00000598594	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		7.43	□□□□□ -1.22
PAF1-208	ENST00000598594	MFSD10	Q14728	455 aa		7.42	□□□□□ -1.22
PAF1-208	ENST00000598594	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
PAF1-208	ENST00000598594	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
PAF1-208	ENST00000598594	GLMN	Q92990	594 aa		7.42	□□□□□ -1.22
PAF1-208	ENST00000598594	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		7.42	□□□□□ -1.22
PAF1-208	ENST00000598594	CAMK2B	Q13554	666 aa		7.41	□□□□□ -1.22
PAF1-208	ENST00000598594	OXER1	Q8TDS5	423 aa		7.41	□□□□□ -1.22
PAF1-208	ENST00000598594		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
PAF1-208	ENST00000598594	DDX27	Q96GQ7	796 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
PAF1-208	ENST00000598594	SNRK	Q9NRH2	765 aa		7.4	□□□□□ -1.22
PAF1-208	ENST00000598594	POM121C	A8CG34	1229 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PAF1-208	ENST00000598594		G3V3G9	751 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PAF1-208	ENST00000598594	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
PAF1-208	ENST00000598594	WWC1	Q8IX03	1113 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PAF1-208	ENST00000598594	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PAF1-208	ENST00000598594	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
PAF1-208	ENST00000598594	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PAF1-208	ENST00000598594	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
PAF1-208	ENST00000598594	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PAF1-208	ENST00000598594	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PAF1-208	ENST00000598594	HS3ST6	Q96QI5	342 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PAF1-208	ENST00000598594	PPME1	Q9Y570	386 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PAF1-208	ENST00000598594	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
PAF1-208	ENST00000598594	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PAF1-208	ENST00000598594	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PAF1-208	ENST00000598594	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
PAF1-208	ENST00000598594	ERCC3	P19447	782 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PAF1-208	ENST00000598594	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PAF1-208	ENST00000598594	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PAF1-208	ENST00000598594	BOLA1	Q9Y3E2	137 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PAF1-208	ENST00000598594	FAM205C	A6NFA0	338 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PAF1-208	ENST00000598594	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
PAF1-208	ENST00000598594	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
PAF1-208	ENST00000598594	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PAF1-208	ENST00000598594	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
PAF1-208	ENST00000598594	BANK1	Q8NDB2	785 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PAF1-208	ENST00000598594	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PAF1-208	ENST00000598594	REPIN1	Q9BWE0	567 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
PAF1-208	ENST00000598594	KRTAP3-3	Q9BYR6	98 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PAF1-208	ENST00000598594	KRTAP3-2	Q9BYR7	98 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PAF1-208	ENST00000598594	CABP2	Q9NPB3	220 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PAF1-208	ENST00000598594	NUTM2F	A1L443	756 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PAF1-208	ENST00000598594	FGD1	P98174	961 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PAF1-208	ENST00000598594	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PAF1-208	ENST00000598594	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PAF1-208	ENST00000598594	GNPAT	O15228	680 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PAF1-208	ENST00000598594	ABL2	P42684	1182 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PAF1-208	ENST00000598594	CRISPLD2	Q9H0B8	497 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PAF1-208	ENST00000598594	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PAF1-208	ENST00000598594	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
PAF1-208	ENST00000598594	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PAF1-208	ENST00000598594	RAB11FIP3	O75154	756 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PAF1-208	ENST00000598594	FECH	P22830	423 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PAF1-208	ENST00000598594	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
PAF1-208	ENST00000598594	DOK7	Q18PE1	504 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PAF1-208	ENST00000598594	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PAF1-208	ENST00000598594	GORAB	Q5T7V8	394 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PAF1-208	ENST00000598594	GIPC2	Q8TF65	315 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PAF1-208	ENST00000598594	POTEB3	A0JP26	581 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PAF1-208	ENST00000598594	HOXB3	P14651	431 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
PAF1-208	ENST00000598594	HOXB1	P14653	301 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
PAF1-208	ENST00000598594	FOSB	P53539	338 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PAF1-208	ENST00000598594	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PAF1-208	ENST00000598594	POTEB	Q6S5H4	581 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PAF1-208	ENST00000598594	DPH6	Q7L8W6	267 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PAF1-208	ENST00000598594	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PAF1-208	ENST00000598594	FBXO22	Q8NEZ5	403 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PAF1-208	ENST00000598594	PKNOX2	Q96KN3	472 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PAF1-208	ENST00000598594	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PAF1-208	ENST00000598594	RIMBP2	O15034	1052 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PAF1-208	ENST00000598594	NLRP6	P59044	892 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PAF1-208	ENST00000598594	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PAF1-208	ENST00000598594	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	7.3	□□□□□ -1.24
PAF1-208	ENST00000598594	RFC5	P40937	340 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PAF1-208	ENST00000598594	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
PAF1-208	ENST00000598594	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PAF1-208	ENST00000598594	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
PAF1-208	ENST00000598594	DPYSL4	O14531	572 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PAF1-208	ENST00000598594	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
PAF1-208	ENST00000598594	ANAPC15	P60006	121 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PAF1-208	ENST00000598594	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
PAF1-208	ENST00000598594	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
PAF1-208	ENST00000598594	MAFG	O15525	162 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PAF1-208	ENST00000598594	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PAF1-208	ENST00000598594	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PAF1-208	ENST00000598594	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PAF1-208	ENST00000598594	HIC1	Q14526	733 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PAF1-208	ENST00000598594	PDIA6	Q15084	440 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PAF1-208	ENST00000598594	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
PAF1-208	ENST00000598594	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PAF1-208	ENST00000598594	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PAF1-208	ENST00000598594	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	7.26	□□□□□ -1.25
PAF1-208	ENST00000598594	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		7.26	□□□□□ -1.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.3 ms