RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518046.1

HOXA-AS2-204, HOXA cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 3

Gene HOXA-AS2, Length 422 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA-AS2-204ENST00000518046 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa6.59□□□□□ -1.35
HOXA-AS2-204ENST00000518046 PREX2Q70Z35 1606 aa6.59□□□□□ -1.35
HOXA-AS2-204ENST00000518046 PLPP6Q8IY26 295 aa6.59□□□□□ -1.35
HOXA-AS2-204ENST00000518046 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
HOXA-AS2-204ENST00000518046 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa6.59□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-204ENST00000518046 SCAPERQ9BY12 1400 aa6.59□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-204ENST00000518046 PLCB2Q00722 1185 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-204ENST00000518046 DSG2Q14126 1118 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-204ENST00000518046 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-204ENST00000518046 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-204ENST00000518046 CADPS2Q86UW7 1296 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-204ENST00000518046 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-204ENST00000518046 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-204ENST00000518046 ARHGAP5Q13017 1502 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-204ENST00000518046 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-204ENST00000518046 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-204ENST00000518046 ADAMTSL3P82987 1691 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-204ENST00000518046 BCORL1Q5H9F3 1711 aa6.57□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-204ENST00000518046 POGZQ7Z3K3 1410 aa6.57□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-204ENST00000518046 YEATS2Q9ULM3 1422 aa6.57□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-204ENST00000518046 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa6.56□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-204ENST00000518046 ITSN2Q9NZM3 1697 aa6.56□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-204ENST00000518046 SLC34A2O95436 690 aa6.56□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-204ENST00000518046 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-204ENST00000518046 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa6.55□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-204ENST00000518046 MAGI2Q86UL8 1455 aa6.55□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-204ENST00000518046 POTEMA6NI47 508 aa6.55□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-204ENST00000518046 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-204ENST00000518046 MFSD10Q14728 455 aa6.55□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-204ENST00000518046 AFAP1Q8N556 730 aa6.55□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-204ENST00000518046 KDM5CP41229 1560 aa6.55□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-204ENST00000518046 ABCC1P33527 1531 aa6.55□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-204ENST00000518046 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-204ENST00000518046 MADDQ8WXG6 1647 aa6.54□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-204ENST00000518046 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa6.54□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-204ENST00000518046 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-204ENST00000518046 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa6.54□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-204ENST00000518046 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa6.54□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-204ENST00000518046 EMP3P54852 163 aa6.54□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-204ENST00000518046 POTEGQ6S5H5 508 aa6.54□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-204ENST00000518046 WDR70Q9NW82 654 aa6.54□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-204ENST00000518046 MTUS2Q5JR59 1369 aa6.54□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-204ENST00000518046 TIAM1Q13009 1591 aa6.53□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-204ENST00000518046 HECW2Q9P2P5 1572 aa6.53□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-204ENST00000518046 VPS8Q8N3P4 1428 aa6.53□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-204ENST00000518046 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-204ENST00000518046 TBC1D12O60347 775 aa6.53□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-204ENST00000518046 ARSIQ5FYB1 569 aa6.53□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-204ENST00000518046 MARVELD3Q96A59 401 aa6.53□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-204ENST00000518046 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa6.53□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-204ENST00000518046 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-204ENST00000518046 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa6.53□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-204ENST00000518046 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa6.53□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-204ENST00000518046 ABCA6Q8N139 1617 aa6.53□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-204ENST00000518046 CCNB3Q8WWL7 1395 aa6.53□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-204ENST00000518046 ATP10AO60312 1499 aa6.53□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-204ENST00000518046 PTPRMP28827 1452 aa6.53□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-204ENST00000518046 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa6.52□□□□□ -1.36
HOXA-AS2-204ENST00000518046 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa6.52□□□□□ -1.37
HOXA-AS2-204ENST00000518046 GPR153Q6NV75 609 aa6.52□□□□□ -1.37
HOXA-AS2-204ENST00000518046 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
HOXA-AS2-204ENST00000518046 MLH3Q9UHC1 1453 aa6.52□□□□□ -1.37
HOXA-AS2-204ENST00000518046 C9orf84Q5VXU9 1444 aa6.51□□□□□ -1.37
HOXA-AS2-204ENST00000518046 SYCP2Q9BX26 1530 aa6.51□□□□□ -1.37
HOXA-AS2-204ENST00000518046 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
HOXA-AS2-204ENST00000518046 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.37
HOXA-AS2-204ENST00000518046 MLECQ14165 292 aa6.51□□□□□ -1.37
HOXA-AS2-204ENST00000518046 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
HOXA-AS2-204ENST00000518046 MYT1LQ9UL68 1186 aa6.51□□□□□ -1.37
HOXA-AS2-204ENST00000518046 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa6.51□□□□□ -1.37
HOXA-AS2-204ENST00000518046 ERBB3P21860 1342 aa6.5□□□□□ -1.37
HOXA-AS2-204ENST00000518046 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
HOXA-AS2-204ENST00000518046 REREQ9P2R6 1566 aa6.5□□□□□ -1.37
HOXA-AS2-204ENST00000518046 NCOA2Q15596 1464 aa6.5□□□□□ -1.37
HOXA-AS2-204ENST00000518046 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
HOXA-AS2-204ENST00000518046 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
HOXA-AS2-204ENST00000518046 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa6.49□□□□□ -1.37
HOXA-AS2-204ENST00000518046 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa6.49□□□□□ -1.37
HOXA-AS2-204ENST00000518046 FAM205CA6NFA0 338 aa6.49□□□□□ -1.37
HOXA-AS2-204ENST00000518046 NUDT7P0C024 238 aa6.49□□□□□ -1.37
HOXA-AS2-204ENST00000518046 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
HOXA-AS2-204ENST00000518046 OXER1Q8TDS5 423 aa6.49□□□□□ -1.37
HOXA-AS2-204ENST00000518046 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.37
HOXA-AS2-204ENST00000518046 MAP3K1Q13233 1512 aa6.49□□□□□ -1.37
HOXA-AS2-204ENST00000518046 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa6.49□□□□□ -1.37
HOXA-AS2-204ENST00000518046 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
HOXA-AS2-204ENST00000518046 MBD5Q9P267 1494 aa6.48□□□□□ -1.37
HOXA-AS2-204ENST00000518046 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
HOXA-AS2-204ENST00000518046 AGLP35573 1532 aa6.48□□□□□ -1.37
HOXA-AS2-204ENST00000518046 ATP7AQ04656 1500 aa6.48□□□□□ -1.37
HOXA-AS2-204ENST00000518046 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
HOXA-AS2-204ENST00000518046 MAP3K9P80192 1104 aa6.47□□□□□ -1.37
HOXA-AS2-204ENST00000518046 ERICH6Q7L0X2 663 aa6.47□□□□□ -1.37
HOXA-AS2-204ENST00000518046 HS3ST6Q96QI5 342 aa6.47□□□□□ -1.37
HOXA-AS2-204ENST00000518046 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa6.47□□□□□ -1.37
HOXA-AS2-204ENST00000518046 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
HOXA-AS2-204ENST00000518046 CAMK2BQ13554 666 aa6.46□□□□□ -1.38
HOXA-AS2-204ENST00000518046 E2F4Q16254 413 aa6.46□□□□□ -1.38
HOXA-AS2-204ENST00000518046 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
HOXA-AS2-204ENST00000518046 PCDH10Q9P2E7 1040 aa6.46□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms