RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516272.1

RNU6-277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-277P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-277P-201ENST00000516272 FCHSD2O94868 740 aa8.39□□□□□ -1.07
RNU6-277P-201ENST00000516272 ADGRG1Q9Y653 693 aa8.39□□□□□ -1.07
RNU6-277P-201ENST00000516272 RCCD1A6NED2 376 aa8.38□□□□□ -1.07
RNU6-277P-201ENST00000516272 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa8.38□□□□□ -1.07
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM134Q9H6X4 195 aa8.38□□□□□ -1.07
RNU6-277P-201ENST00000516272 V9GY48 417 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
RNU6-277P-201ENST00000516272 KMT5BQ4FZB7 885 aa8.37□□□□□ -1.07
RNU6-277P-201ENST00000516272 CFHP08603 1231 aa8.35□□□□□ -1.07
RNU6-277P-201ENST00000516272 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
RNU6-277P-201ENST00000516272 TLL1O43897 1013 aa8.34□□□□□ -1.07
RNU6-277P-201ENST00000516272 TRAF7Q6Q0C0 670 aa8.34□□□□□ -1.07
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMUB1Q9BVT8 246 aa8.34□□□□□ -1.07
RNU6-277P-201ENST00000516272 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa8.33□□□□□ -1.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 OATP04181 439 aa8.32□□□□□ -1.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 SMYD5Q6GMV2 418 aa8.32□□□□□ -1.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 RNF223E7ERA6 249 aa8.3□□□□□ -1.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 PLCB2Q00722 1185 aa8.3□□□□□ -1.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 HIC1Q14526 733 aa8.3□□□□□ -1.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 RSPH4AQ5TD94 716 aa8.3□□□□□ -1.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 PXYLP1Q8TE99 480 aa8.3□□□□□ -1.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 NR1I2O75469 434 aa8.29□□□□□ -1.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC10A3P09131 477 aa8.29□□□□□ -1.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 S1PR4O95977 384 aa8.28□□□□□ -1.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC19A1P41440 591 aa8.28□□□□□ -1.08
RNU6-277P-201ENST00000516272 LCE2BO14633 110 aa8.27□□□□□ -1.09
RNU6-277P-201ENST00000516272 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
RNU6-277P-201ENST00000516272 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
RNU6-277P-201ENST00000516272 RDH13Q8NBN7 331 aa8.26□□□□□ -1.09
RNU6-277P-201ENST00000516272 GNPATO15228 680 aa8.25□□□□□ -1.09
RNU6-277P-201ENST00000516272 ADH1BP00325 375 aa8.25□□□□□ -1.09
RNU6-277P-201ENST00000516272 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
RNU6-277P-201ENST00000516272 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
RNU6-277P-201ENST00000516272 ANKLE1Q8NAG6 615 aa8.25□□□□□ -1.09
RNU6-277P-201ENST00000516272 FECHP22830 423 aa8.24□□□□□ -1.09
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC6A16Q9GZN6 736 aa8.24□□□□□ -1.09
RNU6-277P-201ENST00000516272 DDX11L8A8MPP1 907 aa8.23□□□□□ -1.09
RNU6-277P-201ENST00000516272 SCUBE3Q8IX30 993 aa8.23□□□□□ -1.09
RNU6-277P-201ENST00000516272 SPRYD7Q5W111 196 aa8.22□□□□□ -1.09
RNU6-277P-201ENST00000516272 NLRP7Q8WX94 980 aa8.22□□□□□ -1.09
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF697Q5TEC3 545 aa8.21□□□□□ -1.1
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
RNU6-277P-201ENST00000516272 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
RNU6-277P-201ENST00000516272 SPSB2Q99619 263 aa8.21□□□□□ -1.1
RNU6-277P-201ENST00000516272 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
RNU6-277P-201ENST00000516272 PKDCCQ504Y2 493 aa8.2□□□□□ -1.1
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF787Q6DD87 383 aa8.2□□□□□ -1.1
RNU6-277P-201ENST00000516272 LIAT1Q6ZQX7 453 aa8.2□□□□□ -1.1
RNU6-277P-201ENST00000516272 GPIHBP1Q8IV16 184 aa8.2□□□□□ -1.1
RNU6-277P-201ENST00000516272 TRIM67Q6ZTA4 783 aa8.19□□□□□ -1.1
RNU6-277P-201ENST00000516272 TNFRSF10AO00220 468 aa8.18□□□□□ -1.1
RNU6-277P-201ENST00000516272 GPR37O15354 613 aa8.18□□□□□ -1.1
RNU6-277P-201ENST00000516272 FUT2Q10981 343 aa8.18□□□□□ -1.1
RNU6-277P-201ENST00000516272 SULF1Q8IWU6 871 aa8.17□□□□□ -1.1
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM187AA6NFU0 413 aa8.16□□□□□ -1.1
RNU6-277P-201ENST00000516272 ATP6V1AP38606 617 aa8.16□□□□□ -1.1
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRR20EP86478 221 aa8.15□□□□□ -1.1
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRR20CP86479 221 aa8.15□□□□□ -1.1
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRR20DP86480 221 aa8.15□□□□□ -1.1
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRR20BP86481 221 aa8.15□□□□□ -1.1
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRR20AP86496 221 aa8.15□□□□□ -1.1
RNU6-277P-201ENST00000516272 PLA2G2CQ5R387 149 aa8.15□□□□□ -1.1
RNU6-277P-201ENST00000516272 MORN1Q5T089 497 aa8.15□□□□□ -1.1
RNU6-277P-201ENST00000516272 DGAT1O75907 488 aa8.14□□□□□ -1.11
RNU6-277P-201ENST00000516272 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
RNU6-277P-201ENST00000516272 FOXC1Q12948 553 aa8.14□□□□□ -1.11
RNU6-277P-201ENST00000516272 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
RNU6-277P-201ENST00000516272 GCGRP47871 477 aa8.13□□□□□ -1.11
RNU6-277P-201ENST00000516272 PHOX2BQ99453 314 aa8.13□□□□□ -1.11
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa8.13□□□□□ -1.11
RNU6-277P-201ENST00000516272 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
RNU6-277P-201ENST00000516272 MYT1Q01538 1121 aa8.12□□□□□ -1.11
RNU6-277P-201ENST00000516272 GDF9O60383 454 aa8.11□□□□□ -1.11
RNU6-277P-201ENST00000516272 GRIPAP1Q4V328 841 aa8.11□□□□□ -1.11
RNU6-277P-201ENST00000516272 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa8.11□□□□□ -1.11
RNU6-277P-201ENST00000516272 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
RNU6-277P-201ENST00000516272 THAP11Q96EK4 314 aa8.09□□□□□ -1.11
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRDM9Q9NQV7 894 aa8.09□□□□□ -1.11
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
RNU6-277P-201ENST00000516272 RPIAP49247 311 aa8.08□□□□□ -1.12
RNU6-277P-201ENST00000516272 MAP2K5Q13163 448 aa8.07□□□□□ -1.12
RNU6-277P-201ENST00000516272 BRICD5Q6PL45 260 aa8.07□□□□□ -1.12
RNU6-277P-201ENST00000516272 PKD2L1Q9P0L9 805 aa8.07□□□□□ -1.12
RNU6-277P-201ENST00000516272 ST8SIA5O15466 376 aa8.06□□□□□ -1.12
RNU6-277P-201ENST00000516272 Q3C1V9 767 aa8.06□□□□□ -1.12
RNU6-277P-201ENST00000516272 LMOD2Q6P5Q4 547 aa8.06□□□□□ -1.12
RNU6-277P-201ENST00000516272 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa8.06□□□□□ -1.12
RNU6-277P-201ENST00000516272 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
RNU6-277P-201ENST00000516272 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
RNU6-277P-201ENST00000516272 CYP4X1Q8N118 509 aa8.05□□□□□ -1.12
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
RNU6-277P-201ENST00000516272 MSS51Q4VC12 460 aa8.04□□□□□ -1.12
RNU6-277P-201ENST00000516272 POTECB2RU33 542 aa8.03□□□□□ -1.12
RNU6-277P-201ENST00000516272 IRF6O14896 467 aa8.03□□□□□ -1.12
RNU6-277P-201ENST00000516272 KDM4AO75164 1064 aa8.03□□□□□ -1.12
RNU6-277P-201ENST00000516272 CD46P15529 392 aa8.03□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.3 ms