RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503687.2

RABGEF1-211, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 4,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-211ENST00000503687 CABP2Q9NPB3 220 aa16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1-211ENST00000503687 DISP3Q9P2K9 1392 aa16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1-211ENST00000503687 MYH16Q9H6N6 1097 aa16.35■□□□□ 0.21
RABGEF1-211ENST00000503687 GGNBP2Q9H3C7 697 aa16.34■□□□□ 0.21
RABGEF1-211ENST00000503687 ERBINQ96RT1 1412 aa16.34■□□□□ 0.21
RABGEF1-211ENST00000503687 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
RABGEF1-211ENST00000503687 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.21
RABGEF1-211ENST00000503687 BACH2Q9BYV9 841 aa16.33■□□□□ 0.2
RABGEF1-211ENST00000503687 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
RABGEF1-211ENST00000503687 TCP11L2Q8N4U5 519 aa16.32■□□□□ 0.2
RABGEF1-211ENST00000503687 MS4A1P11836 297 aa16.32■□□□□ 0.2
RABGEF1-211ENST00000503687 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
RABGEF1-211ENST00000503687 PZPP20742 1482 aa16.3■□□□□ 0.2
RABGEF1-211ENST00000503687 TPRNQ4KMQ1 711 aa16.3■□□□□ 0.2
RABGEF1-211ENST00000503687 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
RABGEF1-211ENST00000503687 CGNL1Q0VF96 1302 aa16.28■□□□□ 0.2
RABGEF1-211ENST00000503687 SYCP2Q9BX26 1530 aa16.28■□□□□ 0.2
RABGEF1-211ENST00000503687 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa16.26■□□□□ 0.19
RABGEF1-211ENST00000503687 TEX14Q8IWB6 1497 aa16.26■□□□□ 0.19
RABGEF1-211ENST00000503687 VGFO15240 615 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
RABGEF1-211ENST00000503687 TESK2Q96S53 571 aa16.26■□□□□ 0.19
RABGEF1-211ENST00000503687 FOXD4L1Q9NU39 408 aa16.26■□□□□ 0.19
RABGEF1-211ENST00000503687 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa16.26■□□□□ 0.19
RABGEF1-211ENST00000503687 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
RABGEF1-211ENST00000503687 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa16.25■□□□□ 0.19
RABGEF1-211ENST00000503687 TERF2IPQ9NYB0 399 aa16.25■□□□□ 0.19
RABGEF1-211ENST00000503687 NCLP19338 710 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
RABGEF1-211ENST00000503687 EVC2Q86UK5 1308 aa16.25■□□□□ 0.19
RABGEF1-211ENST00000503687 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
RABGEF1-211ENST00000503687 RUNDC1Q96C34 613 aa16.25■□□□□ 0.19
RABGEF1-211ENST00000503687 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
RABGEF1-211ENST00000503687 HMOX1P09601 288 aa16.23■□□□□ 0.19
RABGEF1-211ENST00000503687 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
RABGEF1-211ENST00000503687 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
RABGEF1-211ENST00000503687 NFKBIBQ15653 356 aa16.22■□□□□ 0.19
RABGEF1-211ENST00000503687 RIPK4P57078 832 aa16.22■□□□□ 0.19
RABGEF1-211ENST00000503687 DUSP27Q5VZP5 1158 aa16.22■□□□□ 0.19
RABGEF1-211ENST00000503687 SLFN5Q08AF3 891 aa16.21■□□□□ 0.19
RABGEF1-211ENST00000503687 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa16.21■□□□□ 0.19
RABGEF1-211ENST00000503687 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa16.21■□□□□ 0.19
RABGEF1-211ENST00000503687 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 ADGRL1O94910 1474 aa16.2■□□□□ 0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 ITSN2Q9NZM3 1697 aa16.2■□□□□ 0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 FANCAO15360 1455 aa16.19■□□□□ 0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 HSCBQ8IWL3 235 aa16.19■□□□□ 0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa16.19■□□□□ 0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 PLCH2O75038 1416 aa16.19■□□□□ 0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 CD109Q6YHK3 1445 aa16.19■□□□□ 0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 LMOD2Q6P5Q4 547 aa16.18■□□□□ 0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 WWC1Q8IX03 1113 aa16.18■□□□□ 0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 GSE1Q14687 1217 aa16.18■□□□□ 0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 IL27Q8NEV9 243 aa16.18■□□□□ 0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 RALGAPBQ86X10 1494 aa16.18■□□□□ 0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 ERCC6L2Q5T890 1561 aa16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 PRAG1Q86YV5 1406 aa16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 LNPKQ9C0E8 428 aa16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 ANKRD45Q5TZF3 282 aa16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 STAC3Q96MF2 364 aa16.15■□□□□ 0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 PRAM1Q96QH2 718 aa16.15■□□□□ 0.18
RABGEF1-211ENST00000503687 ASXL2Q76L83 1435 aa16.14■□□□□ 0.17
RABGEF1-211ENST00000503687 USP35Q9P2H5 1018 aa16.14■□□□□ 0.17
RABGEF1-211ENST00000503687 PARD3Q8TEW0 1356 aa16.14■□□□□ 0.17
RABGEF1-211ENST00000503687 SLC4A10Q6U841 1118 aa16.14■□□□□ 0.17
RABGEF1-211ENST00000503687 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa16.14■□□□□ 0.17
RABGEF1-211ENST00000503687 FAM135AQ9P2D6 1515 aa16.14■□□□□ 0.17
RABGEF1-211ENST00000503687 FBLN1P23142 703 aa16.13■□□□□ 0.17
RABGEF1-211ENST00000503687 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
RABGEF1-211ENST00000503687 ABCC10Q5T3U5 1492 aa16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1-211ENST00000503687 BRPF3Q9ULD4 1205 aa16.12■□□□□ 0.17
RABGEF1-211ENST00000503687 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa16.11■□□□□ 0.17
RABGEF1-211ENST00000503687 IGHDP01880 384 aa16.11■□□□□ 0.17
RABGEF1-211ENST00000503687 NSD3Q9BZ95 1437 aa16.11■□□□□ 0.17
RABGEF1-211ENST00000503687 C1orf115Q9H7X2 142 aa16.1■□□□□ 0.17
RABGEF1-211ENST00000503687 CABP1Q9NZU7 370 aa16.1■□□□□ 0.17
RABGEF1-211ENST00000503687 TNNQ9UQP3 1299 aa16.1■□□□□ 0.17
RABGEF1-211ENST00000503687 ABCC2Q92887 1545 aa16.1■□□□□ 0.17
RABGEF1-211ENST00000503687 ABCA8O94911 1581 aa16.1■□□□□ 0.17
RABGEF1-211ENST00000503687 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
RABGEF1-211ENST00000503687 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
RABGEF1-211ENST00000503687 CARD14Q9BXL6 1004 aa16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1-211ENST00000503687 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1-211ENST00000503687 DMRT2Q9Y5R5 561 aa16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1-211ENST00000503687 MBD5Q9P267 1494 aa16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1-211ENST00000503687 PDE3AQ14432 1141 aa16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1-211ENST00000503687 GOLGA6L22H0YM25 854 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1-211ENST00000503687 PRKAR2BP31323 418 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1-211ENST00000503687 IDI1Q13907 227 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1-211ENST00000503687 GCC2Q8IWJ2 1684 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1-211ENST00000503687 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
RABGEF1-211ENST00000503687 NECTIN2Q92692 538 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGEF1-211ENST00000503687 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms