RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496565.5

LPIN3-204, Transcript of lipin 3, human

TSL 3

Gene LPIN3, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LPIN3-204	ENST00000496565	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		13.13	□□□□□ -0.31
LPIN3-204	ENST00000496565	NLRP1	Q9C000	1473 aa		13.13	□□□□□ -0.31
LPIN3-204	ENST00000496565	PPL	O60437	1756 aa		13.12	□□□□□ -0.31
LPIN3-204	ENST00000496565	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
LPIN3-204	ENST00000496565	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
LPIN3-204	ENST00000496565	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
LPIN3-204	ENST00000496565	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		13.12	□□□□□ -0.31
LPIN3-204	ENST00000496565	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
LPIN3-204	ENST00000496565	TNR	Q92752	1358 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LPIN3-204	ENST00000496565	MLEC	Q14165	292 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LPIN3-204	ENST00000496565	CDCA8	Q53HL2	280 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LPIN3-204	ENST00000496565	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LPIN3-204	ENST00000496565	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
LPIN3-204	ENST00000496565	PIK3C2G	O75747	1445 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LPIN3-204	ENST00000496565	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
LPIN3-204	ENST00000496565	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LPIN3-204	ENST00000496565	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		13.08	□□□□□ -0.31
LPIN3-204	ENST00000496565	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
LPIN3-204	ENST00000496565	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		13.07	□□□□□ -0.32
LPIN3-204	ENST00000496565	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
LPIN3-204	ENST00000496565	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		13.07	□□□□□ -0.32
LPIN3-204	ENST00000496565	CCDC7	Q96M83	1385 aa		13.07	□□□□□ -0.32
LPIN3-204	ENST00000496565	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		13.06	□□□□□ -0.32
LPIN3-204	ENST00000496565	FBXO41	Q8TF61	875 aa		13.06	□□□□□ -0.32
LPIN3-204	ENST00000496565	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
LPIN3-204	ENST00000496565	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		13.05	□□□□□ -0.32
LPIN3-204	ENST00000496565	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		13.05	□□□□□ -0.32
LPIN3-204	ENST00000496565	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		13.05	□□□□□ -0.32
LPIN3-204	ENST00000496565	TMF1	P82094	1093 aa		13.04	□□□□□ -0.32
LPIN3-204	ENST00000496565	IQGAP1	P46940	1657 aa		13.04	□□□□□ -0.32
LPIN3-204	ENST00000496565	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		13.04	□□□□□ -0.32
LPIN3-204	ENST00000496565	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	13.03	□□□□□ -0.32
LPIN3-204	ENST00000496565	C3	P01024	1663 aa		13.02	□□□□□ -0.32
LPIN3-204	ENST00000496565	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		13.02	□□□□□ -0.32
LPIN3-204	ENST00000496565	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	13.02	□□□□□ -0.33
LPIN3-204	ENST00000496565	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		13.02	□□□□□ -0.33
LPIN3-204	ENST00000496565	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		13.01	□□□□□ -0.33
LPIN3-204	ENST00000496565	SIRT1	Q96EB6	747 aa		13.01	□□□□□ -0.33
LPIN3-204	ENST00000496565	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		13.01	□□□□□ -0.33
LPIN3-204	ENST00000496565	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		13.01	□□□□□ -0.33
LPIN3-204	ENST00000496565	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		13	□□□□□ -0.33
LPIN3-204	ENST00000496565	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		13	□□□□□ -0.33
LPIN3-204	ENST00000496565	ANP32C	O43423	234 aa		13	□□□□□ -0.33
LPIN3-204	ENST00000496565	TESK2	Q96S53	571 aa		13	□□□□□ -0.33
LPIN3-204	ENST00000496565	ADGRB1	O14514	1584 aa		12.99	□□□□□ -0.33
LPIN3-204	ENST00000496565	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
LPIN3-204	ENST00000496565	CCER2	I3L3R5	266 aa		12.99	□□□□□ -0.33
LPIN3-204	ENST00000496565	EID1	Q9Y6B2	187 aa		12.99	□□□□□ -0.33
LPIN3-204	ENST00000496565	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		12.99	□□□□□ -0.33
LPIN3-204	ENST00000496565	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		12.99	□□□□□ -0.33
LPIN3-204	ENST00000496565	SLIT1	O75093	1534 aa		12.98	□□□□□ -0.33
LPIN3-204	ENST00000496565	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	12.98	□□□□□ -0.33
LPIN3-204	ENST00000496565	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		12.97	□□□□□ -0.33
LPIN3-204	ENST00000496565	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	12.96	□□□□□ -0.33
LPIN3-204	ENST00000496565	DLC1	Q96QB1	1528 aa		12.96	□□□□□ -0.33
LPIN3-204	ENST00000496565	ABCC11	Q96J66	1382 aa		12.95	□□□□□ -0.34
LPIN3-204	ENST00000496565	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		12.95	□□□□□ -0.34
LPIN3-204	ENST00000496565	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	12.95	□□□□□ -0.34
LPIN3-204	ENST00000496565	ALK	Q9UM73	1620 aa		12.95	□□□□□ -0.34
LPIN3-204	ENST00000496565	MIER1	Q8N108	512 aa		12.94	□□□□□ -0.34
LPIN3-204	ENST00000496565	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	12.94	□□□□□ -0.34
LPIN3-204	ENST00000496565	PIK3R4	Q99570	1358 aa		12.93	□□□□□ -0.34
LPIN3-204	ENST00000496565	DIP2A	Q14689	1571 aa		12.92	□□□□□ -0.34
LPIN3-204	ENST00000496565	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	12.92	□□□□□ -0.34
LPIN3-204	ENST00000496565	TBX22	Q9Y458	520 aa		12.92	□□□□□ -0.34
LPIN3-204	ENST00000496565	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	12.92	□□□□□ -0.34
LPIN3-204	ENST00000496565	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	12.92	□□□□□ -0.34
LPIN3-204	ENST00000496565	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		12.92	□□□□□ -0.34
LPIN3-204	ENST00000496565	TECPR2	O15040	1411 aa		12.91	□□□□□ -0.34
LPIN3-204	ENST00000496565	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		12.91	□□□□□ -0.34
LPIN3-204	ENST00000496565	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	12.91	□□□□□ -0.34
LPIN3-204	ENST00000496565	EVC2	Q86UK5	1308 aa		12.9	□□□□□ -0.34
LPIN3-204	ENST00000496565	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	12.9	□□□□□ -0.34
LPIN3-204	ENST00000496565	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		12.9	□□□□□ -0.34
LPIN3-204	ENST00000496565	SOCS7	O14512	581 aa		12.89	□□□□□ -0.35
LPIN3-204	ENST00000496565	RALBP1	Q15311	655 aa		12.89	□□□□□ -0.35
LPIN3-204	ENST00000496565	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		12.89	□□□□□ -0.35
LPIN3-204	ENST00000496565	MED14	O60244	1454 aa		12.89	□□□□□ -0.35
LPIN3-204	ENST00000496565	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		12.88	□□□□□ -0.35
LPIN3-204	ENST00000496565	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		12.88	□□□□□ -0.35
LPIN3-204	ENST00000496565	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
LPIN3-204	ENST00000496565	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		12.88	□□□□□ -0.35
LPIN3-204	ENST00000496565	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
LPIN3-204	ENST00000496565	PTPRM	P28827	1452 aa		12.87	□□□□□ -0.35
LPIN3-204	ENST00000496565	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		12.87	□□□□□ -0.35
LPIN3-204	ENST00000496565	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
LPIN3-204	ENST00000496565	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		12.86	□□□□□ -0.35
LPIN3-204	ENST00000496565	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		12.86	□□□□□ -0.35
LPIN3-204	ENST00000496565	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		12.86	□□□□□ -0.35
LPIN3-204	ENST00000496565	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		12.85	□□□□□ -0.35
LPIN3-204	ENST00000496565	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
LPIN3-204	ENST00000496565	POGK	Q9P215	609 aa		12.85	□□□□□ -0.35
LPIN3-204	ENST00000496565	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		12.85	□□□□□ -0.35
LPIN3-204	ENST00000496565	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		12.85	□□□□□ -0.35
LPIN3-204	ENST00000496565	LTK	P29376	864 aa		12.84	□□□□□ -0.35
LPIN3-204	ENST00000496565	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
LPIN3-204	ENST00000496565	ILDR2	Q71H61	639 aa		12.84	□□□□□ -0.35
LPIN3-204	ENST00000496565	CPS1	P31327	1500 aa		12.83	□□□□□ -0.36
LPIN3-204	ENST00000496565	BCAN	Q96GW7	911 aa		12.82	□□□□□ -0.36
LPIN3-204	ENST00000496565	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		12.82	□□□□□ -0.36

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