RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484046.1

TM4SF1-AS1-201, TM4SF1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TM4SF1-AS1, Length 488 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 GGT6Q6P531 493 aa9.5□□□□□ -0.89
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 A2MP01023 1474 aa9.5□□□□□ -0.89
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 MAP3K1Q13233 1512 aa9.5□□□□□ -0.89
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa9.49□□□□□ -0.89
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 C19orf67A6NJJ6 358 aa9.49□□□□□ -0.89
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 TMEM94Q12767 1356 aa9.49□□□□□ -0.89
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ATAD2Q6PL18 1390 aa9.49□□□□□ -0.89
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 MIA2Q96PC5 1412 aa9.48□□□□□ -0.89
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 PREX2Q70Z35 1606 aa9.48□□□□□ -0.89
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.89
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 PYGBP11216 843 aa9.46□□□□□ -0.9
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CD44P16070 742 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 AFF2P51816 1311 aa9.45□□□□□ -0.9
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SHPRHQ149N8 1683 aa9.45□□□□□ -0.9
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CLIP1P30622 1438 aa9.44□□□□□ -0.9
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 TIAM1Q13009 1591 aa9.42□□□□□ -0.9
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SYCP2Q9BX26 1530 aa9.42□□□□□ -0.9
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 POTEHQ6S545 545 aa9.42□□□□□ -0.9
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SLAIN2Q9P270 581 aa9.42□□□□□ -0.9
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 NHSL1Q5SYE7 1610 aa9.42□□□□□ -0.9
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 YY1P25490 414 aa9.41□□□□□ -0.9
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 EVX2Q03828 476 aa9.41□□□□□ -0.9
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CCDC125Q86Z20 511 aa9.41□□□□□ -0.9
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 NWD1Q149M9 1564 aa9.41□□□□□ -0.9
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ARHGAP23Q9P227 1491 aa9.4□□□□□ -0.9
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ABCC3O15438 1527 aa9.4□□□□□ -0.91
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 DIP2AQ14689 1571 aa9.39□□□□□ -0.91
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 KIF12Q96FN5 646 aa9.39□□□□□ -0.91
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SLIT1O75093 1534 aa9.39□□□□□ -0.91
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ADGBQ8N7X0 1667 aa9.39□□□□□ -0.91
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 MSH6P52701 1360 aa9.38□□□□□ -0.91
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 LTKP29376 864 aa9.38□□□□□ -0.91
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 PHF12Q96QT6 1004 aa9.38□□□□□ -0.91
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 NCOA2Q15596 1464 aa9.37□□□□□ -0.91
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 HAX1O00165 279 aa9.37□□□□□ -0.91
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 MAP3K13O43283 966 aa9.37□□□□□ -0.91
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 KCNA6P17658 529 aa9.37□□□□□ -0.91
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa9.37□□□□□ -0.91
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 NGLY1Q96IV0 654 aa9.36□□□□□ -0.91
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP9.35□□□□□ -0.91
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 UBR1Q8IWV7 1749 aa9.35□□□□□ -0.91
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 BCL9LQ86UU0 1499 aa9.34□□□□□ -0.91
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa9.34□□□□□ -0.91
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa9.34□□□□□ -0.91
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 TXNDC2Q86VQ3 553 aa9.34□□□□□ -0.91
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SGIP1Q9BQI5 828 aa9.34□□□□□ -0.91
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 PCDHB8Q9UN66 801 aa9.34□□□□□ -0.91
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa9.34□□□□□ -0.91
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 FMN1Q68DA7 1419 aa9.33□□□□□ -0.92
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 VGFO15240 615 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 HRCP23327 699 aa9.33□□□□□ -0.92
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 IFNL1Q8IU54 200 aa9.33□□□□□ -0.92
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ERVK-7P63135 1459 aa9.33□□□□□ -0.92
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa9.32□□□□□ -0.92
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 C8orf37Q96NL8 207 aa9.32□□□□□ -0.92
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa9.32□□□□□ -0.92
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 KIF3BO15066 747 aa9.31□□□□□ -0.92
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa9.31□□□□□ -0.92
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SETD5Q9C0A6 1442 aa9.31□□□□□ -0.92
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 TET3O43151 1660 aa9.3□□□□□ -0.92
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 MAST1Q9Y2H9 1570 aa9.3□□□□□ -0.92
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa9.3□□□□□ -0.92
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 HS6ST3Q8IZP7 471 aa9.3□□□□□ -0.92
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 EP400Q96L91 3159 aa9.29□□□□□ -0.92
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa9.29□□□□□ -0.92
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CHGAP10645 457 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 EID1Q9Y6B2 187 aa9.29□□□□□ -0.92
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 TMEM2Q9UHN6 1383 aa9.28□□□□□ -0.92
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 DEFB132Q7Z7B7 95 aa9.28□□□□□ -0.92
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 MS4A3Q96HJ5 214 aa9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 109 ms