RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466676.5

RUNDC3B-204, Transcript of RUN domain containing 3B, human

TSL 2

Gene RUNDC3B, Length 582 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RUNDC3B-204	ENST00000466676	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
RUNDC3B-204	ENST00000466676	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		13.22	□□□□□ -0.29
RUNDC3B-204	ENST00000466676	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
RUNDC3B-204	ENST00000466676	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		13.22	□□□□□ -0.29
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		13.21	□□□□□ -0.3
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SLIT1	O75093	1534 aa		13.19	□□□□□ -0.3
RUNDC3B-204	ENST00000466676	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		13.18	□□□□□ -0.3
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KIF15	Q9NS87	1388 aa		13.18	□□□□□ -0.3
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		13.17	□□□□□ -0.3
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		13.17	□□□□□ -0.3
RUNDC3B-204	ENST00000466676	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KCNA6	P17658	529 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.31
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
RUNDC3B-204	ENST00000466676	LTK	P29376	864 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
RUNDC3B-204	ENST00000466676	BCAN	Q96GW7	911 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CEP152	O94986	1710 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RUNDC3B-204	ENST00000466676	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MSH6	P52701	1360 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ALK	Q9UM73	1620 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RUNDC3B-204	ENST00000466676	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
RUNDC3B-204	ENST00000466676	IDI1	Q13907	227 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RUNDC3B-204	ENST00000466676	FKBP8	Q14318	412 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RUNDC3B-204	ENST00000466676	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TMEM94	Q12767	1356 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ABCC5	O15440	1437 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	13.09	□□□□□ -0.31
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
RUNDC3B-204	ENST00000466676	DAPK1	P53355	1430 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		13.06	□□□□□ -0.32
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SLAIN2	Q9P270	581 aa		13.06	□□□□□ -0.32
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PIK3C2B	O00750	1634 aa		13.06	□□□□□ -0.32
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		13.05	□□□□□ -0.32
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		13.05	□□□□□ -0.32
RUNDC3B-204	ENST00000466676	JCAD	Q9P266	1359 aa		13.05	□□□□□ -0.32
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NOS1	P29475	1434 aa		13.05	□□□□□ -0.32
RUNDC3B-204	ENST00000466676	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		13.05	□□□□□ -0.32
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		13.03	□□□□□ -0.32
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	13.03	□□□□□ -0.32
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TBX22	Q9Y458	520 aa		13.03	□□□□□ -0.32
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		13.03	□□□□□ -0.32
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ADGRB3	O60242	1522 aa		13.03	□□□□□ -0.32
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	13.02	□□□□□ -0.33
RUNDC3B-204	ENST00000466676	C14orf37	Q86TY3	774 aa		13.02	□□□□□ -0.33
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		13.02	□□□□□ -0.33
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		13.02	□□□□□ -0.33
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PIK3R4	Q99570	1358 aa		13.02	□□□□□ -0.33
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TET3	O43151	1660 aa		13.02	□□□□□ -0.33
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ATF3	P18847	181 aa		13.01	□□□□□ -0.33
RUNDC3B-204	ENST00000466676	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	13	□□□□□ -0.33
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		13	□□□□□ -0.33
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NWD1	Q149M9	1564 aa		13	□□□□□ -0.33
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ADGRL2	O95490	1459 aa		13	□□□□□ -0.33
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	13	□□□□□ -0.33
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	13	□□□□□ -0.33
RUNDC3B-204	ENST00000466676	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		13	□□□□□ -0.33
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		12.99	□□□□□ -0.33
RUNDC3B-204	ENST00000466676	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
RUNDC3B-204	ENST00000466676	POTEA	Q6S8J7	498 aa		12.98	□□□□□ -0.33
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		12.97	□□□□□ -0.33
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		12.96	□□□□□ -0.33
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	12.96	□□□□□ -0.33
RUNDC3B-204	ENST00000466676	DIP2A	Q14689	1571 aa		12.95	□□□□□ -0.34
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PHLPP1	O60346	1717 aa		12.95	□□□□□ -0.34
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ZFYVE9	O95405	1425 aa		12.95	□□□□□ -0.34
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	12.94	□□□□□ -0.34
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ROCK1	Q13464	1354 aa		12.92	□□□□□ -0.34
RUNDC3B-204	ENST00000466676	DCC	P43146	1447 aa		12.91	□□□□□ -0.34
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RXRB	P28702	533 aa		12.91	□□□□□ -0.34
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CHRDL2	Q6WN34	429 aa		12.91	□□□□□ -0.34
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	12.91	□□□□□ -0.34
RUNDC3B-204	ENST00000466676	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		12.9	□□□□□ -0.34
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TRPM2	O94759	1503 aa		12.9	□□□□□ -0.34
RUNDC3B-204	ENST00000466676	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	12.9	□□□□□ -0.34
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		12.89	□□□□□ -0.35
RUNDC3B-204	ENST00000466676	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		12.89	□□□□□ -0.35
RUNDC3B-204	ENST00000466676	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NUP155	O75694	1391 aa		12.86	□□□□□ -0.35
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		12.86	□□□□□ -0.35
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SPDYE6	P0CI01	402 aa		12.86	□□□□□ -0.35
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		12.86	□□□□□ -0.35
RUNDC3B-204	ENST00000466676	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SHPRH	Q149N8	1683 aa		12.86	□□□□□ -0.35
RUNDC3B-204	ENST00000466676	UNC13B	O14795	1591 aa		12.86	□□□□□ -0.35
RUNDC3B-204	ENST00000466676	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	12.85	□□□□□ -0.35

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.1 ms