RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455953.1

NCBP2-208, Transcript of nuclear cap binding protein subunit 2, human

TSL 5

Gene NCBP2, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NCBP2-208	ENST00000455953	ATP10A	O60312	1499 aa		11.33	□□□□□ -0.6
NCBP2-208	ENST00000455953	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		11.33	□□□□□ -0.6
NCBP2-208	ENST00000455953	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		11.32	□□□□□ -0.6
NCBP2-208	ENST00000455953	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
NCBP2-208	ENST00000455953	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		11.3	□□□□□ -0.6
NCBP2-208	ENST00000455953	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		11.3	□□□□□ -0.6
NCBP2-208	ENST00000455953	KDM5C	P41229	1560 aa		11.3	□□□□□ -0.6
NCBP2-208	ENST00000455953	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		11.3	□□□□□ -0.6
NCBP2-208	ENST00000455953	ABCC1	P33527	1531 aa		11.3	□□□□□ -0.6
NCBP2-208	ENST00000455953	ST18	O60284	1047 aa		11.29	□□□□□ -0.6
NCBP2-208	ENST00000455953	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
NCBP2-208	ENST00000455953	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
NCBP2-208	ENST00000455953	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		11.28	□□□□□ -0.6
NCBP2-208	ENST00000455953	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
NCBP2-208	ENST00000455953	AFAP1	Q8N556	730 aa		11.27	□□□□□ -0.61
NCBP2-208	ENST00000455953	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		11.27	□□□□□ -0.61
NCBP2-208	ENST00000455953	ABCA6	Q8N139	1617 aa		11.27	□□□□□ -0.61
NCBP2-208	ENST00000455953	CEP162	Q5TB80	1403 aa		11.26	□□□□□ -0.61
NCBP2-208	ENST00000455953	RERE	Q9P2R6	1566 aa		11.26	□□□□□ -0.61
NCBP2-208	ENST00000455953	HOXB3	P14651	431 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
NCBP2-208	ENST00000455953	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		11.26	□□□□□ -0.61
NCBP2-208	ENST00000455953	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		11.25	□□□□□ -0.61
NCBP2-208	ENST00000455953	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		11.25	□□□□□ -0.61
NCBP2-208	ENST00000455953	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
NCBP2-208	ENST00000455953	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		11.24	□□□□□ -0.61
NCBP2-208	ENST00000455953	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		11.24	□□□□□ -0.61
NCBP2-208	ENST00000455953	C2orf72	A6NCS6	295 aa		11.24	□□□□□ -0.61
NCBP2-208	ENST00000455953	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		11.24	□□□□□ -0.61
NCBP2-208	ENST00000455953	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		11.24	□□□□□ -0.61
NCBP2-208	ENST00000455953	POTEM	A6NI47	508 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NCBP2-208	ENST00000455953	KIF3C	O14782	793 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NCBP2-208	ENST00000455953	SNPH	O15079	494 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NCBP2-208	ENST00000455953	POTEG	Q6S5H5	508 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NCBP2-208	ENST00000455953	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NCBP2-208	ENST00000455953	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NCBP2-208	ENST00000455953	C3	P01024	1663 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NCBP2-208	ENST00000455953	ATP7A	Q04656	1500 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NCBP2-208	ENST00000455953	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NCBP2-208	ENST00000455953	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
NCBP2-208	ENST00000455953	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NCBP2-208	ENST00000455953	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
NCBP2-208	ENST00000455953	MROH2A	A6NES4	1674 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NCBP2-208	ENST00000455953	AGL	P35573	1532 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NCBP2-208	ENST00000455953	RYDEN	Q9NUL5	291 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
NCBP2-208	ENST00000455953	TIAM1	Q13009	1591 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NCBP2-208	ENST00000455953	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NCBP2-208	ENST00000455953	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	11.19	□□□□□ -0.62
NCBP2-208	ENST00000455953	HSPA2	P54652	639 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NCBP2-208	ENST00000455953	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
NCBP2-208	ENST00000455953	MARVELD3	Q96A59	401 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NCBP2-208	ENST00000455953	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
NCBP2-208	ENST00000455953	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
NCBP2-208	ENST00000455953	TMC2	Q8TDI7	906 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NCBP2-208	ENST00000455953	FBXO41	Q8TF61	875 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NCBP2-208	ENST00000455953	A2M	P01023	1474 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NCBP2-208	ENST00000455953	TSPY4	P0CV99	314 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NCBP2-208	ENST00000455953	TSPY10	P0CW01	314 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NCBP2-208	ENST00000455953	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NCBP2-208	ENST00000455953	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NCBP2-208	ENST00000455953	NCOA2	Q15596	1464 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NCBP2-208	ENST00000455953	GGT6	Q6P531	493 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NCBP2-208	ENST00000455953	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NCBP2-208	ENST00000455953	DOK7	Q18PE1	504 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NCBP2-208	ENST00000455953	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NCBP2-208	ENST00000455953	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
NCBP2-208	ENST00000455953	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NCBP2-208	ENST00000455953	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NCBP2-208	ENST00000455953	PLXNC1	O60486	1568 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NCBP2-208	ENST00000455953	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		11.1	□□□□□ -0.63
NCBP2-208	ENST00000455953	NPAT	Q14207	1427 aa		11.1	□□□□□ -0.63
NCBP2-208	ENST00000455953	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NCBP2-208	ENST00000455953	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NCBP2-208	ENST00000455953	STRC	Q7RTU9	1775 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NCBP2-208	ENST00000455953	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NCBP2-208	ENST00000455953	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NCBP2-208	ENST00000455953	ZMYM3	Q14202	1370 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NCBP2-208	ENST00000455953	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NCBP2-208	ENST00000455953	DSG2	Q14126	1118 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NCBP2-208	ENST00000455953	CRISPLD2	Q9H0B8	497 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NCBP2-208	ENST00000455953	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
NCBP2-208	ENST00000455953	HOXB1	P14653	301 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
NCBP2-208	ENST00000455953	GPR153	Q6NV75	609 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NCBP2-208	ENST00000455953	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NCBP2-208	ENST00000455953	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	11.08	□□□□□ -0.64
NCBP2-208	ENST00000455953	MAP3K1	Q13233	1512 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NCBP2-208	ENST00000455953	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
NCBP2-208	ENST00000455953	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		11.07	□□□□□ -0.64
NCBP2-208	ENST00000455953	POTEB3	A0JP26	581 aa		11.07	□□□□□ -0.64
NCBP2-208	ENST00000455953	KIF3B	O15066	747 aa		11.07	□□□□□ -0.64
NCBP2-208	ENST00000455953	FOXK1	P85037	733 aa		11.07	□□□□□ -0.64
NCBP2-208	ENST00000455953	POTEB	Q6S5H4	581 aa		11.07	□□□□□ -0.64
NCBP2-208	ENST00000455953	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
NCBP2-208	ENST00000455953	PLPP6	Q8IY26	295 aa		11.07	□□□□□ -0.64
NCBP2-208	ENST00000455953	CERK	Q8TCT0	537 aa		11.07	□□□□□ -0.64
NCBP2-208	ENST00000455953	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
NCBP2-208	ENST00000455953	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		11.07	□□□□□ -0.64
NCBP2-208	ENST00000455953	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		11.07	□□□□□ -0.64
NCBP2-208	ENST00000455953	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
NCBP2-208	ENST00000455953	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		11.06	□□□□□ -0.64
NCBP2-208	ENST00000455953	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64

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