RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa13.64□□□□□ -0.23
EFTUD2-202ENST00000426333 RASSF8Q8NHQ8 419 aa13.64□□□□□ -0.23
EFTUD2-202ENST00000426333 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa13.64□□□□□ -0.23
EFTUD2-202ENST00000426333 TPM3P06753 285 aa13.64□□□□□ -0.23
EFTUD2-202ENST00000426333 NUP155O75694 1391 aa13.64□□□□□ -0.23
EFTUD2-202ENST00000426333 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
EFTUD2-202ENST00000426333 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
EFTUD2-202ENST00000426333 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
EFTUD2-202ENST00000426333 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa13.63□□□□□ -0.23
EFTUD2-202ENST00000426333 CROCC2H7BZ55 1655 aa13.63□□□□□ -0.23
EFTUD2-202ENST00000426333 KIF16BQ96L93 1317 aa13.63□□□□□ -0.23
EFTUD2-202ENST00000426333 DDX11L8A8MPP1 907 aa13.63□□□□□ -0.23
EFTUD2-202ENST00000426333 TAF7LQ5H9L4 462 aa13.63□□□□□ -0.23
EFTUD2-202ENST00000426333 CHMP3Q9Y3E7 222 aa13.63□□□□□ -0.23
EFTUD2-202ENST00000426333 GCC2Q8IWJ2 1684 aa13.63□□□□□ -0.23
EFTUD2-202ENST00000426333 TERF2IPQ9NYB0 399 aa13.63□□□□□ -0.23
EFTUD2-202ENST00000426333 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa13.63□□□□□ -0.23
EFTUD2-202ENST00000426333 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
EFTUD2-202ENST00000426333 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
EFTUD2-202ENST00000426333 L3MBTL2Q969R5 705 aa13.61□□□□□ -0.23
EFTUD2-202ENST00000426333 ABCC2Q92887 1545 aa13.61□□□□□ -0.23
EFTUD2-202ENST00000426333 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
EFTUD2-202ENST00000426333 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
EFTUD2-202ENST00000426333 LMOD3Q0VAK6 560 aa13.61□□□□□ -0.23
EFTUD2-202ENST00000426333 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
EFTUD2-202ENST00000426333 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC146Q8IYE0 955 aa13.6□□□□□ -0.23
EFTUD2-202ENST00000426333 CREBRFQ8IUR6 639 aa13.6□□□□□ -0.23
EFTUD2-202ENST00000426333 MIA2Q96PC5 1412 aa13.59□□□□□ -0.23
EFTUD2-202ENST00000426333 CEP89Q96ST8 783 aa13.59□□□□□ -0.23
EFTUD2-202ENST00000426333 ITSN2Q9NZM3 1697 aa13.59□□□□□ -0.23
EFTUD2-202ENST00000426333 PDE4AP27815 886 aa13.58□□□□□ -0.24
EFTUD2-202ENST00000426333 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa13.58□□□□□ -0.24
EFTUD2-202ENST00000426333 TTC37Q6PGP7 1564 aa13.58□□□□□ -0.24
EFTUD2-202ENST00000426333 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
EFTUD2-202ENST00000426333 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
EFTUD2-202ENST00000426333 RSPH6AQ9H0K4 717 aa13.58□□□□□ -0.24
EFTUD2-202ENST00000426333 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa13.58□□□□□ -0.24
EFTUD2-202ENST00000426333 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM161AQ3B820 660 aa13.58□□□□□ -0.24
EFTUD2-202ENST00000426333 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa13.58□□□□□ -0.24
EFTUD2-202ENST00000426333 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
EFTUD2-202ENST00000426333 TOMM22Q9NS69 142 aa13.58□□□□□ -0.24
EFTUD2-202ENST00000426333 PDE4CQ08493 712 aa13.57□□□□□ -0.24
EFTUD2-202ENST00000426333 UACAQ9BZF9 1416 aa13.57□□□□□ -0.24
EFTUD2-202ENST00000426333 GSE1Q14687 1217 aa13.57□□□□□ -0.24
EFTUD2-202ENST00000426333 PTPRGP23470 1445 aa13.56□□□□□ -0.24
EFTUD2-202ENST00000426333 NAIPQ13075 1403 aa13.56□□□□□ -0.24
EFTUD2-202ENST00000426333 KDM5BQ9UGL1 1544 aa13.56□□□□□ -0.24
EFTUD2-202ENST00000426333 BECN2A8MW95 431 aa13.56□□□□□ -0.24
EFTUD2-202ENST00000426333 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
EFTUD2-202ENST00000426333 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa13.56□□□□□ -0.24
EFTUD2-202ENST00000426333 HFM1A2PYH4 1435 aa13.56□□□□□ -0.24
EFTUD2-202ENST00000426333 PREX2Q70Z35 1606 aa13.56□□□□□ -0.24
EFTUD2-202ENST00000426333 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa13.56□□□□□ -0.24
EFTUD2-202ENST00000426333 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP13.55□□□□□ -0.24
EFTUD2-202ENST00000426333 CHMP4CQ96CF2 233 aa13.54□□□□□ -0.24
EFTUD2-202ENST00000426333 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC4A3P48751 1232 aa13.54□□□□□ -0.24
EFTUD2-202ENST00000426333 PES1O00541 588 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
EFTUD2-202ENST00000426333 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
EFTUD2-202ENST00000426333 H3BQV1 296 aa13.53□□□□□ -0.24
EFTUD2-202ENST00000426333 IFFO2Q5TF58 517 aa13.53□□□□□ -0.24
EFTUD2-202ENST00000426333 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa13.53□□□□□ -0.24
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM184AQ8NB25 1140 aa13.53□□□□□ -0.24
EFTUD2-202ENST00000426333 ABCC5O15440 1437 aa13.53□□□□□ -0.24
EFTUD2-202ENST00000426333 KIF3BO15066 747 aa13.52□□□□□ -0.24
EFTUD2-202ENST00000426333 ANKRD45Q5TZF3 282 aa13.52□□□□□ -0.24
EFTUD2-202ENST00000426333 CGNL1Q0VF96 1302 aa13.52□□□□□ -0.24
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.24
EFTUD2-202ENST00000426333 MARCH6O60337 910 aa13.52□□□□□ -0.24
EFTUD2-202ENST00000426333 AMPHP49418 695 aa13.52□□□□□ -0.24
EFTUD2-202ENST00000426333 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.24
EFTUD2-202ENST00000426333 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa13.52□□□□□ -0.25
EFTUD2-202ENST00000426333 VSIG10Q8N0Z9 540 aa13.52□□□□□ -0.25
EFTUD2-202ENST00000426333 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
EFTUD2-202ENST00000426333 BCL2L13Q9BXK5 485 aa13.52□□□□□ -0.25
EFTUD2-202ENST00000426333 RILPL2Q969X0 211 aa13.52□□□□□ -0.25
EFTUD2-202ENST00000426333 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
EFTUD2-202ENST00000426333 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
EFTUD2-202ENST00000426333 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
EFTUD2-202ENST00000426333 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
EFTUD2-202ENST00000426333 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
EFTUD2-202ENST00000426333 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
EFTUD2-202ENST00000426333 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa13.51□□□□□ -0.25
EFTUD2-202ENST00000426333 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
EFTUD2-202ENST00000426333 ADGBQ8N7X0 1667 aa13.51□□□□□ -0.25
EFTUD2-202ENST00000426333 PRM3Q9NNZ6 103 aa13.51□□□□□ -0.25
EFTUD2-202ENST00000426333 DAPK1P53355 1430 aa13.5□□□□□ -0.25
EFTUD2-202ENST00000426333 AKNAQ7Z591 1439 aa13.5□□□□□ -0.25
EFTUD2-202ENST00000426333 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
EFTUD2-202ENST00000426333 GPS2Q13227 327 aa13.5□□□□□ -0.25
EFTUD2-202ENST00000426333 TPM1P09493 284 aa13.5□□□□□ -0.25
EFTUD2-202ENST00000426333 TRHP20396 242 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
EFTUD2-202ENST00000426333 KIF15Q9NS87 1388 aa13.49□□□□□ -0.25
EFTUD2-202ENST00000426333 EXOC6Q8TAG9 804 aa13.49□□□□□ -0.25
EFTUD2-202ENST00000426333 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
EFTUD2-202ENST00000426333 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa13.49□□□□□ -0.25
EFTUD2-202ENST00000426333 MBD5Q9P267 1494 aa13.49□□□□□ -0.25
EFTUD2-202ENST00000426333 E9PSI1 815 aa13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.1 ms