RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419302.1

PDCL2P1-201, Transcript of phosducin-like 2 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PDCL2P1, Length 352 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2P1-201ENST00000419302 PRKD2Q9BZL6 878 aa8.51□□□□□ -1.05
PDCL2P1-201ENST00000419302 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PDCL2P1-201ENST00000419302 LAPTM4AQ15012 233 aa8.5□□□□□ -1.05
PDCL2P1-201ENST00000419302 SMYD5Q6GMV2 418 aa8.5□□□□□ -1.05
PDCL2P1-201ENST00000419302 TMEM134Q9H6X4 195 aa8.5□□□□□ -1.05
PDCL2P1-201ENST00000419302 RCCD1A6NED2 376 aa8.49□□□□□ -1.05
PDCL2P1-201ENST00000419302 KMT5BQ4FZB7 885 aa8.49□□□□□ -1.05
PDCL2P1-201ENST00000419302 NKX2-3Q8TAU0 364 aa8.49□□□□□ -1.05
PDCL2P1-201ENST00000419302 ZPR1O75312 459 aa8.48□□□□□ -1.05
PDCL2P1-201ENST00000419302 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PDCL2P1-201ENST00000419302 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
PDCL2P1-201ENST00000419302 OATP04181 439 aa8.46□□□□□ -1.06
PDCL2P1-201ENST00000419302 CFHP08603 1231 aa8.46□□□□□ -1.06
PDCL2P1-201ENST00000419302 HIC1Q14526 733 aa8.46□□□□□ -1.06
PDCL2P1-201ENST00000419302 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa8.46□□□□□ -1.06
PDCL2P1-201ENST00000419302 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
PDCL2P1-201ENST00000419302 V9GY48 417 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
PDCL2P1-201ENST00000419302 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
PDCL2P1-201ENST00000419302 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
PDCL2P1-201ENST00000419302 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
PDCL2P1-201ENST00000419302 RSPH4AQ5TD94 716 aa8.43□□□□□ -1.06
PDCL2P1-201ENST00000419302 PXYLP1Q8TE99 480 aa8.43□□□□□ -1.06
PDCL2P1-201ENST00000419302 TMUB1Q9BVT8 246 aa8.43□□□□□ -1.06
PDCL2P1-201ENST00000419302 TLL1O43897 1013 aa8.41□□□□□ -1.06
PDCL2P1-201ENST00000419302 GNPATO15228 680 aa8.4□□□□□ -1.06
PDCL2P1-201ENST00000419302 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
PDCL2P1-201ENST00000419302 NR1I2O75469 434 aa8.39□□□□□ -1.07
PDCL2P1-201ENST00000419302 SLC10A3P09131 477 aa8.39□□□□□ -1.07
PDCL2P1-201ENST00000419302 RNF223E7ERA6 249 aa8.38□□□□□ -1.07
PDCL2P1-201ENST00000419302 RDH13Q8NBN7 331 aa8.38□□□□□ -1.07
PDCL2P1-201ENST00000419302 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa8.38□□□□□ -1.07
PDCL2P1-201ENST00000419302 FECHP22830 423 aa8.37□□□□□ -1.07
PDCL2P1-201ENST00000419302 ZNF787Q6DD87 383 aa8.37□□□□□ -1.07
PDCL2P1-201ENST00000419302 S1PR4O95977 384 aa8.36□□□□□ -1.07
PDCL2P1-201ENST00000419302 ADH1BP00325 375 aa8.36□□□□□ -1.07
PDCL2P1-201ENST00000419302 GPIHBP1Q8IV16 184 aa8.36□□□□□ -1.07
PDCL2P1-201ENST00000419302 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
PDCL2P1-201ENST00000419302 SLC19A1P41440 591 aa8.35□□□□□ -1.07
PDCL2P1-201ENST00000419302 DDX11L8A8MPP1 907 aa8.34□□□□□ -1.07
PDCL2P1-201ENST00000419302 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
PDCL2P1-201ENST00000419302 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PDCL2P1-201ENST00000419302 ANKLE1Q8NAG6 615 aa8.34□□□□□ -1.07
PDCL2P1-201ENST00000419302 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
PDCL2P1-201ENST00000419302 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
PDCL2P1-201ENST00000419302 SLC6A16Q9GZN6 736 aa8.33□□□□□ -1.08
PDCL2P1-201ENST00000419302 GPR37O15354 613 aa8.32□□□□□ -1.08
PDCL2P1-201ENST00000419302 SULF1Q8IWU6 871 aa8.32□□□□□ -1.08
PDCL2P1-201ENST00000419302 SCUBE3Q8IX30 993 aa8.32□□□□□ -1.08
PDCL2P1-201ENST00000419302 NLRP7Q8WX94 980 aa8.32□□□□□ -1.08
PDCL2P1-201ENST00000419302 SPSB2Q99619 263 aa8.31□□□□□ -1.08
PDCL2P1-201ENST00000419302 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa8.31□□□□□ -1.08
PDCL2P1-201ENST00000419302 FUT2Q10981 343 aa8.29□□□□□ -1.08
PDCL2P1-201ENST00000419302 SPRYD7Q5W111 196 aa8.29□□□□□ -1.08
PDCL2P1-201ENST00000419302 TRIM67Q6ZTA4 783 aa8.29□□□□□ -1.08
PDCL2P1-201ENST00000419302 ZNF697Q5TEC3 545 aa8.28□□□□□ -1.08
PDCL2P1-201ENST00000419302 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
PDCL2P1-201ENST00000419302 ATP6V1AP38606 617 aa8.27□□□□□ -1.09
PDCL2P1-201ENST00000419302 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
PDCL2P1-201ENST00000419302 GCGRP47871 477 aa8.26□□□□□ -1.09
PDCL2P1-201ENST00000419302 PKDCCQ504Y2 493 aa8.26□□□□□ -1.09
PDCL2P1-201ENST00000419302 MORN1Q5T089 497 aa8.26□□□□□ -1.09
PDCL2P1-201ENST00000419302 LIAT1Q6ZQX7 453 aa8.26□□□□□ -1.09
PDCL2P1-201ENST00000419302 VSIG10Q8N0Z9 540 aa8.26□□□□□ -1.09
PDCL2P1-201ENST00000419302 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PDCL2P1-201ENST00000419302 GRIPAP1Q4V328 841 aa8.25□□□□□ -1.09
PDCL2P1-201ENST00000419302 PHOX2BQ99453 314 aa8.25□□□□□ -1.09
PDCL2P1-201ENST00000419302 POTECB2RU33 542 aa8.24□□□□□ -1.09
PDCL2P1-201ENST00000419302 TNFRSF10AO00220 468 aa8.23□□□□□ -1.09
PDCL2P1-201ENST00000419302 PRR20EP86478 221 aa8.23□□□□□ -1.09
PDCL2P1-201ENST00000419302 PRR20CP86479 221 aa8.23□□□□□ -1.09
PDCL2P1-201ENST00000419302 PRR20DP86480 221 aa8.23□□□□□ -1.09
PDCL2P1-201ENST00000419302 PRR20BP86481 221 aa8.23□□□□□ -1.09
PDCL2P1-201ENST00000419302 PRR20AP86496 221 aa8.23□□□□□ -1.09
PDCL2P1-201ENST00000419302 MAP2K5Q13163 448 aa8.23□□□□□ -1.09
PDCL2P1-201ENST00000419302 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa8.23□□□□□ -1.09
PDCL2P1-201ENST00000419302 PLA2G2CQ5R387 149 aa8.22□□□□□ -1.09
PDCL2P1-201ENST00000419302 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
PDCL2P1-201ENST00000419302 FAM187AA6NFU0 413 aa8.21□□□□□ -1.1
PDCL2P1-201ENST00000419302 MYT1Q01538 1121 aa8.21□□□□□ -1.1
PDCL2P1-201ENST00000419302 DGAT1O75907 488 aa8.2□□□□□ -1.1
PDCL2P1-201ENST00000419302 FOXC1Q12948 553 aa8.2□□□□□ -1.1
PDCL2P1-201ENST00000419302 THAP11Q96EK4 314 aa8.2□□□□□ -1.1
PDCL2P1-201ENST00000419302 Q3C1V9 767 aa8.19□□□□□ -1.1
PDCL2P1-201ENST00000419302 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
PDCL2P1-201ENST00000419302 IRF6O14896 467 aa8.18□□□□□ -1.1
PDCL2P1-201ENST00000419302 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
PDCL2P1-201ENST00000419302 GDF9O60383 454 aa8.18□□□□□ -1.1
PDCL2P1-201ENST00000419302 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
PDCL2P1-201ENST00000419302 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
PDCL2P1-201ENST00000419302 BRICD5Q6PL45 260 aa8.18□□□□□ -1.1
PDCL2P1-201ENST00000419302 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
PDCL2P1-201ENST00000419302 PRDM9Q9NQV7 894 aa8.18□□□□□ -1.1
PDCL2P1-201ENST00000419302 CD46P15529 392 aa8.17□□□□□ -1.1
PDCL2P1-201ENST00000419302 RPIAP49247 311 aa8.17□□□□□ -1.1
PDCL2P1-201ENST00000419302 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa8.17□□□□□ -1.1
PDCL2P1-201ENST00000419302 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
PDCL2P1-201ENST00000419302 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
PDCL2P1-201ENST00000419302 KDM4AO75164 1064 aa8.16□□□□□ -1.1
PDCL2P1-201ENST00000419302 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
PDCL2P1-201ENST00000419302 MSS51Q4VC12 460 aa8.15□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.6 ms