RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381223.9

ZBED1-203, Transcript of zinc finger BED-type containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ZBED1, Length 4,510 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1-203ENST00000381223 ROCK1Q13464 1354 aa18.37■□□□□ 0.53
ZBED1-203ENST00000381223 BCAR3O75815 825 aa18.37■□□□□ 0.53
ZBED1-203ENST00000381223 TCP11L2Q8N4U5 519 aa18.37■□□□□ 0.53
ZBED1-203ENST00000381223 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa18.37■□□□□ 0.53
ZBED1-203ENST00000381223 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
ZBED1-203ENST00000381223 FAM161AQ3B820 660 aa18.36■□□□□ 0.53
ZBED1-203ENST00000381223 GRIN2AQ12879 1464 aa18.35■□□□□ 0.53
ZBED1-203ENST00000381223 AMPHP49418 695 aa18.35■□□□□ 0.53
ZBED1-203ENST00000381223 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa18.35■□□□□ 0.53
ZBED1-203ENST00000381223 CUL7Q14999 1698 aa18.34■□□□□ 0.53
ZBED1-203ENST00000381223 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
ZBED1-203ENST00000381223 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
ZBED1-203ENST00000381223 RUNDC1Q96C34 613 aa18.33■□□□□ 0.53
ZBED1-203ENST00000381223 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
ZBED1-203ENST00000381223 COG3Q96JB2 828 aa18.32■□□□□ 0.52
ZBED1-203ENST00000381223 ANKRD45Q5TZF3 282 aa18.31■□□□□ 0.52
ZBED1-203ENST00000381223 NECTIN2Q92692 538 aa18.31■□□□□ 0.52
ZBED1-203ENST00000381223 KCNJ4P48050 445 aa18.31■□□□□ 0.52
ZBED1-203ENST00000381223 EID1Q9Y6B2 187 aa18.31■□□□□ 0.52
ZBED1-203ENST00000381223 PLCB2Q00722 1185 aa18.3■□□□□ 0.52
ZBED1-203ENST00000381223 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
ZBED1-203ENST00000381223 PRAM1Q96QH2 718 aa18.29■□□□□ 0.52
ZBED1-203ENST00000381223 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
ZBED1-203ENST00000381223 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
ZBED1-203ENST00000381223 STK31Q9BXU1 1019 aa18.28■□□□□ 0.52
ZBED1-203ENST00000381223 ERBINQ96RT1 1412 aa18.28■□□□□ 0.52
ZBED1-203ENST00000381223 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
ZBED1-203ENST00000381223 NUTM2GQ5VZR2 741 aa18.27■□□□□ 0.51
ZBED1-203ENST00000381223 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
ZBED1-203ENST00000381223 C20orf194Q5TEA3 1177 aa18.26■□□□□ 0.51
ZBED1-203ENST00000381223 STAC3Q96MF2 364 aa18.24■□□□□ 0.51
ZBED1-203ENST00000381223 LNPKQ9C0E8 428 aa18.24■□□□□ 0.51
ZBED1-203ENST00000381223 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa18.24■□□□□ 0.51
ZBED1-203ENST00000381223 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
ZBED1-203ENST00000381223 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
ZBED1-203ENST00000381223 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa18.23■□□□□ 0.51
ZBED1-203ENST00000381223 CABP1Q9NZU7 370 aa18.22■□□□□ 0.51
ZBED1-203ENST00000381223 CCDC141Q6ZP82 1450 aa18.22■□□□□ 0.51
ZBED1-203ENST00000381223 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa18.22■□□□□ 0.51
ZBED1-203ENST00000381223 PTMAP06454 111 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
ZBED1-203ENST00000381223 TXNDC2Q86VQ3 553 aa18.22■□□□□ 0.51
ZBED1-203ENST00000381223 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa18.22■□□□□ 0.51
ZBED1-203ENST00000381223 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
ZBED1-203ENST00000381223 FGD1P98174 961 aa18.22■□□□□ 0.51
ZBED1-203ENST00000381223 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
ZBED1-203ENST00000381223 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
ZBED1-203ENST00000381223 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
ZBED1-203ENST00000381223 LMOD3Q0VAK6 560 aa18.2■□□□□ 0.5
ZBED1-203ENST00000381223 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
ZBED1-203ENST00000381223 PRKAR2BP31323 418 aa18.19■□□□□ 0.5
ZBED1-203ENST00000381223 MSH5O43196 834 aa18.19■□□□□ 0.5
ZBED1-203ENST00000381223 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
ZBED1-203ENST00000381223 UGGT2Q9NYU1 1516 aa18.17■□□□□ 0.5
ZBED1-203ENST00000381223 DDX19BQ9UMR2 479 aa18.17■□□□□ 0.5
ZBED1-203ENST00000381223 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
ZBED1-203ENST00000381223 DISP3Q9P2K9 1392 aa18.16■□□□□ 0.5
ZBED1-203ENST00000381223 C1orf115Q9H7X2 142 aa18.16■□□□□ 0.5
ZBED1-203ENST00000381223 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
ZBED1-203ENST00000381223 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
ZBED1-203ENST00000381223 CDK19Q9BWU1 502 aa18.15■□□□□ 0.5
ZBED1-203ENST00000381223 ATP10BO94823 1461 aa18.14■□□□□ 0.49
ZBED1-203ENST00000381223 RILPL2Q969X0 211 aa18.13■□□□□ 0.49
ZBED1-203ENST00000381223 HMMRO75330 724 aa18.13■□□□□ 0.49
ZBED1-203ENST00000381223 MCCP23508 829 aa18.13■□□□□ 0.49
ZBED1-203ENST00000381223 WAPLQ7Z5K2 1190 aa18.12■□□□□ 0.49
ZBED1-203ENST00000381223 BACH2Q9BYV9 841 aa18.12■□□□□ 0.49
ZBED1-203ENST00000381223 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
ZBED1-203ENST00000381223 SLC26A8Q96RN1 970 aa18.12■□□□□ 0.49
ZBED1-203ENST00000381223 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
ZBED1-203ENST00000381223 NGEFQ8N5V2 710 aa18.12■□□□□ 0.49
ZBED1-203ENST00000381223 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
ZBED1-203ENST00000381223 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
ZBED1-203ENST00000381223 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa18.11■□□□□ 0.49
ZBED1-203ENST00000381223 WWC1Q8IX03 1113 aa18.11■□□□□ 0.49
ZBED1-203ENST00000381223 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
ZBED1-203ENST00000381223 CHMP3Q9Y3E7 222 aa18.11■□□□□ 0.49
ZBED1-203ENST00000381223 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa18.11■□□□□ 0.49
ZBED1-203ENST00000381223 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
ZBED1-203ENST00000381223 SLFN5Q08AF3 891 aa18.1■□□□□ 0.49
ZBED1-203ENST00000381223 GBP4Q96PP9 640 aa18.1■□□□□ 0.49
ZBED1-203ENST00000381223 FBLN1P23142 703 aa18.1■□□□□ 0.49
ZBED1-203ENST00000381223 ZNF428Q96B54 188 aa18.09■□□□□ 0.49
ZBED1-203ENST00000381223 NSD3Q9BZ95 1437 aa18.09■□□□□ 0.49
ZBED1-203ENST00000381223 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
ZBED1-203ENST00000381223 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.49
ZBED1-203ENST00000381223 NLRP6P59044 892 aa18.08■□□□□ 0.48
ZBED1-203ENST00000381223 IDI1Q13907 227 aa18.08■□□□□ 0.48
ZBED1-203ENST00000381223 GSE1Q14687 1217 aa18.08■□□□□ 0.48
ZBED1-203ENST00000381223 NFKBIBQ15653 356 aa18.08■□□□□ 0.48
ZBED1-203ENST00000381223 KIF14Q15058 1648 aa18.08■□□□□ 0.48
ZBED1-203ENST00000381223 GNAI1P63096 354 aa18.07■□□□□ 0.48
ZBED1-203ENST00000381223 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
ZBED1-203ENST00000381223 TSPYL4Q9UJ04 414 aa18.06■□□□□ 0.48
ZBED1-203ENST00000381223 TEFQ10587 303 aa18.06■□□□□ 0.48
ZBED1-203ENST00000381223 KIF16BQ96L93 1317 aa18.05■□□□□ 0.48
ZBED1-203ENST00000381223 SLC52A1Q9NWF4 448 aa18.05■□□□□ 0.48
ZBED1-203ENST00000381223 SULT6B1Q6IMI4 303 aa18.05■□□□□ 0.48
ZBED1-203ENST00000381223 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa18.04■□□□□ 0.48
ZBED1-203ENST00000381223 PDE3AQ14432 1141 aa18.04■□□□□ 0.48
ZBED1-203ENST00000381223 C22orf23Q9BZE7 217 aa18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.4 ms