RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362861.1

RNU6-1079P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1079, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1079P, Length 110 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZFP64Q9NPA5 681 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SVOPQ8N4V2 548 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TBC1D12O60347 775 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ARTNQ5T4W7 220 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PROM2Q8N271 834 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MS4A4AQ96JQ5 239 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FMNL2Q96PY5 1086 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SOX12O15370 315 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PROX2Q3B8N5 592 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LCE4AQ5TA78 99 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MCTP1Q6DN14 999 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ARHGEF15O94989 841 aa2.52□□□□□ -2.01
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PHF20L1A8MW92 1017 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ITGB7P26010 798 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TMC2Q8TDI7 906 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FOSBP53539 338 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GSE1Q14687 1217 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KIAA1468Q9P260 1216 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZPR1O75312 459 aa2.48□□□□□ -2.01
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RGS19P49795 217 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-1079P-201ENST00000362861 JAG1P78504 1218 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZDHHC16Q969W1 377 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SMPD1P17405 629 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-1079P-201ENST00000362861 COL9A1P20849 921 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-1079P-201ENST00000362861 COPS2P61201 443 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KRT76Q01546 638 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ADAM33Q9BZ11 813 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SEMA6BQ9H3T3 888 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP2.44□□□□□ -2.02
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP2.44□□□□□ -2.02
RNU6-1079P-201ENST00000362861 JPH4Q96JJ6 628 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PHF8Q9UPP1 1060 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-1079P-201ENST00000362861 APLP1P51693 650 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-1079P-201ENST00000362861 WHAMMQ8TF30 809 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-1079P-201ENST00000362861 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP2.43□□□□□ -2.02
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PSPNO60542 156 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-1079P-201ENST00000362861 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP2.42□□□□□ -2.02
RNU6-1079P-201ENST00000362861 S1PR4O95977 384 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RPIAP49247 311 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PLA2G2CQ5R387 149 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PODNQ7Z5L7 613 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP2.41□□□□□ -2.02
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MAP3K10Q02779 954 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HPS1Q92902 700 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-1079P-201ENST00000362861 BMP1P13497 986 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TRIM46Q7Z4K8 759 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NECTIN2Q92692 538 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ENAMQ9NRM1 1142 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KRBA1A5PL33 1030 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SAMD7Q7Z3H4 446 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
RNU6-1079P-201ENST00000362861 J3QL48 77 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PPFIA3O75145 1194 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NLRP6P59044 892 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LRP8Q14114 963 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-1079P-201ENST00000362861 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP2.37□□□□□ -2.03
RNU6-1079P-201ENST00000362861 WDR26Q9H7D7 661 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PLPP6Q8IY26 295 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FOXK1P85037 733 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZFP42Q96MM3 310 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RNF114Q9Y508 228 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TLL1O43897 1013 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-1079P-201ENST00000362861 WNT7AO00755 349 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RNF40O75150 1001 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FBLN7Q53RD9 439 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LYPD4Q6UWN0 246 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 OXER1Q8TDS5 423 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RNFT1Q5M7Z0 435 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FBXO22Q8NEZ5 403 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DOC2BQ14184 412 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PACS2Q86VP3 889 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PRR14Q9BWN1 585 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SLC6A16Q9GZN6 736 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SOBPA7XYQ1 873 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ADH1BP00325 375 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HDGFP51858 240 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
RNU6-1079P-201ENST00000362861 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa2.29□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85.1 ms