RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356128.4

TRAPPC3L-201, Transcript of trafficking protein particle complex 3 like, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3L, Length 2,421 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PLSCR2Q9NRY7 297 aa9.46□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NUTM2FA1L443 756 aa9.46□□□□□ -0.9
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
TRAPPC3L-201ENST00000356128 OXER1Q8TDS5 423 aa9.46□□□□□ -0.9
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KCNH8Q96L42 1107 aa9.46□□□□□ -0.9
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PLEKHD1A6NEE1 506 aa9.45□□□□□ -0.9
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ADCY10Q96PN6 1610 aa9.44□□□□□ -0.9
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TIAM1Q13009 1591 aa9.44□□□□□ -0.9
TRAPPC3L-201ENST00000356128 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa9.44□□□□□ -0.9
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HECW1Q76N89 1606 aa9.43□□□□□ -0.9
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZRANB1Q9UGI0 708 aa9.43□□□□□ -0.9
TRAPPC3L-201ENST00000356128 UACAQ9BZF9 1416 aa9.43□□□□□ -0.9
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa9.43□□□□□ -0.9
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GRXCR2A6NFK2 248 aa9.42□□□□□ -0.9
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GNPATO15228 680 aa9.42□□□□□ -0.9
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CD44P16070 742 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CCDC18Q5T9S5 1454 aa9.41□□□□□ -0.9
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TSPOAP1O95153 1857 aa9.41□□□□□ -0.9
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
TRAPPC3L-201ENST00000356128 COG6Q9Y2V7 657 aa9.41□□□□□ -0.9
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.91
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DSG2Q14126 1118 aa9.4□□□□□ -0.91
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SH3D19Q5HYK7 790 aa9.39□□□□□ -0.91
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PHLDB1Q86UU1 1377 aa9.39□□□□□ -0.91
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ATP10BO94823 1461 aa9.39□□□□□ -0.91
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KIF13AQ9H1H9 1805 aa9.39□□□□□ -0.91
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FAM69CQ0P6D2 419 aa9.39□□□□□ -0.91
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FBXW7Q969H0 707 aa9.39□□□□□ -0.91
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ABCA8O94911 1581 aa9.38□□□□□ -0.91
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa9.37□□□□□ -0.91
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MAP3K1Q13233 1512 aa9.37□□□□□ -0.91
TRAPPC3L-201ENST00000356128 OSBPP22059 807 aa9.37□□□□□ -0.91
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CFAP43Q8NDM7 1665 aa9.36□□□□□ -0.91
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CCNB3Q8WWL7 1395 aa9.36□□□□□ -0.91
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa9.36□□□□□ -0.91
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NCOA2Q15596 1464 aa9.36□□□□□ -0.91
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ABCC2Q92887 1545 aa9.35□□□□□ -0.91
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MS4A3Q96HJ5 214 aa9.35□□□□□ -0.91
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HIC1Q14526 733 aa9.35□□□□□ -0.91
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SNRKQ9NRH2 765 aa9.35□□□□□ -0.91
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
TRAPPC3L-201ENST00000356128 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa9.34□□□□□ -0.91
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CHIC2Q9UKJ5 165 aa9.34□□□□□ -0.91
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CARNS1A5YM72 827 aa9.33□□□□□ -0.92
TRAPPC3L-201ENST00000356128 POLR3EQ9NVU0 708 aa9.33□□□□□ -0.92
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PHOX2BQ99453 314 aa9.32□□□□□ -0.92
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TMEM106CQ9BVX2 250 aa9.32□□□□□ -0.92
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MYOM3Q5VTT5 1437 aa9.31□□□□□ -0.92
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TMUB1Q9BVT8 246 aa9.31□□□□□ -0.92
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ASXL2Q76L83 1435 aa9.31□□□□□ -0.92
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
TRAPPC3L-201ENST00000356128 E9PSI1 815 aa9.3□□□□□ -0.92
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FGD6Q6ZV73 1430 aa9.3□□□□□ -0.92
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FCHSD2O94868 740 aa9.3□□□□□ -0.92
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DIP2BQ9P265 1576 aa9.3□□□□□ -0.92
TRAPPC3L-201ENST00000356128 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa9.29□□□□□ -0.92
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KIF14Q15058 1648 aa9.29□□□□□ -0.92
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP9.29□□□□□ -0.92
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MYT1LQ9UL68 1186 aa9.29□□□□□ -0.92
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KDM5BQ9UGL1 1544 aa9.28□□□□□ -0.92
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PTGDRQ13258 359 aa9.28□□□□□ -0.92
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DDX12PQ92771 950 aa9.28□□□□□ -0.92
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ABCC10Q5T3U5 1492 aa9.28□□□□□ -0.92
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SPDYE5A6NIY4 337 aa9.27□□□□□ -0.92
TRAPPC3L-201ENST00000356128 C19orf67A6NJJ6 358 aa9.27□□□□□ -0.92
TRAPPC3L-201ENST00000356128 POM121CA8CG34 1229 aa9.27□□□□□ -0.92
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP9.27□□□□□ -0.92
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa9.27□□□□□ -0.92
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GDPD2Q9HCC8 539 aa9.26□□□□□ -0.93
TRAPPC3L-201ENST00000356128 EVX2Q03828 476 aa9.26□□□□□ -0.93
TRAPPC3L-201ENST00000356128 BEGAINQ9BUH8 593 aa9.25□□□□□ -0.93
TRAPPC3L-201ENST00000356128 WDR7Q9Y4E6 1490 aa9.25□□□□□ -0.93
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MAPKBP1O60336 1514 aa9.25□□□□□ -0.93
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TTLL13PA6NNM8 815 aa9.25□□□□□ -0.93
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NLRP7Q8WX94 980 aa9.25□□□□□ -0.93
TRAPPC3L-201ENST00000356128 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa9.24□□□□□ -0.93
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
TRAPPC3L-201ENST00000356128 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TSPY4P0CV99 314 aa9.23□□□□□ -0.93
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TSPY10P0CW01 314 aa9.23□□□□□ -0.93
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FOXK1P85037 733 aa9.23□□□□□ -0.93
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DPY19L2Q6NUT2 758 aa9.23□□□□□ -0.93
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