RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000351328.7

CS-201, Transcript of citrate synthase, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 2,975 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-201ENST00000351328 PIK3C2BO00750 1634 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-201ENST00000351328 TAF7LQ5H9L4 462 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-201ENST00000351328 UGGT1Q9NYU2 1555 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-201ENST00000351328 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-201ENST00000351328 CLTCL1P53675 1640 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-201ENST00000351328 STAG3Q9UJ98 1225 aa9.81□□□□□ -0.84
CS-201ENST00000351328 A2ML1A8K2U0 1454 aa9.81□□□□□ -0.84
CS-201ENST00000351328 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
CS-201ENST00000351328 SIN3AQ96ST3 1273 aa9.81□□□□□ -0.84
CS-201ENST00000351328 MYO3AQ8NEV4 1616 aa9.81□□□□□ -0.84
CS-201ENST00000351328 CHGAP10645 457 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
CS-201ENST00000351328 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
CS-201ENST00000351328 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
CS-201ENST00000351328 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
CS-201ENST00000351328 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-201ENST00000351328 KIF1BO60333 1816 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-201ENST00000351328 NEURL4Q96JN8 1562 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-201ENST00000351328 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
CS-201ENST00000351328 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-201ENST00000351328 ADGRB3O60242 1522 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-201ENST00000351328 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-201ENST00000351328 FGD1P98174 961 aa9.78□□□□□ -0.84
CS-201ENST00000351328 UBR1Q8IWV7 1749 aa9.78□□□□□ -0.84
CS-201ENST00000351328 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa9.77□□□□□ -0.84
CS-201ENST00000351328 RGL3Q3MIN7 710 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-201ENST00000351328 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
CS-201ENST00000351328 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
CS-201ENST00000351328 LMTK3Q96Q04 1460 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-201ENST00000351328 HDGFP51858 240 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
CS-201ENST00000351328 TMEM2Q9UHN6 1383 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-201ENST00000351328 STAC3Q96MF2 364 aa9.75□□□□□ -0.85
CS-201ENST00000351328 MYO5BQ9ULV0 1848 aa9.75□□□□□ -0.85
CS-201ENST00000351328 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP9.75□□□□□ -0.85
CS-201ENST00000351328 ARHGAP23Q9P227 1491 aa9.75□□□□□ -0.85
CS-201ENST00000351328 SLIT1O75093 1534 aa9.75□□□□□ -0.85
CS-201ENST00000351328 EID1Q9Y6B2 187 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-201ENST00000351328 RIMS2Q9UQ26 1411 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-201ENST00000351328 VGFO15240 615 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
CS-201ENST00000351328 ANKLE2Q86XL3 938 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-201ENST00000351328 L3MBTL2Q969R5 705 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-201ENST00000351328 TONSLQ96HA7 1378 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-201ENST00000351328 ZFYVE9O95405 1425 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-201ENST00000351328 HSPA2P54652 639 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-201ENST00000351328 TXNDC2Q86VQ3 553 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-201ENST00000351328 DCAF11Q8TEB1 546 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-201ENST00000351328 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-201ENST00000351328 LTKP29376 864 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-201ENST00000351328 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
CS-201ENST00000351328 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.85
CS-201ENST00000351328 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.85
CS-201ENST00000351328 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa9.71□□□□□ -0.85
CS-201ENST00000351328 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
CS-201ENST00000351328 PPLO60437 1756 aa9.71□□□□□ -0.86
CS-201ENST00000351328 IFT172Q9UG01 1749 aa9.7□□□□□ -0.86
CS-201ENST00000351328 MYOM2P54296 1465 aa9.7□□□□□ -0.86
CS-201ENST00000351328 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa9.7□□□□□ -0.86
CS-201ENST00000351328 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa9.7□□□□□ -0.86
CS-201ENST00000351328 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa9.69□□□□□ -0.86
CS-201ENST00000351328 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa9.69□□□□□ -0.86
CS-201ENST00000351328 FBXO3Q9UK99 471 aa9.69□□□□□ -0.86
CS-201ENST00000351328 MED14O60244 1454 aa9.69□□□□□ -0.86
CS-201ENST00000351328 NRXN1Q9ULB1 1477 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-201ENST00000351328 BRD2P25440 801 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
CS-201ENST00000351328 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
CS-201ENST00000351328 BCANQ96GW7 911 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-201ENST00000351328 PIK3C2GO75747 1445 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-201ENST00000351328 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
CS-201ENST00000351328 DMRT2Q9Y5R5 561 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-201ENST00000351328 STRCQ7RTU9 1775 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-201ENST00000351328 PRAG1Q86YV5 1406 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-201ENST00000351328 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
CS-201ENST00000351328 TBX22Q9Y458 520 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-201ENST00000351328 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-201ENST00000351328 NBPF8Q3BBV2 869 aa9.65□□□□□ -0.87
CS-201ENST00000351328 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-201ENST00000351328 CFAP70Q5T0N1 1121 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-201ENST00000351328 IQGAP1P46940 1657 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-201ENST00000351328 AAMPQ13685 434 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-201ENST00000351328 SLC26A8Q96RN1 970 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-201ENST00000351328 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
CS-201ENST00000351328 ALKQ9UM73 1620 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-201ENST00000351328 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-201ENST00000351328 DIP2AQ14689 1571 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-201ENST00000351328 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
CS-201ENST00000351328 TAOK2Q9UL54 1235 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-201ENST00000351328 PIK3R4Q99570 1358 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-201ENST00000351328 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-201ENST00000351328 LAMC1P11047 1609 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-201ENST00000351328 CCDC136Q96JN2 1154 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-201ENST00000351328 METP08581 1390 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-201ENST00000351328 NBPF1Q3BBV0 1214 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-201ENST00000351328 RSPH6AQ9H0K4 717 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-201ENST00000351328 TMEM132EQ6IEE7 984 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-201ENST00000351328 RALGAPBQ86X10 1494 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-201ENST00000351328 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CS-201ENST00000351328 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CS-201ENST00000351328 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-201ENST00000351328 GPRASP1Q5JY77 1395 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-201ENST00000351328 KCNA6P17658 529 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-201ENST00000351328 ADGRB1O14514 1584 aa9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.1 ms