RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318561.7

SFTPC-201, Transcript of surfactant protein C, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SFTPC, Length 997 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPC-201ENST00000318561 NAIPQ13075 1403 aa25.48■■□□□ 1.67
SFTPC-201ENST00000318561 UNC13BO14795 1591 aa25.48■■□□□ 1.67
SFTPC-201ENST00000318561 HFM1A2PYH4 1435 aa25.47■■□□□ 1.67
SFTPC-201ENST00000318561 SLAIN2Q9P270 581 aa25.47■■□□□ 1.67
SFTPC-201ENST00000318561 PHLPP1O60346 1717 aa25.46■■□□□ 1.67
SFTPC-201ENST00000318561 RXRBP28702 533 aa25.46■■□□□ 1.67
SFTPC-201ENST00000318561 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
SFTPC-201ENST00000318561 LMTK2Q8IWU2 1503 aa25.43■■□□□ 1.66
SFTPC-201ENST00000318561 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa25.43■■□□□ 1.66
SFTPC-201ENST00000318561 SLC26A8Q96RN1 970 aa25.43■■□□□ 1.66
SFTPC-201ENST00000318561 MSH6P52701 1360 aa25.43■■□□□ 1.66
SFTPC-201ENST00000318561 TMEM2Q9UHN6 1383 aa25.43■■□□□ 1.66
SFTPC-201ENST00000318561 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
SFTPC-201ENST00000318561 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.38■■□□□ 1.65
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SFTPC-201ENST00000318561 TET3O43151 1660 aa25.37■■□□□ 1.65
SFTPC-201ENST00000318561 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
SFTPC-201ENST00000318561 NUP155O75694 1391 aa25.36■■□□□ 1.65
SFTPC-201ENST00000318561 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.36■■□□□ 1.65
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SFTPC-201ENST00000318561 NWD1Q149M9 1564 aa25.31■■□□□ 1.64
SFTPC-201ENST00000318561 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.29■■□□□ 1.64
SFTPC-201ENST00000318561 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
SFTPC-201ENST00000318561 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
SFTPC-201ENST00000318561 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
SFTPC-201ENST00000318561 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
SFTPC-201ENST00000318561 AFF2P51816 1311 aa25.27■■□□□ 1.64
SFTPC-201ENST00000318561 E9PCH4 1651 aa25.26■■□□□ 1.63
SFTPC-201ENST00000318561 RGS12O14924 1447 aa25.26■■□□□ 1.63
SFTPC-201ENST00000318561 IDI1Q13907 227 aa25.24■■□□□ 1.63
SFTPC-201ENST00000318561 BCANQ96GW7 911 aa25.24■■□□□ 1.63
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SFTPC-201ENST00000318561 SHPRHQ149N8 1683 aa25.22■■□□□ 1.63
SFTPC-201ENST00000318561 NOS1P29475 1434 aa25.21■■□□□ 1.63
SFTPC-201ENST00000318561 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
SFTPC-201ENST00000318561 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
SFTPC-201ENST00000318561 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.63
SFTPC-201ENST00000318561 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.19■■□□□ 1.62
SFTPC-201ENST00000318561 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
SFTPC-201ENST00000318561 ZRANB1Q9UGI0 708 aa25.18■■□□□ 1.62
SFTPC-201ENST00000318561 C14orf37Q86TY3 774 aa25.17■■□□□ 1.62
SFTPC-201ENST00000318561 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
SFTPC-201ENST00000318561 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
SFTPC-201ENST00000318561 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa25.14■■□□□ 1.62
SFTPC-201ENST00000318561 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa25.14■■□□□ 1.61
SFTPC-201ENST00000318561 DIP2AQ14689 1571 aa25.14■■□□□ 1.61
SFTPC-201ENST00000318561 CADPS2Q86UW7 1296 aa25.13■■□□□ 1.61
SFTPC-201ENST00000318561 C8orf37Q96NL8 207 aa25.12■■□□□ 1.61
SFTPC-201ENST00000318561 SLC52A1Q9NWF4 448 aa25.12■■□□□ 1.61
SFTPC-201ENST00000318561 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa25.12■■□□□ 1.61
SFTPC-201ENST00000318561 ATF3P18847 181 aa25.11■■□□□ 1.61
SFTPC-201ENST00000318561 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
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SFTPC-201ENST00000318561 C19orf44Q9H6X5 657 aa25.09■■□□□ 1.61
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SFTPC-201ENST00000318561 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa25.06■■□□□ 1.6
SFTPC-201ENST00000318561 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
SFTPC-201ENST00000318561 MYO5BQ9ULV0 1848 aa25.04■■□□□ 1.6
SFTPC-201ENST00000318561 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
SFTPC-201ENST00000318561 TRPM2O94759 1503 aa25.03■■□□□ 1.6
SFTPC-201ENST00000318561 TBX22Q9Y458 520 aa25.03■■□□□ 1.6
SFTPC-201ENST00000318561 ZFYVE9O95405 1425 aa25.03■■□□□ 1.6
SFTPC-201ENST00000318561 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
SFTPC-201ENST00000318561 NGLY1Q96IV0 654 aa25.02■■□□□ 1.6
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SFTPC-201ENST00000318561 CLTCL1P53675 1640 aa24.99■■□□□ 1.59
SFTPC-201ENST00000318561 RIMS2Q9UQ26 1411 aa24.98■■□□□ 1.59
SFTPC-201ENST00000318561 CHGAP10645 457 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
SFTPC-201ENST00000318561 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
SFTPC-201ENST00000318561 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa24.97■■□□□ 1.59
SFTPC-201ENST00000318561 KIF1BO60333 1816 aa24.96■■□□□ 1.59
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SFTPC-201ENST00000318561 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa24.93■■□□□ 1.58
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SFTPC-201ENST00000318561 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.89■■□□□ 1.58
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SFTPC-201ENST00000318561 MST1RQ04912 1400 aa24.88■■□□□ 1.57
SFTPC-201ENST00000318561 CCDC125Q86Z20 511 aa24.88■■□□□ 1.57
SFTPC-201ENST00000318561 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
SFTPC-201ENST00000318561 PIK3R4Q99570 1358 aa24.88■■□□□ 1.57
SFTPC-201ENST00000318561 DCCP43146 1447 aa24.87■■□□□ 1.57
SFTPC-201ENST00000318561 EP400Q96L91 3159 aa24.87■■□□□ 1.57
SFTPC-201ENST00000318561 NHSL1Q5SYE7 1610 aa24.86■■□□□ 1.57
SFTPC-201ENST00000318561 PTPRUQ92729 1446 aa24.86■■□□□ 1.57
SFTPC-201ENST00000318561 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP24.85■■□□□ 1.57
SFTPC-201ENST00000318561 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
SFTPC-201ENST00000318561 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa24.82■■□□□ 1.56
SFTPC-201ENST00000318561 ATRNO75882 1429 aa24.81■■□□□ 1.56
SFTPC-201ENST00000318561 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
SFTPC-201ENST00000318561 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa24.77■■□□□ 1.56
SFTPC-201ENST00000318561 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa24.76■■□□□ 1.55
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