RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273482.10

TRPC1-201, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily C member 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPC1, Length 4,324 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1-201ENST00000273482 STAC3Q96MF2 364 aa21.64■■□□□ 1.05
TRPC1-201ENST00000273482 KIAA0556O60303 1618 aa21.64■■□□□ 1.05
TRPC1-201ENST00000273482 DISP1Q96F81 1524 aa21.63■■□□□ 1.05
TRPC1-201ENST00000273482 ADGRL1O94910 1474 aa21.63■■□□□ 1.05
TRPC1-201ENST00000273482 BACH2Q9BYV9 841 aa21.62■■□□□ 1.05
TRPC1-201ENST00000273482 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
TRPC1-201ENST00000273482 CDCA7LQ96GN5 454 aa21.62■■□□□ 1.05
TRPC1-201ENST00000273482 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
TRPC1-201ENST00000273482 CGNL1Q0VF96 1302 aa21.61■■□□□ 1.05
TRPC1-201ENST00000273482 PTMAP06454 111 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
TRPC1-201ENST00000273482 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
TRPC1-201ENST00000273482 APAF1O14727 1248 aa21.6■■□□□ 1.05
TRPC1-201ENST00000273482 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
TRPC1-201ENST00000273482 NUP160Q12769 1436 aa21.59■■□□□ 1.05
TRPC1-201ENST00000273482 CLUAP1Q96AJ1 413 aa21.59■■□□□ 1.05
TRPC1-201ENST00000273482 GGNBP2Q9H3C7 697 aa21.58■■□□□ 1.04
TRPC1-201ENST00000273482 FANCAO15360 1455 aa21.57■■□□□ 1.04
TRPC1-201ENST00000273482 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa21.57■■□□□ 1.04
TRPC1-201ENST00000273482 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa21.57■■□□□ 1.04
TRPC1-201ENST00000273482 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
TRPC1-201ENST00000273482 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
TRPC1-201ENST00000273482 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
TRPC1-201ENST00000273482 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
TRPC1-201ENST00000273482 MAPKBP1O60336 1514 aa21.55■■□□□ 1.04
TRPC1-201ENST00000273482 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
TRPC1-201ENST00000273482 PBRM1Q86U86 1689 aa21.54■■□□□ 1.04
TRPC1-201ENST00000273482 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
TRPC1-201ENST00000273482 MSNP26038 577 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
TRPC1-201ENST00000273482 PRAM1Q96QH2 718 aa21.54■■□□□ 1.04
TRPC1-201ENST00000273482 ERBINQ96RT1 1412 aa21.53■■□□□ 1.04
TRPC1-201ENST00000273482 SLC52A1Q9NWF4 448 aa21.53■■□□□ 1.04
TRPC1-201ENST00000273482 AMPHP49418 695 aa21.52■■□□□ 1.04
TRPC1-201ENST00000273482 GBP4Q96PP9 640 aa21.52■■□□□ 1.04
TRPC1-201ENST00000273482 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
TRPC1-201ENST00000273482 BCL2L13Q9BXK5 485 aa21.51■■□□□ 1.03
TRPC1-201ENST00000273482 TXNDC2Q86VQ3 553 aa21.51■■□□□ 1.03
TRPC1-201ENST00000273482 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
TRPC1-201ENST00000273482 ASXL2Q76L83 1435 aa21.51■■□□□ 1.03
TRPC1-201ENST00000273482 COG6Q9Y2V7 657 aa21.51■■□□□ 1.03
TRPC1-201ENST00000273482 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP21.5■■□□□ 1.03
TRPC1-201ENST00000273482 COG3Q96JB2 828 aa21.5■■□□□ 1.03
TRPC1-201ENST00000273482 PLCH2O75038 1416 aa21.48■■□□□ 1.03
TRPC1-201ENST00000273482 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
TRPC1-201ENST00000273482 SLC26A8Q96RN1 970 aa21.48■■□□□ 1.03
TRPC1-201ENST00000273482 ADAMTS8Q9UP79 889 aa21.48■■□□□ 1.03
TRPC1-201ENST00000273482 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
TRPC1-201ENST00000273482 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
TRPC1-201ENST00000273482 TPRNQ4KMQ1 711 aa21.46■■□□□ 1.03
TRPC1-201ENST00000273482 IDI1Q13907 227 aa21.46■■□□□ 1.03
TRPC1-201ENST00000273482 CASC1Q6TDU7 716 aa21.46■■□□□ 1.03
TRPC1-201ENST00000273482 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa21.46■■□□□ 1.03
TRPC1-201ENST00000273482 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa21.46■■□□□ 1.03
TRPC1-201ENST00000273482 ITPRIPQ8IWB1 547 aa21.46■■□□□ 1.03
TRPC1-201ENST00000273482 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa21.46■■□□□ 1.03
TRPC1-201ENST00000273482 SYCP2Q9BX26 1530 aa21.45■■□□□ 1.02
TRPC1-201ENST00000273482 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.45■■□□□ 1.02
TRPC1-201ENST00000273482 MTHFSP49914 203 aa21.45■■□□□ 1.02
TRPC1-201ENST00000273482 SMC4Q9NTJ3 1288 aa21.45■■□□□ 1.02
TRPC1-201ENST00000273482 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
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TRPC1-201ENST00000273482 CEP170Q5SW79 1584 aa21.44■■□□□ 1.02
TRPC1-201ENST00000273482 PPP2R1AP30153 589 aa21.41■■□□□ 1.02
TRPC1-201ENST00000273482 NUTM2GQ5VZR2 741 aa21.41■■□□□ 1.02
TRPC1-201ENST00000273482 VSIG10Q8N0Z9 540 aa21.41■■□□□ 1.02
TRPC1-201ENST00000273482 SAMD9Q5K651 1589 aa21.4■■□□□ 1.02
TRPC1-201ENST00000273482 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.4■■□□□ 1.02
TRPC1-201ENST00000273482 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
TRPC1-201ENST00000273482 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
TRPC1-201ENST00000273482 APBB1O00213 710 aa21.39■■□□□ 1.02
TRPC1-201ENST00000273482 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
TRPC1-201ENST00000273482 SKAP1Q86WV1 359 aa21.39■■□□□ 1.01
TRPC1-201ENST00000273482 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
TRPC1-201ENST00000273482 FOXD4L1Q9NU39 408 aa21.39■■□□□ 1.01
TRPC1-201ENST00000273482 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
TRPC1-201ENST00000273482 HMOX1P09601 288 aa21.38■■□□□ 1.01
TRPC1-201ENST00000273482 PLCB2Q00722 1185 aa21.38■■□□□ 1.01
TRPC1-201ENST00000273482 CABP1Q9NZU7 370 aa21.38■■□□□ 1.01
TRPC1-201ENST00000273482 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
TRPC1-201ENST00000273482 DDX11L8A8MPP1 907 aa21.36■■□□□ 1.01
TRPC1-201ENST00000273482 PTMSP20962 102 aa21.36■■□□□ 1.01
TRPC1-201ENST00000273482 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
TRPC1-201ENST00000273482 WDR7Q9Y4E6 1490 aa21.36■■□□□ 1.01
TRPC1-201ENST00000273482 CDK19Q9BWU1 502 aa21.36■■□□□ 1.01
TRPC1-201ENST00000273482 WAPLQ7Z5K2 1190 aa21.34■■□□□ 1.01
TRPC1-201ENST00000273482 ARID3AQ99856 593 aa21.34■■□□□ 1.01
TRPC1-201ENST00000273482 RIPK4P57078 832 aa21.32■■□□□ 1
TRPC1-201ENST00000273482 CHMP5Q9NZZ3 219 aa21.32■■□□□ 1
TRPC1-201ENST00000273482 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa21.32■■□□□ 1
TRPC1-201ENST00000273482 PSME1Q06323 249 aa21.32■■□□□ 1
TRPC1-201ENST00000273482 PANK1Q8TE04 598 aa21.31■■□□□ 1
TRPC1-201ENST00000273482 ITSN2Q9NZM3 1697 aa21.31■■□□□ 1
TRPC1-201ENST00000273482 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
TRPC1-201ENST00000273482 FAM43AQ8N2R8 423 aa21.31■■□□□ 1
TRPC1-201ENST00000273482 ABCC2Q92887 1545 aa21.3■■□□□ 1
TRPC1-201ENST00000273482 RUNDC1Q96C34 613 aa21.29■■□□□ 1
TRPC1-201ENST00000273482 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.29■■□□□ 1
TRPC1-201ENST00000273482 NLRP6P59044 892 aa21.28■■□□□ 1
TRPC1-201ENST00000273482 SLC4A10Q6U841 1118 aa21.28■■□□□ 1
TRPC1-201ENST00000273482 TCP11L2Q8N4U5 519 aa21.28■■□□□ 1
TRPC1-201ENST00000273482 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
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