RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249440.4

HOXD3-201, Transcript of homeobox D3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD3, Length 2,303 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD3-201ENST00000249440 CDCA8Q53HL2 280 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXD3-201ENST00000249440 SCAPERQ9BY12 1400 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXD3-201ENST00000249440 ADGRL1O94910 1474 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXD3-201ENST00000249440 CLTCL1P53675 1640 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXD3-201ENST00000249440 KANK1Q14678 1352 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXD3-201ENST00000249440 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
HOXD3-201ENST00000249440 GLI2P10070 1586 aa21.83■■□□□ 1.09
HOXD3-201ENST00000249440 ATP7AQ04656 1500 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXD3-201ENST00000249440 KNSTRNQ9Y448 316 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXD3-201ENST00000249440 RAPGEF3O95398 923 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXD3-201ENST00000249440 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
HOXD3-201ENST00000249440 CDCA7LQ96GN5 454 aa21.8■■□□□ 1.08
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HOXD3-201ENST00000249440 VWDEQ8N2E2 1590 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXD3-201ENST00000249440 EXOC6Q8TAG9 804 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXD3-201ENST00000249440 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXD3-201ENST00000249440 NEURL4Q96JN8 1562 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXD3-201ENST00000249440 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
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HOXD3-201ENST00000249440 MYT1LQ9UL68 1186 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXD3-201ENST00000249440 PPP2R1AP30153 589 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXD3-201ENST00000249440 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
HOXD3-201ENST00000249440 ADAMTS8Q9UP79 889 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXD3-201ENST00000249440 SLC24A1O60721 1099 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXD3-201ENST00000249440 TRHP20396 242 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
HOXD3-201ENST00000249440 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa21.72■■□□□ 1.07
HOXD3-201ENST00000249440 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP21.72■■□□□ 1.07
HOXD3-201ENST00000249440 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
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HOXD3-201ENST00000249440 POGZQ7Z3K3 1410 aa21.69■■□□□ 1.06
HOXD3-201ENST00000249440 MYOM2P54296 1465 aa21.69■■□□□ 1.06
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HOXD3-201ENST00000249440 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa21.68■■□□□ 1.06
HOXD3-201ENST00000249440 PIK3C2GO75747 1445 aa21.68■■□□□ 1.06
HOXD3-201ENST00000249440 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa21.68■■□□□ 1.06
HOXD3-201ENST00000249440 CFAP74Q9C0B2 1584 aa21.67■■□□□ 1.06
HOXD3-201ENST00000249440 RICTORQ6R327 1708 aa21.66■■□□□ 1.06
HOXD3-201ENST00000249440 EFCAB6Q5THR3 1501 aa21.65■■□□□ 1.06
HOXD3-201ENST00000249440 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
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HOXD3-201ENST00000249440 PLIN1O60240 522 aa21.64■■□□□ 1.05
HOXD3-201ENST00000249440 CFAP70Q5T0N1 1121 aa21.64■■□□□ 1.05
HOXD3-201ENST00000249440 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXD3-201ENST00000249440 UGGT1Q9NYU2 1555 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXD3-201ENST00000249440 IFT172Q9UG01 1749 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXD3-201ENST00000249440 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa21.61■■□□□ 1.05
HOXD3-201ENST00000249440 YEATS2Q9ULM3 1422 aa21.61■■□□□ 1.05
HOXD3-201ENST00000249440 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa21.61■■□□□ 1.05
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HOXD3-201ENST00000249440 LMTK2Q8IWU2 1503 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXD3-201ENST00000249440 ZNF521Q96K83 1311 aa21.6■■□□□ 1.05
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HOXD3-201ENST00000249440 MROH2AA6NES4 1674 aa21.58■■□□□ 1.04
HOXD3-201ENST00000249440 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
HOXD3-201ENST00000249440 NRXN1Q9ULB1 1477 aa21.57■■□□□ 1.04
HOXD3-201ENST00000249440 HECW2Q9P2P5 1572 aa21.57■■□□□ 1.04
HOXD3-201ENST00000249440 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
HOXD3-201ENST00000249440 MYO3AQ8NEV4 1616 aa21.57■■□□□ 1.04
HOXD3-201ENST00000249440 PDE4AP27815 886 aa21.56■■□□□ 1.04
HOXD3-201ENST00000249440 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa21.56■■□□□ 1.04
HOXD3-201ENST00000249440 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
HOXD3-201ENST00000249440 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXD3-201ENST00000249440 BACH2Q9BYV9 841 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXD3-201ENST00000249440 ADGRB3O60242 1522 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXD3-201ENST00000249440 MLH3Q9UHC1 1453 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXD3-201ENST00000249440 SLFN5Q08AF3 891 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXD3-201ENST00000249440 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXD3-201ENST00000249440 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXD3-201ENST00000249440 C20orf194Q5TEA3 1177 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXD3-201ENST00000249440 CARD14Q9BXL6 1004 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXD3-201ENST00000249440 NOS1P29475 1434 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXD3-201ENST00000249440 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
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HOXD3-201ENST00000249440 CHGAP10645 457 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
HOXD3-201ENST00000249440 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
HOXD3-201ENST00000249440 APAF1O14727 1248 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXD3-201ENST00000249440 PPLO60437 1756 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXD3-201ENST00000249440 NPATQ14207 1427 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXD3-201ENST00000249440 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
HOXD3-201ENST00000249440 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
HOXD3-201ENST00000249440 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
HOXD3-201ENST00000249440 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
HOXD3-201ENST00000249440 KDM2BQ8NHM5 1336 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXD3-201ENST00000249440 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
HOXD3-201ENST00000249440 GGT6Q6P531 493 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXD3-201ENST00000249440 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXD3-201ENST00000249440 E9PSI1 815 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXD3-201ENST00000249440 NBR1Q14596 966 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD3-201ENST00000249440 TRAK1Q9UPV9 953 aa21.43■■□□□ 1.02
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