RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617904.4

TRAPPC3-210, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,305 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-210ENST00000617904 AMHR2Q16671 573 aa18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC3-210ENST00000617904 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC3-210ENST00000617904 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC3-210ENST00000617904 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC3-210ENST00000617904 RPAINQ86UA6 219 aa18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC3-210ENST00000617904 ACRBPQ8NEB7 543 aa18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC3-210ENST00000617904 TAS1R2Q8TE23 839 aa18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC3-210ENST00000617904 ALS2CR12Q96Q35 445 aa18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC3-210ENST00000617904 OSMRQ99650 979 aa18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC3-210ENST00000617904 TUBB2BQ9BVA1 445 aa18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC3-210ENST00000617904 HAPLN2Q9GZV7 340 aa18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC3-210ENST00000617904 DERAQ9Y315 318 aa18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC3-210ENST00000617904 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC3-210ENST00000617904 ABLIM1O14639 778 aa18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC3-210ENST00000617904 CAND2O75155 1236 aa18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC3-210ENST00000617904 NCOA4Q13772 614 aa18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC3-210ENST00000617904 EEF1DP3Q658K8 133 aa18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC3-210ENST00000617904 HGSNATQ68CP4 663 aa18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC3-210ENST00000617904 RUFY4Q6ZNE9 571 aa18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC3-210ENST00000617904 OTOP2Q7RTS6 562 aa18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC3-210ENST00000617904 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC3-210ENST00000617904 CPB2Q96IY4 423 aa18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC3-210ENST00000617904 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC3-210ENST00000617904 ATP8B3O60423 1300 aa18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC3-210ENST00000617904 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 GPR182O15218 404 aa18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 TACC1O75410 805 aa18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 EDN1P05305 212 aa18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 ATICP31939 592 aa18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 PDE6CP51160 858 aa18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 OSTNP61366 133 aa18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 TMEM62Q0P6H9 643 aa18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 RAB30Q15771 203 aa18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 SYT10Q6XYQ8 523 aa18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 TTC39CQ8N584 583 aa18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 SCLYQ96I15 445 aa18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 PRDM12Q9H4Q4 367 aa18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 DNAI1Q9UI46 699 aa18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 MSRAQ9UJ68 235 aa18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 INTUQ9ULD6 942 aa18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 FAM189A1O60320 539 aa18■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 TNFSF9P41273 254 aa18■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 APBA1Q02410 837 aa18■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 PTK2Q05397 1052 aa18■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 PTK7Q13308 1070 aa18■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 TMEM132DQ14C87 1099 aa18■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 PTGISQ16647 500 aa18■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 GJB7Q6PEY0 223 aa18■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 SERINC5Q86VE9 423 aa18■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF677Q86XU0 584 aa18■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 SHC3Q92529 594 aa18■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa18■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 CHST12Q9NRB3 414 aa18■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa18■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 GUCA1BQ9UMX6 200 aa18■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 C2CD2Q9Y426 696 aa18■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa18■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 GBF1Q92538 1859 aa18■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 EVPLQ92817 2033 aa18■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 CTAGE9A4FU28 777 aa17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 LRRN2O75325 713 aa17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 RPS6KA5O75582 802 aa17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 NPTXRO95502 500 aa17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 IQCF3P0C7M6 154 aa17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 KRT5P13647 590 aa17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 TERF1P54274 439 aa17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 MYO9BQ13459 2157 aa17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 ADGRE1Q14246 886 aa17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 NAB2Q15742 525 aa17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 SEZ6Q53EL9 994 aa17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF569Q5MCW4 686 aa17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 ARHGEF19Q8IW93 802 aa17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 TRIM58Q8NG06 486 aa17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF516Q92618 1163 aa17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 SEMA4DQ92854 862 aa17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 PDCL3Q9H2J4 239 aa17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 PRDM6Q9NQX0 595 aa17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 ITGA11Q9UKX5 1188 aa17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 VCANP13611 3396 aa17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 TTLL13PA6NNM8 815 aa17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms