RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 MCF2P10911 925 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 FGFR1P11362 822 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 ACTN1P12814 892 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 GARTP22102 1010 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 FSHRP23945 695 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 RPL13P26373 211 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 MLH1P40692 756 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 VAMP7P51809 220 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF75DP51815 510 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 DEFB103AP81534 67 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 LRMPQ12912 555 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 CBWD6Q4V339 395 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 CBWD3Q5JTY5 395 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 CBWD5Q5RIA9 395 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 C1orf53Q5VUE5 145 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 JADE1Q6IE81 842 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 SLFN12LQ6IEE8 588 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC27A1Q6PCB7 646 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 GJB7Q6PEY0 223 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 AGMOQ6ZNB7 445 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 C16orf59Q7L2K0 433 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 OTOP2Q7RTS6 562 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 ECHDC2Q86YB7 292 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC9A9Q8IVB4 645 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 BRSK2Q8IWQ3 736 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 TRIM59Q8IWR1 403 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 C12orf56Q8IXR9 622 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 SPC24Q8NBT2 197 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 DPF3Q92784 378 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 KCNN1Q92952 543 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC35C1Q96A29 364 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 PRIMPOLQ96LW4 560 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 MFSD14AQ96MC6 490 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 FBXL18Q96ME1 805 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 CEP63Q96MT8 703 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 GAD1Q99259 594 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 CRACR2AQ9BSW2 395 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 PI4K2AQ9BTU6 479 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 TRIM5Q9C035 493 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM105AQ9NUU6 356 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 TRIP11Q15643 1979 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM170AA1A519 330 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF233A6NK53 670 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 C9IYK1 514 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 F8W810 466 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 PIK3R2O00459 728 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 PTGESO14684 152 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 EPHB6O15197 1021 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 CAND2O75155 1236 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 POMCP01189 267 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 CXCL10P02778 98 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 CLTAP09496 248 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 ITGA4P13612 1032 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 KRT13P13646 458 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC9A1P19634 815 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 SCNN1GP51170 649 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 CDR1P51861 262 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 UBASH3AP57075 661 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 TPM4P67936 248 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 CDC42EP1Q00587 391 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 UBXN1Q04323 297 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 BFSP1Q12934 665 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 PSMD6Q15008 389 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 NFIL3Q16649 462 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 MAN2A1Q16706 1144 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 VWA3BQ502W6 1294 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 LCE3BQ5TA77 95 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 SPOPLQ6IQ16 392 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 MFSD5Q6N075 450 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 GOLGA5Q8TBA6 731 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 HELQQ8TDG4 1101 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 PARD3BQ8TEW8 1205 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 SEPT8Q92599 483 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 SEMA4DQ92854 862 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 KAT5Q92993 513 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 SNX27Q96L92 541 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPNS1-208ENST00000589162 ACAP3Q96P50 834 aa6.53□□□□□ -1.36
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