RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa27.33■■□□□ 1.97
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CAPNS1-204ENST00000587718 CLUL1Q15846 466 aa27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-204ENST00000587718 XKR3Q5GH77 459 aa27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-204ENST00000587718 ABHD15Q6UXT9 468 aa27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM71BQ8TC56 605 aa27.32■■□□□ 1.96
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CAPNS1-204ENST00000587718 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa27.27■■□□□ 1.96
CAPNS1-204ENST00000587718 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.96
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CAPNS1-204ENST00000587718 CXCR5P32302 372 aa27.26■■□□□ 1.96
CAPNS1-204ENST00000587718 MFAP3P55082 362 aa27.26■■□□□ 1.96
CAPNS1-204ENST00000587718 MGAT3Q09327 533 aa27.26■■□□□ 1.96
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