RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581467.1

TIMM21-205, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 21, human

TSL 2

Gene TIMM21, Length 579 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TIMM21-205	ENST00000581467	NAB2	Q15742	525 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	ZNF699	Q32M78	642 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	SMYD5	Q6GMV2	418 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	JADE1	Q6IE81	842 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	H2AFV	Q71UI9	128 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	RPAIN	Q86UA6	219 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	TMEM192	Q8IY95	271 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	FAM71A	Q8IYT1	594 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	HACE1	Q8IYU2	909 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	SLC35F6	Q8N357	371 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	BEST2	Q8NFU1	509 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	TRIM58	Q8NG06	486 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	EPS8L1	Q8TE68	723 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	TATDN2	Q93075	761 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	FAM84A	Q96KN4	292 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	NOX5	Q96PH1	765 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	ALS2CR12	Q96Q35	445 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	WDR24	Q96S15	920 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	NAPG	Q99747	312 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	AGPAT1	Q99943	283 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	APOL6	Q9BWW8	343 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	SEPT11	Q9NVA2	429 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	SNTG2	Q9NY99	539 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	TSKS	Q9UJT2	592 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	NAGPA	Q9UK23	515 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	INTU	Q9ULD6	942 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	DERA	Q9Y315	318 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	C2CD2	Q9Y426	696 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	ATP8B3	O60423	1300 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467		A0A1W2PQY0	241 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	ANO9	A1A5B4	782 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	BTNL10	A8MVZ5	291 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	GPR182	O15218	404 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	PJA2	O43164	708 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	CYP26A1	O43174	497 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	RECQL4	O94761	1208 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	SGPL1	O95470	568 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	CD4	P01730	458 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	ITGB3	P05106	788 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	NUDT7	P0C024	238 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	TMEM253	P0C7T8	217 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	GHR	P10912	638 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	CYP11B1	P15538	503 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	ATIC	P31939	592 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	PBX2	P40425	430 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	TERF1	P54274	439 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	TNNC1	P63316	161 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	CDR2	Q01850	454 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	MGAT3	Q09327	533 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	PAK2	Q13177	524 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	TUBB2A	Q13885	445 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	UBXN11	Q5T124	520 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	TAF3	Q5VWG9	929 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	SLC47A2	Q86VL8	602 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	FAM228A	Q86W67	206 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	ZNF677	Q86XU0	584 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	RNF10	Q8N5U6	811 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	USP38	Q8NB14	1042 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TIMM21-205	ENST00000581467	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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