RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578600.1

PTPRM-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-208ENST00000578600 EPS15P42566 896 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 USP14P54578 494 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 DLG4P78352 724 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 RHDQ02161 417 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 GALEQ14376 348 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 LLGL1Q15334 1064 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 CRY2Q49AN0 593 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 PRR31Q5SQ13 230 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 KLHDC10Q6PID8 442 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 FAM180AQ6UWF9 173 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 LMBR1LQ6UX01 489 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 BTNL9Q6UXG8 535 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 CCDC149Q6ZUS6 474 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 GLB1L2Q8IW92 636 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 PPP1R35Q8TAP8 253 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 NRG4Q8WWG1 115 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 DPF2Q92785 391 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 HDAC10Q969S8 669 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 ZSWIM3Q96MP5 696 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 GREM2Q9H772 168 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 PTPN22Q9Y2R2 807 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 ERVV-1B6SEH8 477 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 FAM227AF5H4B4 570 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 PPIP5K2O43314 1243 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 CUTAO60888 179 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 KNG1P01042 644 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 CHGBP05060 677 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 RPS12P25398 132 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 LIMS1P48059 325 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 MMP14P50281 582 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 SOX10P56693 466 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 ANTXR2P58335 489 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 SLC39A6Q13433 755 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 DGKDQ16760 1214 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 MIGA2Q7L4E1 593 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 FAM43AQ8N2R8 423 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 PRR18Q8N4B5 295 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 OR5AN1Q8NGI8 311 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 WRNIP1Q96S55 665 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 RNF186Q9NXI6 227 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 INTUQ9ULD6 942 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 KNSTRNQ9Y448 316 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 TUSC2O75896 110 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 IL13P35225 146 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 INHBEP58166 350 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 SREBF2Q12772 1141 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 MORC3Q14149 939 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 KIAA0753Q2KHM9 967 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 CCDC157Q569K6 752 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 TMEM200BQ69YZ2 307 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 GAREM2Q75VX8 874 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 OVCH2Q7RTZ1 564 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 TNIP3Q96KP6 325 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 ARPC5LQ9BPX5 153 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 SOX7Q9BT81 388 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 TMEM60Q9H2L4 133 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 KMT5AQ9NQR1 393 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 TIAM2Q8IVF5 1701 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 NRXN2Q9P2S2 1712 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 RGPD2P0DJD1 1756 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 A6NNZ2 444 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 BTBD11A6QL63 1104 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 B3GALT2O43825 422 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 UBXN7O94888 489 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 HRGP04196 525 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 WASP42768 502 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 MCAMP43121 646 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 FAM193AP78312 1265 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 MGAT5Q09328 741 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 MESP2Q0VG99 397 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-208ENST00000578600 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
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