RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562866.1

VPS9D1-AS1-202, VPS9D1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS9D1-AS1, Length 1,753 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ERICH4A6NGS2 130 aa22.77■■□□□ 1.24
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa22.77■■□□□ 1.24
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MAGEB2O15479 319 aa22.77■■□□□ 1.24
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 THAP12O43422 761 aa22.77■■□□□ 1.24
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TNNC2P02585 160 aa22.77■■□□□ 1.24
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PYGMP11217 842 aa22.77■■□□□ 1.24
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CAPN2P17655 700 aa22.77■■□□□ 1.24
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RRM1P23921 792 aa22.77■■□□□ 1.24
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PHKA2P46019 1235 aa22.77■■□□□ 1.24
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZNF132P52740 706 aa22.77■■□□□ 1.24
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NOMO3P69849 1222 aa22.77■■□□□ 1.24
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CYP1B1Q16678 543 aa22.77■■□□□ 1.24
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZNF568Q3ZCX4 644 aa22.77■■□□□ 1.24
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa22.77■■□□□ 1.24
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FAM212AQ96EL1 285 aa22.77■■□□□ 1.24
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NIF3L1Q9GZT8 377 aa22.77■■□□□ 1.24
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ERVK-5Q9HDB9 667 aa22.77■■□□□ 1.24
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PODXLO00592 558 aa22.76■■□□□ 1.23
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 IL18RAPO95256 599 aa22.76■■□□□ 1.23
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 C22orf31O95567 290 aa22.76■■□□□ 1.23
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 JAMLQ86YT9 394 aa22.76■■□□□ 1.23
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PRELID2Q8N945 189 aa22.76■■□□□ 1.23
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PKNOX2Q96KN3 472 aa22.76■■□□□ 1.23
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ADAM22Q9P0K1 906 aa22.76■■□□□ 1.23
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PRDM4Q9UKN5 801 aa22.76■■□□□ 1.23
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TNFSF13BQ9Y275 285 aa22.76■■□□□ 1.23
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 UMODL1Q5DID0 1318 aa22.76■■□□□ 1.23
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MROH7Q68CQ1 1323 aa22.76■■□□□ 1.23
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 COL1A2P08123 1366 aa22.76■■□□□ 1.23
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 B4GALT4O60513 344 aa22.76■■□□□ 1.23
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TMEM191BP0C7N4 346 aa22.76■■□□□ 1.23
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MBTD1Q05BQ5 628 aa22.76■■□□□ 1.23
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TAPT1Q6NXT6 567 aa22.76■■□□□ 1.23
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PIK3R5Q8WYR1 880 aa22.76■■□□□ 1.23
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa22.76■■□□□ 1.23
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DPH5Q9H2P9 285 aa22.76■■□□□ 1.23
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa22.76■■□□□ 1.23
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LSM8O95777 96 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LGALS2P05162 132 aa22.75■■□□□ 1.23
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ADORA2AP29274 412 aa22.75■■□□□ 1.23
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CLCN3P51790 818 aa22.75■■□□□ 1.23
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MYL6P60660 151 aa22.75■■□□□ 1.23
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FAM187BQ17R55 369 aa22.75■■□□□ 1.23
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SPDYCQ5MJ68 293 aa22.75■■□□□ 1.23
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PPTC7Q8NI37 304 aa22.75■■□□□ 1.23
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TRIM51Q9BSJ1 452 aa22.75■■□□□ 1.23
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LCMT1Q9UIC8 334 aa22.75■■□□□ 1.23
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PROSCO94903 275 aa22.74■■□□□ 1.23
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CST3P01034 146 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ACTN2P35609 894 aa22.74■■□□□ 1.23
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FNTAP49354 379 aa22.74■■□□□ 1.23
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PTP4A2Q12974 167 aa22.74■■□□□ 1.23
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 C11orf70Q9BRQ4 267 aa22.74■■□□□ 1.23
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RNPEPQ9H4A4 650 aa22.74■■□□□ 1.23
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MORF4L1Q9UBU8 362 aa22.74■■□□□ 1.23
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PARP2Q9UGN5 583 aa22.74■■□□□ 1.23
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GOLGA6L10A6NI86 522 aa22.73■■□□□ 1.23
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 A6NNZ2 444 aa22.73■■□□□ 1.23
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HOXC6P09630 235 aa22.73■■□□□ 1.23
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 INSRRP14616 1297 aa22.73■■□□□ 1.23
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HSD17B3P37058 310 aa22.73■■□□□ 1.23
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PTGIRP43119 386 aa22.73■■□□□ 1.23
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TUBB8Q3ZCM7 444 aa22.73■■□□□ 1.23
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa22.73■■□□□ 1.23
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ANKRD23Q86SG2 305 aa22.73■■□□□ 1.23
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 THNSL1Q8IYQ7 743 aa22.73■■□□□ 1.23
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZNF606Q8WXB4 792 aa22.73■■□□□ 1.23
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NEUROG2Q9H2A3 272 aa22.73■■□□□ 1.23
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CLEC11AQ9Y240 323 aa22.73■■□□□ 1.23
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PLAAQ9Y263 795 aa22.73■■□□□ 1.23
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa22.73■■□□□ 1.23
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FSCN2O14926 492 aa22.73■■□□□ 1.23
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CCL15Q16663 113 aa22.73■■□□□ 1.23
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KYAT1Q16773 422 aa22.73■■□□□ 1.23
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZNF699Q32M78 642 aa22.73■■□□□ 1.23
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