RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558861.1

LRRC28-209, Transcript of leucine rich repeat containing 28, humanhuman

TSL 3

Gene LRRC28, Length 744 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC28-209ENST00000558861 MANFP55145 182 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
LRRC28-209ENST00000558861 MOGSQ13724 837 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRC28-209ENST00000558861 TTC39AQ5SRH9 613 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRC28-209ENST00000558861 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRC28-209ENST00000558861 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
LRRC28-209ENST00000558861 ADGRA1Q86SQ6 560 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRC28-209ENST00000558861 TMEFF1Q8IYR6 380 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRC28-209ENST00000558861 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
LRRC28-209ENST00000558861 LMBR1Q8WVP7 490 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRC28-209ENST00000558861 ZBTB8AQ96BR9 441 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRC28-209ENST00000558861 MAML3Q96JK9 1138 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRC28-209ENST00000558861 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
LRRC28-209ENST00000558861 ANO3Q9BYT9 981 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRC28-209ENST00000558861 BOLA2Q9H3K6 86 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRC28-209ENST00000558861 MYOZ2Q9NPC6 264 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRC28-209ENST00000558861 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
LRRC28-209ENST00000558861 TNKSO95271 1327 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRC28-209ENST00000558861 GOLGA8AA7E2F4 631 aa7.15□□□□□ -1.26
LRRC28-209ENST00000558861 GOLGA8BA8MQT2 603 aa7.15□□□□□ -1.26
LRRC28-209ENST00000558861 FBXO21O94952 628 aa7.15□□□□□ -1.26
LRRC28-209ENST00000558861 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
LRRC28-209ENST00000558861 ECE1P42892 770 aa7.15□□□□□ -1.26
LRRC28-209ENST00000558861 NEK2P51955 445 aa7.15□□□□□ -1.26
LRRC28-209ENST00000558861 RHBDL3P58872 404 aa7.15□□□□□ -1.26
LRRC28-209ENST00000558861 MECOMQ03112 1051 aa7.15□□□□□ -1.26
LRRC28-209ENST00000558861 ROM1Q03395 351 aa7.15□□□□□ -1.26
LRRC28-209ENST00000558861 SSPNQ14714 243 aa7.15□□□□□ -1.26
LRRC28-209ENST00000558861 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
LRRC28-209ENST00000558861 GORABQ5T7V8 394 aa7.15□□□□□ -1.26
LRRC28-209ENST00000558861 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa7.15□□□□□ -1.26
LRRC28-209ENST00000558861 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
LRRC28-209ENST00000558861 STPG3Q8N7X2 389 aa7.15□□□□□ -1.26
LRRC28-209ENST00000558861 LINC00482Q8N8I6 264 aa7.15□□□□□ -1.26
LRRC28-209ENST00000558861 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
LRRC28-209ENST00000558861 SIGLEC10Q96LC7 697 aa7.15□□□□□ -1.26
LRRC28-209ENST00000558861 CLIC6Q96NY7 704 aa7.15□□□□□ -1.26
LRRC28-209ENST00000558861 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
LRRC28-209ENST00000558861 CROTQ9UKG9 612 aa7.15□□□□□ -1.26
LRRC28-209ENST00000558861 IRAK3Q9Y616 596 aa7.15□□□□□ -1.26
LRRC28-209ENST00000558861 DOCK2Q92608 1830 aa7.15□□□□□ -1.27
LRRC28-209ENST00000558861 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa7.14□□□□□ -1.27
LRRC28-209ENST00000558861 GOLIM4O00461 696 aa7.14□□□□□ -1.27
LRRC28-209ENST00000558861 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
LRRC28-209ENST00000558861 GLDCP23378 1020 aa7.14□□□□□ -1.27
LRRC28-209ENST00000558861 IL13RA1P78552 427 aa7.14□□□□□ -1.27
LRRC28-209ENST00000558861 PTPN21Q16825 1174 aa7.14□□□□□ -1.27
LRRC28-209ENST00000558861 CT83Q5H943 113 aa7.14□□□□□ -1.27
LRRC28-209ENST00000558861 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
LRRC28-209ENST00000558861 CCDC62Q6P9F0 684 aa7.14□□□□□ -1.27
LRRC28-209ENST00000558861 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
LRRC28-209ENST00000558861 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
LRRC28-209ENST00000558861 KBTBD3Q8NAB2 608 aa7.14□□□□□ -1.27
LRRC28-209ENST00000558861 KYQ8NBH2 561 aa7.14□□□□□ -1.27
LRRC28-209ENST00000558861 CALML6Q8TD86 181 aa7.14□□□□□ -1.27
LRRC28-209ENST00000558861 FERMT2Q96AC1 680 aa7.14□□□□□ -1.27
LRRC28-209ENST00000558861 OR10A5Q9H207 317 aa7.14□□□□□ -1.27
LRRC28-209ENST00000558861 PRDM12Q9H4Q4 367 aa7.14□□□□□ -1.27
LRRC28-209ENST00000558861 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
LRRC28-209ENST00000558861 PCDH18Q9HCL0 1135 aa7.14□□□□□ -1.27
LRRC28-209ENST00000558861 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
LRRC28-209ENST00000558861 PAG1Q9NWQ8 432 aa7.14□□□□□ -1.27
LRRC28-209ENST00000558861 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa7.14□□□□□ -1.27
LRRC28-209ENST00000558861 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
LRRC28-209ENST00000558861 CNTNAP1P78357 1384 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRC28-209ENST00000558861 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRC28-209ENST00000558861 MAST3O60307 1309 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRC28-209ENST00000558861 PASKQ96RG2 1323 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRC28-209ENST00000558861 PRSS38A1L453 326 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRC28-209ENST00000558861 KRT1P04264 644 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRC28-209ENST00000558861 PI3P19957 117 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRC28-209ENST00000558861 ADD2P35612 726 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRC28-209ENST00000558861 GPR3P46089 330 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRC28-209ENST00000558861 HTRA3P83110 453 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRC28-209ENST00000558861 MCL1Q07820 350 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRC28-209ENST00000558861 ADCY2Q08462 1091 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRC28-209ENST00000558861 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.27
LRRC28-209ENST00000558861 KANK2Q63ZY3 851 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRC28-209ENST00000558861 KIAA1841Q6NSI8 718 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRC28-209ENST00000558861 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRC28-209ENST00000558861 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
LRRC28-209ENST00000558861 FAM129CQ86XR2 697 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRC28-209ENST00000558861 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
LRRC28-209ENST00000558861 CCDC136Q96JN2 1154 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRC28-209ENST00000558861 ACAP3Q96P50 834 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRC28-209ENST00000558861 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
LRRC28-209ENST00000558861 BTBD2Q9BX70 525 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRC28-209ENST00000558861 KCND1Q9NSA2 647 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRC28-209ENST00000558861 ABCF2Q9UG63 623 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRC28-209ENST00000558861 MYH13Q9UKX3 1938 aa7.13□□□□□ -1.27
LRRC28-209ENST00000558861 SSC5DA1L4H1 1573 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRC28-209ENST00000558861 ATRNL1Q5VV63 1379 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRC28-209ENST00000558861 ERC2O15083 957 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRC28-209ENST00000558861 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
LRRC28-209ENST00000558861 TOMM70O94826 608 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRC28-209ENST00000558861 MED14OSP0DP75 135 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRC28-209ENST00000558861 ENPP1P22413 925 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRC28-209ENST00000558861 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
LRRC28-209ENST00000558861 UBE3CQ15386 1083 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRC28-209ENST00000558861 DLGAP5Q15398 846 aa7.12□□□□□ -1.27
LRRC28-209ENST00000558861 STILQ15468 1287 aa7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.6 ms