RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553628.1

AC009396.1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene AC009396.1, Length 1,079 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC009396.1-201ENST00000553628 C3orf36Q3SXR2 165 aa6.91□□□□□ -1.3
AC009396.1-201ENST00000553628 HTR3DQ70Z44 454 aa6.91□□□□□ -1.3
AC009396.1-201ENST00000553628 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
AC009396.1-201ENST00000553628 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa6.91□□□□□ -1.3
AC009396.1-201ENST00000553628 CPA6Q8N4T0 437 aa6.91□□□□□ -1.3
AC009396.1-201ENST00000553628 OR52N2Q8NGI0 321 aa6.91□□□□□ -1.3
AC009396.1-201ENST00000553628 SLC35B2Q8TB61 432 aa6.91□□□□□ -1.3
AC009396.1-201ENST00000553628 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
AC009396.1-201ENST00000553628 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
AC009396.1-201ENST00000553628 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa6.91□□□□□ -1.3
AC009396.1-201ENST00000553628 LANCL2Q9NS86 450 aa6.91□□□□□ -1.3
AC009396.1-201ENST00000553628 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
AC009396.1-201ENST00000553628 GIT1Q9Y2X7 761 aa6.91□□□□□ -1.3
AC009396.1-201ENST00000553628 ERBINQ96RT1 1412 aa6.91□□□□□ -1.3
AC009396.1-201ENST00000553628 CCDC154A6NI56 674 aa6.9□□□□□ -1.3
AC009396.1-201ENST00000553628 CYP27B1O15528 508 aa6.9□□□□□ -1.3
AC009396.1-201ENST00000553628 MFAP3LO75121 409 aa6.9□□□□□ -1.3
AC009396.1-201ENST00000553628 AMY1AP04745 511 aa6.9□□□□□ -1.3
AC009396.1-201ENST00000553628 HK1P19367 917 aa6.9□□□□□ -1.3
AC009396.1-201ENST00000553628 PCSK1P29120 753 aa6.9□□□□□ -1.3
AC009396.1-201ENST00000553628 SP140Q13342 867 aa6.9□□□□□ -1.3
AC009396.1-201ENST00000553628 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
AC009396.1-201ENST00000553628 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
AC009396.1-201ENST00000553628 FAM47AQ5JRC9 791 aa6.9□□□□□ -1.3
AC009396.1-201ENST00000553628 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
AC009396.1-201ENST00000553628 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
AC009396.1-201ENST00000553628 IL17DQ8TAD2 202 aa6.9□□□□□ -1.3
AC009396.1-201ENST00000553628 RAB24Q969Q5 203 aa6.9□□□□□ -1.3
AC009396.1-201ENST00000553628 PGBD4Q96DM1 585 aa6.9□□□□□ -1.3
AC009396.1-201ENST00000553628 C7orf25Q9BPX7 421 aa6.9□□□□□ -1.3
AC009396.1-201ENST00000553628 GPR87Q9BY21 358 aa6.9□□□□□ -1.3
AC009396.1-201ENST00000553628 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
AC009396.1-201ENST00000553628 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
AC009396.1-201ENST00000553628 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
AC009396.1-201ENST00000553628 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
AC009396.1-201ENST00000553628 B5MCH6 92 aa6.89□□□□□ -1.31
AC009396.1-201ENST00000553628 ABLIM3O94929 683 aa6.89□□□□□ -1.31
AC009396.1-201ENST00000553628 MAN2A2P49641 1150 aa6.89□□□□□ -1.31
AC009396.1-201ENST00000553628 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP6.89□□□□□ -1.31
AC009396.1-201ENST00000553628 IL10RAQ13651 578 aa6.89□□□□□ -1.31
AC009396.1-201ENST00000553628 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
AC009396.1-201ENST00000553628 FAM83AQ86UY5 434 aa6.89□□□□□ -1.31
AC009396.1-201ENST00000553628 RHOT1Q8IXI2 618 aa6.89□□□□□ -1.31
AC009396.1-201ENST00000553628 STON2Q8WXE9 905 aa6.89□□□□□ -1.31
AC009396.1-201ENST00000553628 EXTL1Q92935 676 aa6.89□□□□□ -1.31
AC009396.1-201ENST00000553628 CAMKK2Q96RR4 588 aa6.89□□□□□ -1.31
AC009396.1-201ENST00000553628 MNTQ99583 582 aa6.89□□□□□ -1.31
AC009396.1-201ENST00000553628 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
AC009396.1-201ENST00000553628 TCF7L1Q9HCS4 588 aa6.89□□□□□ -1.31
AC009396.1-201ENST00000553628 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa6.89□□□□□ -1.31
AC009396.1-201ENST00000553628 KANK1Q14678 1352 aa6.89□□□□□ -1.31
AC009396.1-201ENST00000553628 ADGRB2O60241 1585 aa6.89□□□□□ -1.31
AC009396.1-201ENST00000553628 IFT172Q9UG01 1749 aa6.88□□□□□ -1.31
AC009396.1-201ENST00000553628 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa6.88□□□□□ -1.31
AC009396.1-201ENST00000553628 ADGRL2O95490 1459 aa6.88□□□□□ -1.31
AC009396.1-201ENST00000553628 ALDH1A3P47895 512 aa6.88□□□□□ -1.31
AC009396.1-201ENST00000553628 ATP8B2P98198 1209 aa6.88□□□□□ -1.31
AC009396.1-201ENST00000553628 CRHR2Q13324 411 aa6.88□□□□□ -1.31
AC009396.1-201ENST00000553628 MTM1Q13496 603 aa6.88□□□□□ -1.31
AC009396.1-201ENST00000553628 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
AC009396.1-201ENST00000553628 UAP1L1Q3KQV9 507 aa6.88□□□□□ -1.31
AC009396.1-201ENST00000553628 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
AC009396.1-201ENST00000553628 METTL24Q5JXM2 366 aa6.88□□□□□ -1.31
AC009396.1-201ENST00000553628 ODR4Q5SWX8 454 aa6.88□□□□□ -1.31
AC009396.1-201ENST00000553628 AFMIDQ63HM1 303 aa6.88□□□□□ -1.31
AC009396.1-201ENST00000553628 RNF207Q6ZRF8 634 aa6.88□□□□□ -1.31
AC009396.1-201ENST00000553628 MIGA2Q7L4E1 593 aa6.88□□□□□ -1.31
AC009396.1-201ENST00000553628 SPRED1Q7Z699 444 aa6.88□□□□□ -1.31
AC009396.1-201ENST00000553628 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
AC009396.1-201ENST00000553628 CCHCR1Q8TD31 782 aa6.88□□□□□ -1.31
AC009396.1-201ENST00000553628 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
AC009396.1-201ENST00000553628 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa6.88□□□□□ -1.31
AC009396.1-201ENST00000553628 KAT5Q92993 513 aa6.88□□□□□ -1.31
AC009396.1-201ENST00000553628 HDAC10Q969S8 669 aa6.88□□□□□ -1.31
AC009396.1-201ENST00000553628 GPR20Q99678 358 aa6.88□□□□□ -1.31
AC009396.1-201ENST00000553628 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
AC009396.1-201ENST00000553628 MANSC1Q9H8J5 431 aa6.88□□□□□ -1.31
AC009396.1-201ENST00000553628 IP6K2Q9UHH9 426 aa6.88□□□□□ -1.31
AC009396.1-201ENST00000553628 ACTL7AQ9Y615 435 aa6.88□□□□□ -1.31
AC009396.1-201ENST00000553628 SBF2Q86WG5 1849 aa6.87□□□□□ -1.31
AC009396.1-201ENST00000553628 FMN2Q9NZ56 1722 aa6.87□□□□□ -1.31
AC009396.1-201ENST00000553628 CLTCL1P53675 1640 aa6.87□□□□□ -1.31
AC009396.1-201ENST00000553628 IQGAP3Q86VI3 1631 aa6.87□□□□□ -1.31
AC009396.1-201ENST00000553628 DAPK1P53355 1430 aa6.87□□□□□ -1.31
AC009396.1-201ENST00000553628 TBKBP1A7MCY6 615 aa6.87□□□□□ -1.31
AC009396.1-201ENST00000553628 GRXCR1A8MXD5 290 aa6.87□□□□□ -1.31
AC009396.1-201ENST00000553628 AKAP10O43572 662 aa6.87□□□□□ -1.31
AC009396.1-201ENST00000553628 GPR32O75388 356 aa6.87□□□□□ -1.31
AC009396.1-201ENST00000553628 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
AC009396.1-201ENST00000553628 IL2RBP14784 551 aa6.87□□□□□ -1.31
AC009396.1-201ENST00000553628 RAB27AP51159 221 aa6.87□□□□□ -1.31
AC009396.1-201ENST00000553628 PTTG1IPP53801 180 aa6.87□□□□□ -1.31
AC009396.1-201ENST00000553628 VPS72Q15906 364 aa6.87□□□□□ -1.31
AC009396.1-201ENST00000553628 BMT2Q1RMZ1 405 aa6.87□□□□□ -1.31
AC009396.1-201ENST00000553628 PTF1AQ7RTS3 328 aa6.87□□□□□ -1.31
AC009396.1-201ENST00000553628 RNF169Q8NCN4 708 aa6.87□□□□□ -1.31
AC009396.1-201ENST00000553628 HSPBAP1Q96EW2 488 aa6.87□□□□□ -1.31
AC009396.1-201ENST00000553628 CYFIP2Q96F07 1278 aa6.87□□□□□ -1.31
AC009396.1-201ENST00000553628 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.87□□□□□ -1.31
AC009396.1-201ENST00000553628 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa6.87□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms