RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	STAT6	P42226	847 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	LIN9	Q5TKA1	542 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	TPGS2	Q68CL5	300 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	KIF12	Q96FN5	646 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	PANK2	Q9BZ23	570 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	TNMD	Q9H2S6	317 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	PCDHB8	Q9UN66	801 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	C2CD2	Q9Y426	696 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	XYLB	O75191	536 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	ATF2	P15336	505 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	ROR1	Q01973	937 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	ADAL	Q6DHV7	355 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	SHC4	Q6S5L8	630 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	FBXL6	Q8N531	539 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	IQUB	Q8NA54	791 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	ACCS	Q96QU6	501 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	KCNK12	Q9HB15	430 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	PIDD1	Q9HB75	910 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	PANK4	Q9NVE7	773 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	ANO9	A1A5B4	782 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	ANHX	E9PGG2	379 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	PIR	O00625	290 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	ASGR2	P07307	311 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	LAMP2	P13473	410 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	GART	P22102	1010 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	MCM4	P33991	863 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	PLA2G5	P39877	138 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	AMPD3	Q01432	767 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	KCNA1	Q09470	495 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	TDG	Q13569	410 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	JADE1	Q6IE81	842 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	ZNF280D	Q6N043	979 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	BEST2	Q8NFU1	509 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	MYADM	Q96S97	322 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	TRIM9	Q9C026	710 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	CFAP45	Q9UL16	551 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	ANK1	P16157	1881 aa		12.46	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	NOTCH4	Q99466	2003 aa		12.46	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	WDR27	A2RRH5	827 aa		12.46	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	TISP43	B9A030	160 aa		12.46	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	IL18RAP	O95256	599 aa		12.46	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	MYB	P10242	640 aa		12.46	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	IDE	P14735	1019 aa		12.46	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	TYMP	P19971	482 aa		12.46	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	ACOT2	P49753	483 aa		12.46	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	CASP5	P51878	434 aa		12.46	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	NUBP1	P53384	320 aa		12.46	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	LILRA4	P59901	499 aa		12.46	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	SPAG1	Q07617	926 aa		12.46	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		12.46	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		12.46	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	PDILT	Q8N807	584 aa		12.46	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	PRRX2	Q99811	253 aa		12.46	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	TMEM206	Q9H813	350 aa		12.46	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		12.46	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	DUSP12	Q9UNI6	340 aa		12.46	□□□□□ -0.41
CS-223	ENST00000551137	MICAL2	O94851	1124 aa		12.45	□□□□□ -0.42
CS-223	ENST00000551137	GCNT3	O95395	438 aa		12.45	□□□□□ -0.42
CS-223	ENST00000551137	CYP11A1	P05108	521 aa		12.45	□□□□□ -0.42
CS-223	ENST00000551137	NFIC	P08651	508 aa		12.45	□□□□□ -0.42
CS-223	ENST00000551137	FSHR	P23945	695 aa		12.45	□□□□□ -0.42
CS-223	ENST00000551137	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
CS-223	ENST00000551137	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
CS-223	ENST00000551137	EHHADH	Q08426	723 aa		12.45	□□□□□ -0.42
CS-223	ENST00000551137	HTR4	Q13639	388 aa		12.45	□□□□□ -0.42
CS-223	ENST00000551137	PKP1	Q13835	747 aa		12.45	□□□□□ -0.42
CS-223	ENST00000551137	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		12.45	□□□□□ -0.42
CS-223	ENST00000551137	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		12.45	□□□□□ -0.42
CS-223	ENST00000551137	RESP18	Q5W5W9	173 aa		12.45	□□□□□ -0.42
CS-223	ENST00000551137	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		12.45	□□□□□ -0.42
CS-223	ENST00000551137	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
CS-223	ENST00000551137	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		12.45	□□□□□ -0.42
CS-223	ENST00000551137	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		12.45	□□□□□ -0.42
CS-223	ENST00000551137	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
CS-223	ENST00000551137	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		12.45	□□□□□ -0.42

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