RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544910.5

VPS50-220, Transcript of VPS50, EARP/GARPII complex subunit, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS50, Length 5,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50-220ENST00000544910 NCOA4Q13772 614 aa6.13□□□□□ -1.43
VPS50-220ENST00000544910 HGSNATQ68CP4 663 aa6.13□□□□□ -1.43
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VPS50-220ENST00000544910 ZBED8Q8IZ13 594 aa6.13□□□□□ -1.43
VPS50-220ENST00000544910 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
VPS50-220ENST00000544910 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
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VPS50-220ENST00000544910 ZBTB39O15060 712 aa6.12□□□□□ -1.43
VPS50-220ENST00000544910 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
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VPS50-220ENST00000544910 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
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VPS50-220ENST00000544910 ZCWPW2Q504Y3 356 aa6.12□□□□□ -1.43
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VPS50-220ENST00000544910 VPS33BQ9H267 617 aa6.12□□□□□ -1.43
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VPS50-220ENST00000544910 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa6.12□□□□□ -1.43
VPS50-220ENST00000544910 JAM2P57087 298 aa6.12□□□□□ -1.43
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VPS50-220ENST00000544910 TTLL4Q14679 1199 aa6.12□□□□□ -1.43
VPS50-220ENST00000544910 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
VPS50-220ENST00000544910 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
VPS50-220ENST00000544910 HACE1Q8IYU2 909 aa6.12□□□□□ -1.43
VPS50-220ENST00000544910 FEZF2Q8TBJ5 459 aa6.12□□□□□ -1.43
VPS50-220ENST00000544910 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa6.12□□□□□ -1.43
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