RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 NDST4Q9H3R1 872 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 CEP72Q9P209 647 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 MYMKA6NI61 221 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 OPLAHO14841 1288 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 SPOPO43791 374 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 FTCDO95954 541 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 GSCP56915 257 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 STX1BP61266 288 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 MPP3Q13368 585 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 PALM2Q8IXS6 379 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 RNPEPQ9H4A4 650 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 CCDC134Q9H6E4 229 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 DCLRE1BQ9H816 532 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 CAAP1Q9H8G2 361 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 FBXL5Q9UKA1 691 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa6.39□□□□□ -1.39
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PTPRD-214ENST00000540109 KRT38O76015 456 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 GH2P01242 217 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 KRT3P12035 628 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 NQO1P15559 274 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
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PTPRD-214ENST00000540109 CYP27A1Q02318 531 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 GRM1Q13255 1194 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 TMED2Q15363 201 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 TKFCQ3LXA3 575 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 ACCSLQ4AC99 568 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 CEP55Q53EZ4 464 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 FUKQ8N0W3 1084 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 JADE3Q92613 823 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 NACC1Q96RE7 527 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 RPS6KC1Q96S38 1066 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 AP1M1Q9BXS5 423 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 PIM2Q9P1W9 311 aa6.39□□□□□ -1.39
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PTPRD-214ENST00000540109 ATP9AO75110 1047 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 EIF6P56537 245 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 TUBA1BP68363 451 aa6.39□□□□□ -1.39
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PTPRD-214ENST00000540109 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP6.39□□□□□ -1.39
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PTPRD-214ENST00000540109 TUBA1AQ71U36 451 aa6.39□□□□□ -1.39
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PTPRD-214ENST00000540109 HAS1Q92839 578 aa6.39□□□□□ -1.39
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PTPRD-214ENST00000540109 MMS19Q96T76 1030 aa6.39□□□□□ -1.39
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PTPRD-214ENST00000540109 PRR12Q9ULL5 1215 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 UPP2O95045 317 aa6.39□□□□□ -1.39
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PTPRD-214ENST00000540109 ENPEPQ07075 957 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 EPHA7Q15375 998 aa6.39□□□□□ -1.39
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PTPRD-214ENST00000540109 H2AFVQ71UI9 128 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 ZFAND2BQ8WV99 257 aa6.39□□□□□ -1.39
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PTPRD-214ENST00000540109 PP2D1A8MPX8 630 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
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PTPRD-214ENST00000540109 UTS2BQ765I0 119 aa6.38□□□□□ -1.39
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PTPRD-214ENST00000540109 EEF2KMTQ96G04 330 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 CNBD2Q96M20 576 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 NDNQ99608 321 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRD-214ENST00000540109 TTYH3Q9C0H2 523 aa6.38□□□□□ -1.39
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