RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531226.5

PACSIN3-208, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 654 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-208ENST00000531226 TEX28O15482 410 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 KLRC2P26717 231 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 TKTP29401 623 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 KCNQ1P51787 676 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 SURF1Q15526 300 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 TJAP1Q5JTD0 557 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 PDXDC1Q6P996 788 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 SUSD3Q96L08 255 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 PDE11AQ9HCR9 933 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 DPP3Q9NY33 737 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 FNIP2Q9P278 1114 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 UNC80Q8N2C7 3258 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 ANO9A1A5B4 782 aa20.58■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 PPEF2O14830 753 aa20.58■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 SYN3O14994 580 aa20.58■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP20.58■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 CLCN4P51793 760 aa20.58■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 PSMD5Q16401 504 aa20.58■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 C9orf57Q5W0N0 161 aa20.58■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC9A9Q8IVB4 645 aa20.58■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 TMEM174Q8WUU8 243 aa20.58■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 CD207Q9UJ71 328 aa20.58■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa20.58■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa20.58■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 PIRO00625 290 aa20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 CALUO43852 315 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 EXOC3O60645 756 aa20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 EPCAMP16422 314 aa20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 CLUL1Q15846 466 aa20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 ANKRD54Q6NXT1 300 aa20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 DENND4AQ7Z401 1863 aa20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 RDH13Q8NBN7 331 aa20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 DMAC2Q9NW81 257 aa20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 MTRRQ9UBK8 725 aa20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 M0QZQ0 153 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 NR3C1P04150 777 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 BMP1P13497 986 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 RPL17P18621 184 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 PAX3P23760 479 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 CYP24A1Q07973 514 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 MYBPC2Q14324 1141 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 COBLL1Q53SF7 1204 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 ANKS3Q6ZW76 656 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 SMRP1Q8NCR6 262 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 GBP4Q96PP9 640 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 DZANK1Q9NVP4 752 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 PCDHB8Q9UN66 801 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 MBTPS2O43462 519 aa20.55■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 GLUD1P00367 558 aa20.55■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 C1RP00736 705 aa20.55■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 TMEM191BP0C7N4 346 aa20.55■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 LILRA4P59901 499 aa20.55■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 PSMD6Q15008 389 aa20.55■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 NFIL3Q16649 462 aa20.55■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 SYCE2Q6PIF2 218 aa20.55■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 WDR49Q8IV35 697 aa20.55■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 GLYCTKQ8IVS8 523 aa20.55■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 C1orf127Q8N9H9 656 aa20.55■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa20.55■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 MFSD14AQ96MC6 490 aa20.55■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 CLSTN3Q9BQT9 956 aa20.55■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 MTMR12Q9C0I1 747 aa20.55■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 INTS13Q9NVM9 706 aa20.55■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 BACE2Q9Y5Z0 518 aa20.55■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 A0A0C4DFX4 3053 aa20.55■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 PTPRJQ12913 1337 aa20.54■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 GRXCR2A6NFK2 248 aa20.54■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 PRCPP42785 496 aa20.54■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 TAF6P49848 677 aa20.54■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 ZCWPW2Q504Y3 356 aa20.54■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 DSTYKQ6XUX3 929 aa20.54■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 APPL2Q8NEU8 664 aa20.54■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM84AQ96KN4 292 aa20.54■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF560Q96MR9 790 aa20.54■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 CGRRF1Q99675 332 aa20.54■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 MAN1B1Q9UKM7 699 aa20.54■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 ITGA11Q9UKX5 1188 aa20.54■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM50BQ9Y247 325 aa20.54■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 DOCK6Q96HP0 2047 aa20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 SPTLC1O15269 473 aa20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 ITGB3P05106 788 aa20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 IL9P15248 144 aa20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3-208ENST00000531226 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
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