RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 IFT20Q8IY31 132 aa8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 TTC30BQ8N4P2 665 aa8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 RSPH1Q8WYR4 309 aa8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 PLVAPQ9BX97 442 aa8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 THAP2Q9H0W7 228 aa8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM8AQ9HCN3 771 aa8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 TXNRD2Q9NNW7 524 aa8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 SOWAHBA6NEL2 793 aa8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 ASB14A6NK59 587 aa8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 PDHXO00330 501 aa8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 SGPL1O95470 568 aa8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 PRKCBP05771 671 aa8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 TGFB3P10600 412 aa8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 MAPTP10636 758 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 CASP8Q14790 479 aa8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 FXNQ16595 210 aa8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 EFCAB12Q6NXP0 572 aa8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 AFAP1L1Q8TED9 768 aa8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 RFFLQ8WZ73 363 aa8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 NACC2Q96BF6 587 aa8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 SENP7Q9BQF6 1050 aa8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 SGIP1Q9BQI5 828 aa8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 TLR10Q9BXR5 811 aa8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 PORCNQ9H237 461 aa8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 DPH5Q9H2P9 285 aa8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 FAM204AQ9H8W3 233 aa8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 FOCADQ5VW36 1801 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 HSF2BPO75031 334 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 SMIM24O75264 130 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 TNNC2P02585 160 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 FGGP02679 453 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 GJB1P08034 283 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 CETN2P41208 172 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 NAMPTP43490 491 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 PPIL2Q13356 520 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 SPOPLQ6IQ16 392 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 SLC47A2Q86VL8 602 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 SLC9A9Q8IVB4 645 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 ASAP3Q8TDY4 903 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 FIZ1Q96SL8 496 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 APOL6Q9BWW8 343 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 MROH8Q9H579 483 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 PDGFCQ9NRA1 345 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 CALCAP01258 141 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 HLA-DRAP01903 254 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 CETPP11597 493 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 RFX1P22670 979 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 GLRA2P23416 452 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 INHBCP55103 352 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 HUNKP57058 714 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 GPC5P78333 572 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 CYP24A1Q07973 514 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 TMCO4Q5TGY1 634 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 DCUN1D2Q6PH85 259 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 B3GNT9Q6UX72 402 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 REPS2Q8NFH8 660 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 VTI1AQ96AJ9 217 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 QSER1Q2KHR3 1735 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 GRID2IPA4D2P6 1211 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 ANKRD62A6NC57 917 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 GLTPD2A6NH11 291 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 EXTL3O43909 919 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 GRIN3BO60391 1043 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 ADORA2AP29274 412 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 RFC5P40937 340 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 NCKAP1LP55160 1127 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 AMPD2Q01433 879 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 IFFO1Q0D2I5 559 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 LIN9Q5TKA1 542 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 HVCN1Q96D96 273 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 ADPGKQ9BRR6 497 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
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