RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509787.1

TCERG1-208, Transcript of transcription elongation regulator 1, human

TSL 2

Gene TCERG1, Length 887 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCERG1-208	ENST00000509787	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TCERG1-208	ENST00000509787	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TCERG1-208	ENST00000509787	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCERG1-208	ENST00000509787	SHTN1	A0MZ66	631 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	CCDC154	A6NI56	674 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	SBK3	P0C264	359 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	ITGAM	P11215	1152 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	ALAS1	P13196	640 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	CXADR	P78310	365 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	CDC42EP1	Q00587	391 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	SLFN5	Q08AF3	891 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	ODF1	Q14990	250 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	FAM98A	Q8NCA5	519 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	CAGE1	Q8TC20	777 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	IFI44	Q8TCB0	444 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	HDAC10	Q969S8	669 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	TDP1	Q9NUW8	608 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	TNKS	O95271	1327 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	ALG1L2	C9J202	215 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	GPANK1	O95872	356 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	LMO1	P25800	156 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	SLC16A1	P53985	500 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	KRT85	P78386	507 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	CREM	Q03060	361 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	PTPN21	Q16825	1174 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	RSPH3	Q86UC2	560 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	FITM2	Q8N6M3	262 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	TBC1D15	Q8TC07	691 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	COA7	Q96BR5	231 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	RNF31	Q96EP0	1072 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	PCDH12	Q9NPG4	1184 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	GRM6	O15303	877 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	ZFPL1	O95159	310 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	FCER1A	P12319	257 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	PLA2G5	P39877	138 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	CYP2A13	Q16696	494 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	KAT5	Q92993	513 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	TLK1	Q9UKI8	766 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	SGTA	O43765	313 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	HAUS5	O94927	633 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	C1R	P00736	705 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	FLYWCH1	Q4VC44	716 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787		Q6ZNX1	250 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787		Q8NA96	180 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	NLGN4Y	Q8NFZ3	816 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	CLPTM1L	Q96KA5	538 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787		Q96MF0	132 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	PNKP	Q96T60	521 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	SMAD5	Q99717	465 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	DUSP26	Q9BV47	211 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	TLR10	Q9BXR5	811 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	TES	Q9UGI8	421 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	ERN1	O75460	977 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	AGFG2	O95081	481 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63	1e-5	■■■■□ 25.7
TCERG1-208	ENST00000509787	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	VAV2	P52735	878 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	TLE1	Q04724	770 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	ATP2B3	Q16720	1220 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	GEN1	Q17RS7	908 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TCERG1-208	ENST00000509787	RAB11FIP1	Q6WKZ4	1283 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63

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