RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498007.1

HLA-B-255, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

Gene HLA-B, Length 1,087 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-255ENST00000498007 MYBPC2Q14324 1141 aa21.4■■□□□ 1.02
HLA-B-255ENST00000498007 NFIL3Q16649 462 aa21.4■■□□□ 1.02
HLA-B-255ENST00000498007 DUSP6Q16828 381 aa21.4■■□□□ 1.02
HLA-B-255ENST00000498007 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
HLA-B-255ENST00000498007 WDR49Q8IV35 697 aa21.4■■□□□ 1.02
HLA-B-255ENST00000498007 OR5B17Q8NGF7 314 aa21.4■■□□□ 1.02
HLA-B-255ENST00000498007 TMEM174Q8WUU8 243 aa21.4■■□□□ 1.02
HLA-B-255ENST00000498007 EEF2KMTQ96G04 330 aa21.4■■□□□ 1.02
HLA-B-255ENST00000498007 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa21.4■■□□□ 1.02
HLA-B-255ENST00000498007 CGRRF1Q99675 332 aa21.4■■□□□ 1.02
HLA-B-255ENST00000498007 TTPALQ9BTX7 342 aa21.4■■□□□ 1.02
HLA-B-255ENST00000498007 CHST7Q9NS84 486 aa21.4■■□□□ 1.02
HLA-B-255ENST00000498007 CLDND1Q9NY35 253 aa21.4■■□□□ 1.02
HLA-B-255ENST00000498007 LINC01565O15544 149 aa21.39■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 TNNC2P02585 160 aa21.39■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 KRT19P08727 400 aa21.39■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 ADAM9Q13443 819 aa21.39■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 EDRF1Q3B7T1 1238 aa21.39■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 KIAA0319Q5VV43 1072 aa21.39■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 ANKRD40Q6AI12 368 aa21.39■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 CENPPQ6IPU0 288 aa21.39■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 LLGL2Q6P1M3 1020 aa21.39■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 C1orf127Q8N9H9 656 aa21.39■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 MFSD14AQ96MC6 490 aa21.39■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa21.39■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 INTS13Q9NVM9 706 aa21.39■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa21.39■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 IRAK3Q9Y616 596 aa21.39■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 ANO9A1A5B4 782 aa21.38■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa21.38■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 PIRO00625 290 aa21.38■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 AKAP3O75969 853 aa21.38■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 CNPP09543 421 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 FGFR3P22607 806 aa21.38■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 CCNE1P24864 410 aa21.38■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 PSMD5Q16401 504 aa21.38■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 DSTYKQ6XUX3 929 aa21.38■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 GLYCTKQ8IVS8 523 aa21.38■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 FAM186BQ8IYM0 893 aa21.38■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 PLEKHO2Q8TD55 490 aa21.38■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 NELFBQ8WX92 580 aa21.38■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 SUSD3Q96L08 255 aa21.38■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 ITGA11Q9UKX5 1188 aa21.38■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 AGAP1Q9UPQ3 857 aa21.38■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 TSC2P49815 1807 aa21.38■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 CETN3O15182 167 aa21.37■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 LILRB3O75022 631 aa21.37■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 RPL17P18621 184 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 RBM10P98175 930 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 LRRC63Q05C16 580 aa21.37■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 DUOXA2Q1HG44 320 aa21.37■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa21.37■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 EFHBQ8N7U6 833 aa21.37■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 ZNF560Q96MR9 790 aa21.37■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 KLHL5Q96PQ7 755 aa21.37■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 SCN1AP35498 2009 aa21.37■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 PLXNA3P51805 1871 aa21.37■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 SPTLC1O15269 473 aa21.36■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 TEX28O15482 410 aa21.36■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 KLRC2P26717 231 aa21.36■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 NDUFV1P49821 464 aa21.36■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 TAF6P49848 677 aa21.36■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 STX17P56962 302 aa21.36■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 LILRA4P59901 499 aa21.36■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 CREMQ03060 361 aa21.36■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 PAK1Q13153 545 aa21.36■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 VN1R2Q8NFZ6 395 aa21.36■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 PARD3BQ8TEW8 1205 aa21.36■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 PIK3R5Q8WYR1 880 aa21.36■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 HLA-CQ95604 372 aa21.36■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP21.36■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 THEGQ9P2T0 379 aa21.36■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 PCDHB8Q9UN66 801 aa21.36■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 FSD2A1L4K1 749 aa21.35■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 SYN3O14994 580 aa21.35■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 NCK2O43639 380 aa21.35■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 GLP2RO95838 553 aa21.35■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 ADH1AP07327 375 aa21.35■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 EPB41P11171 864 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 KRT13P13646 458 aa21.35■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 KCNA5P22460 613 aa21.35■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP21.35■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 DLG4P78352 724 aa21.35■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 BFSP1Q12934 665 aa21.35■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 SV2CQ496J9 727 aa21.35■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 SCARA3Q6AZY7 606 aa21.35■■□□□ 1.01
HLA-B-255ENST00000498007 PDXDC1Q6P996 788 aa21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.7 ms