RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490205.1

NELFCD-210, Transcript of negative elongation factor complex member C/D, humanhuman

TSL 2

Gene NELFCD, Length 650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFCD-210ENST00000490205 DDCP20711 480 aa4.7□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 NOMO3P69849 1222 aa4.7□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 NOMO2Q5JPE7 1267 aa4.7□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 LRCH2Q5VUJ6 765 aa4.7□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 ZNF384Q8TF68 577 aa4.7□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 C7orf25Q9BPX7 421 aa4.7□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 HEPHQ9BQS7 1158 aa4.7□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 SLC5A4Q9NY91 659 aa4.7□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 SLC17A6Q9P2U8 582 aa4.7□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 GPR45Q9Y5Y3 372 aa4.7□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa4.7□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 TRGV11A0A075B6L2 103 aa4.69□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 MGST3O14880 152 aa4.69□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 PEX1O43933 1283 aa4.69□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 AMY1AP04745 511 aa4.69□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 NCLP19338 710 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 GUCY2FP51841 1108 aa4.69□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 NHLH1Q02575 133 aa4.69□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 NECAB2Q7Z6G3 386 aa4.69□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 CNTD1Q8N815 330 aa4.69□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 OR2I1PQ8NGU4 316 aa4.69□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 TBC1D15Q8TC07 691 aa4.69□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 HSFX1Q9UBD0 423 aa4.69□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 K7ESF4 209 aa4.68□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 ZFPL1O95159 310 aa4.68□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 MATN4O95460 622 aa4.68□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 AGXTP21549 392 aa4.68□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 FOLR3P41439 243 aa4.68□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 IGBP1P78318 339 aa4.68□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 ATP8B2P98198 1209 aa4.68□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 GEN1Q17RS7 908 aa4.68□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 INAVAQ3KP66 663 aa4.68□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 DACT2Q5SW24 774 aa4.68□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 AMOTL1Q8IY63 956 aa4.68□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP4.68□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 SSH3Q8TE77 659 aa4.68□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 SLC2A13Q96QE2 648 aa4.68□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa4.68□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa4.68□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa4.67□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 FZD9O00144 591 aa4.67□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 GABRDO14764 452 aa4.67□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 ORC4O43929 436 aa4.67□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 PROP1O75360 226 aa4.67□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 HAUS5O94927 633 aa4.67□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 CTXN1P60606 82 aa4.67□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 SLFN5Q08AF3 891 aa4.67□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 RHOT1Q8IXI2 618 aa4.67□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 NRG4Q8WWG1 115 aa4.67□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 DPF2Q92785 391 aa4.67□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 KLK15Q9H2R5 256 aa4.67□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 TRHDEQ9UKU6 1024 aa4.67□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 INTUQ9ULD6 942 aa4.67□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 CCDC151A5D8V7 595 aa4.66□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 YY2O15391 372 aa4.66□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 C1QL1O75973 258 aa4.66□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 FCER1AP12319 257 aa4.66□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 IARSP41252 1262 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 ANAPC15P60006 121 aa4.66□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 ABCB5Q2M3G0 1257 aa4.66□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 AKNAD1Q5T1N1 836 aa4.66□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 PPM1NQ8N819 430 aa4.66□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 Q8NA96 180 aa4.66□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 SSH1Q8WYL5 1049 aa4.66□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 MTMR8Q96EF0 704 aa4.66□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 HOMER2Q9NSB8 354 aa4.66□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 NEU2Q9Y3R4 380 aa4.66□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 KAT6AQ92794 2004 aa4.66□□□□□ -1.66
NELFCD-210ENST00000490205 A0A1W2PS29 197 aa4.65□□□□□ -1.67
NELFCD-210ENST00000490205 LRRC3CA6NJW4 275 aa4.65□□□□□ -1.67
NELFCD-210ENST00000490205 ALG1L2C9J202 215 aa4.65□□□□□ -1.67
NELFCD-210ENST00000490205 MPPED1O15442 326 aa4.65□□□□□ -1.67
NELFCD-210ENST00000490205 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
NELFCD-210ENST00000490205 PDGFRBP09619 1106 aa4.65□□□□□ -1.67
NELFCD-210ENST00000490205 SRGNP10124 158 aa4.65□□□□□ -1.67
NELFCD-210ENST00000490205 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
NELFCD-210ENST00000490205 WASP42768 502 aa4.65□□□□□ -1.67
NELFCD-210ENST00000490205 FPGSQ05932 587 aa4.65□□□□□ -1.67
NELFCD-210ENST00000490205 SYDE2Q5VT97 1194 aa4.65□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms