RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	18.79	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		18.79	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	RESP18	Q5W5W9	173 aa		18.79	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	SHC4	Q6S5L8	630 aa		18.79	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		18.79	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		18.79	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	DDX12P	Q92771	950 aa		18.79	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		18.79	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		18.79	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	18.79	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	KCNK12	Q9HB15	430 aa		18.79	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		18.79	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	18.79	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		18.79	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		18.79	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	DENND4A	Q7Z401	1863 aa		18.78	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		18.78	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		18.78	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	18.78	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	OAZ2	O95190	189 aa		18.78	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	C8A	P07357	584 aa		18.78	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	SPATA31D3	P0C874	917 aa		18.78	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	LAMP2	P13473	410 aa		18.78	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	ATF2	P15336	505 aa		18.78	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	18.78	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	SPATA1	Q5VX52	437 aa		18.78	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		18.78	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		18.78	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	DHX58	Q96C10	678 aa		18.78	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		18.78	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		18.78	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	USP25	Q9UHP3	1055 aa		18.78	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	PCDHB8	Q9UN66	801 aa		18.78	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	DUSP12	Q9UNI6	340 aa		18.78	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	C2CD2	Q9Y426	696 aa		18.78	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		18.78	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	ANHX	E9PGG2	379 aa		18.77	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	18.77	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	MICAL2	O94851	1124 aa		18.77	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	CXCL8	P10145	99 aa		18.77	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	18.77	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	BRCC3	P46736	316 aa		18.77	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	18.77	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF280D	Q6N043	979 aa		18.77	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	18.77	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	TNMD	Q9H2S6	317 aa		18.77	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	WNT16	Q9UBV4	365 aa		18.77	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		18.77	■□□□□ 0.6
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A1W2PQ27	194 aa		18.76	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A1W2PQ64	194 aa		18.76	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A1W2PQD8	194 aa		18.76	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	LACTBL1	A8MY62	500 aa		18.76	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	18.76	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	ADAM12	O43184	909 aa		18.76	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	18.76	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	FSHR	P23945	695 aa		18.76	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	18.76	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	AVPR2	P30518	371 aa		18.76	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	18.76	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	ELF1	P32519	619 aa		18.76	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	CLCN5	P51795	746 aa		18.76	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		18.76	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC39A4	Q6P5W5	647 aa		18.76	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		18.76	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	BEST2	Q8NFU1	509 aa		18.76	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		18.76	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	KIF12	Q96FN5	646 aa		18.76	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	MYMK	A6NI61	221 aa		18.75	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	ASGR2	P07307	311 aa		18.75	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	TYMP	P19971	482 aa		18.75	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	MCM4	P33991	863 aa		18.75	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	PTPN5	P54829	565 aa		18.75	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	ROR1	Q01973	937 aa		18.75	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	18.75	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	18.75	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		18.75	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	ACCS	Q96QU6	501 aa		18.75	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	MYADM	Q96S97	322 aa		18.75	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM206	Q9H813	350 aa		18.75	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	18.75	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		18.75	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	18.75	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		18.75	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	18.75	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	CDH7	Q9ULB5	785 aa		18.75	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	ZDBF2	Q9HCK1	2354 aa		18.75	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	OR6C75	A6NL08	312 aa		18.74	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	IL18RAP	O95256	599 aa		18.74	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	GART	P22102	1010 aa		18.74	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	18.74	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	18.74	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	TNFSF9	P41273	254 aa		18.74	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	SYK	P43405	635 aa		18.74	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	SEZ6	Q53EL9	994 aa		18.74	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		18.74	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	MTSS1L	Q765P7	747 aa		18.74	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	DYM	Q7RTS9	669 aa		18.74	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	SFR1	Q86XK3	245 aa		18.74	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		18.74	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		18.74	■□□□□ 0.59

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