RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	CHMP2A	O43633	222 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF862	O60290	1169 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	ATP9A	O75110	1047 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	CNMD	O75829	334 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	NOL4	O94818	638 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	NDUFA10	O95299	355 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC25A27	O95847	323 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	NR3C1	P04150	777 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	MYB	P10242	640 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	TGFB3	P10600	412 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	ADH5	P11766	374 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	PLS3	P13797	630 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	NR2F2	P24468	414 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	ARNT	P27540	789 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	ABCD1	P33897	745 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	EPHX2	P34913	555 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	NF2	P35240	595 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	NCKAP1L	P55160	1127 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	GTF2B	Q00403	316 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	TUBB2A	Q13885	445 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	MTF1	Q14872	753 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	PPP2R5A	Q15172	486 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	TREML2	Q5T2D2	321 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	NSMF	Q6X4W1	530 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	PHC3	Q8NDX5	983 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	MYRFL	Q96LU7	910 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	DRC1	Q96MC2	740 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM74	Q96NL1	305 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	TUBB2B	Q9BVA1	445 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	GAN	Q9H2C0	597 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	BTBD7	Q9P203	1132 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	CEP72	Q9P209	647 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	SBF1	O95248	1867 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	EPHB6	O15197	1021 aa		6.05	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	P4HA2	O15460	535 aa		6.05	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	PJA2	O43164	708 aa		6.05	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	GRIN3B	O60391	1043 aa		6.05	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	AOC2	O75106	756 aa		6.05	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	HIP1R	O75146	1068 aa		6.05	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	AKAP3	O75969	853 aa		6.05	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	GCNT3	O95395	438 aa		6.05	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	PF4	P02776	101 aa		6.05	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	NME2	P22392	152 aa		6.05	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	PRKCI	P41743	596 aa		6.05	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	HERVK_113	P62684	666 aa		6.05	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	FKBP1B	P68106	108 aa		6.05	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	KRT83	P78385	493 aa		6.05	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	PAK2	Q13177	524 aa		6.05	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	STXBP2	Q15833	593 aa		6.05	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	UGCG	Q16739	394 aa		6.05	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		6.05	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	SGO2	Q562F6	1265 aa		6.05	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	PDXDC1	Q6P996	788 aa		6.05	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		6.05	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	ANO5	Q75V66	913 aa		6.05	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		6.05	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		6.05	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		6.05	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	MYCT1	Q8N699	235 aa		6.05	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	ANKRD7	Q92527	254 aa		6.05	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	KIFAP3	Q92845	792 aa		6.05	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		6.05	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC35C1	Q96A29	364 aa		6.05	□□□□□ -1.44
ATG4A-208	ENST00000489247	ERO1A	Q96HE7	468 aa		6.05	□□□□□ -1.44

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