RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463533.1

ANKRD28-208, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD28, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-208ENST00000463533 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 DGKIO75912 1065 aa9.14□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 LDHAP00338 332 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 ADRB2P07550 413 aa9.14□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 CCDC192P0DO97 292 aa9.14□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 MYOGP15173 224 aa9.14□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 NR2F2P24468 414 aa9.14□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 RPL13P26373 211 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 YARSP54577 528 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 LRRC63Q05C16 580 aa9.14□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 NFIL3Q16649 462 aa9.14□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 KYAT1Q16773 422 aa9.14□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 EDRF1Q3B7T1 1238 aa9.14□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 TREML4Q6UXN2 200 aa9.14□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC9A9Q8IVB4 645 aa9.14□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 TDHQ8IZJ6 230 aa9.14□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 TMEM130Q8N3G9 435 aa9.14□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa9.14□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 SNX27Q96L92 541 aa9.14□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 CASD1Q96PB1 797 aa9.14□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 UBN1Q9NPG3 1134 aa9.14□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa9.14□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 GIT1Q9Y2X7 761 aa9.14□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 NLRC5Q86WI3 1866 aa9.14□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 TTC26A0AVF1 554 aa9.13□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 CETN3O15182 167 aa9.13□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 AKAP3O75969 853 aa9.13□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 GJB5O95377 273 aa9.13□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 POMCP01189 267 aa9.13□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 SCNN1GP51170 649 aa9.13□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 MYBPC2Q14324 1141 aa9.13□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 NOMO2Q5JPE7 1267 aa9.13□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 GLRA4Q5JXX5 417 aa9.13□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 GLB1LQ6UWU2 654 aa9.13□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 ALKAL1Q6UXT8 129 aa9.13□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 LRRC55Q6ZSA7 311 aa9.13□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 BRSK2Q8IWQ3 736 aa9.13□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 ABI1Q8IZP0 508 aa9.13□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa9.13□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 GSTCDQ8NEC7 633 aa9.13□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM84AQ96KN4 292 aa9.13□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 FBXL18Q96ME1 805 aa9.13□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 RPS6KC1Q96S38 1066 aa9.13□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 YME1L1Q96TA2 773 aa9.13□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 TMEM117Q9H0C3 514 aa9.13□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 KIAA1586Q9HCI6 787 aa9.13□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 PDE11AQ9HCR9 933 aa9.13□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 PLAGL2Q9UPG8 496 aa9.13□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa9.13□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa9.13□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 MYO9BQ13459 2157 aa9.12□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa9.12□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 LCHNA4D1U4 455 aa9.12□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 PTGESO14684 152 aa9.12□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 TERTO14746 1132 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 IL18RAPO95256 599 aa9.12□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 NFICP08651 508 aa9.12□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 GUCY2FP51841 1108 aa9.12□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 PPP2R3AQ06190 1150 aa9.12□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 CYP24A1Q07973 514 aa9.12□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 PSMD6Q15008 389 aa9.12□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa9.12□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 XKR4Q5GH76 650 aa9.12□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 SPATA1Q5VX52 437 aa9.12□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 JADE1Q6IE81 842 aa9.12□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 LRSAM1Q6UWE0 723 aa9.12□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa9.12□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF280BQ86YH2 543 aa9.12□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 CREBRFQ8IUR6 639 aa9.12□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM186BQ8IYM0 893 aa9.12□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 AOPEPQ8N6M6 819 aa9.12□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 URGCPQ8TCY9 931 aa9.12□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 PLEKHO2Q8TD55 490 aa9.12□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 TMEM174Q8WUU8 243 aa9.12□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 CCDC127Q96BQ5 260 aa9.12□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 MFSD14AQ96MC6 490 aa9.12□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 CEP63Q96MT8 703 aa9.12□□□□□ -0.95
ANKRD28-208ENST00000463533 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.2 ms