RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439407.1

LMCD1-AS1-202, LMCD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene LMCD1-AS1, Length 576 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 GAD1Q99259 594 aa7.23□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 AGPAT1Q99943 283 aa7.23□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 FTHL17Q9BXU8 183 aa7.23□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 OSBPL7Q9BZF2 842 aa7.23□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa7.23□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 HIPK3Q9H422 1215 aa7.23□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 UBN1Q9NPG3 1134 aa7.23□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SPTLC3Q9NUV7 552 aa7.23□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa7.23□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ITGA11Q9UKX5 1188 aa7.23□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 LRFN2Q9ULH4 789 aa7.23□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 GIT1Q9Y2X7 761 aa7.23□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 NUB1Q9Y5A7 615 aa7.23□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ADGRG1Q9Y653 693 aa7.23□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 A0A0U1RQF3 1178 aa7.22□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 MGEA5O60502 916 aa7.22□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ZNF623O75123 536 aa7.22□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PARNO95453 639 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ASS1P00966 412 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 WEE2P0C1S8 567 aa7.22□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 KCNE1P15382 129 aa7.22□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CD58P19256 250 aa7.22□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CYP3A5P20815 502 aa7.22□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PRKCIP41743 596 aa7.22□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CYP27A1Q02318 531 aa7.22□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 KIF5AQ12840 1032 aa7.22□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa7.22□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 TAF3Q5VWG9 929 aa7.22□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 HGSNATQ68CP4 663 aa7.22□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 TMEM270Q6UE05 265 aa7.22□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ALKAL1Q6UXT8 129 aa7.22□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa7.22□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SLC24A5Q71RS6 500 aa7.22□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa7.22□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 DEFB128Q7Z7B8 93 aa7.22□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ECHDC2Q86YB7 292 aa7.22□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 DBF4BQ8NFT6 615 aa7.22□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SHC3Q92529 594 aa7.22□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 JAKMIP2Q96AA8 810 aa7.22□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SCLYQ96I15 445 aa7.22□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ZNF560Q96MR9 790 aa7.22□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 DNAI2Q9GZS0 605 aa7.22□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 NIF3L1Q9GZT8 377 aa7.22□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 MCOLN1Q9GZU1 580 aa7.22□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 RSAD1Q9HA92 442 aa7.22□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 LZTFL1Q9NQ48 299 aa7.22□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 RGS18Q9NS28 235 aa7.22□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SLC38A7Q9NVC3 462 aa7.22□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CNTN3Q9P232 1028 aa7.22□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa7.22□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SIX4Q9UIU6 781 aa7.22□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 POLIQ9UNA4 740 aa7.22□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa7.22□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa7.22□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa7.22□□□□□ -1.25
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 USP27XA6NNY8 438 aa7.21□□□□□ -1.26
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 TMCO5BA8MYB1 307 aa7.21□□□□□ -1.26
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PITPNM1O00562 1244 aa7.21□□□□□ -1.26
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ENPP3O14638 875 aa7.21□□□□□ -1.26
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 KRT86O43790 486 aa7.21□□□□□ -1.26
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 NBNO60934 754 aa7.21□□□□□ -1.26
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 EOMESO95936 686 aa7.21□□□□□ -1.26
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 POMCP01189 267 aa7.21□□□□□ -1.26
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 TUBB4AP04350 444 aa7.21□□□□□ -1.26
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CLTBP09497 229 aa7.21□□□□□ -1.26
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 TNNT1P13805 278 aa7.21□□□□□ -1.26
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CD19P15391 556 aa7.21□□□□□ -1.26
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ANXA13P27216 316 aa7.21□□□□□ -1.26
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CYP2C18P33260 490 aa7.21□□□□□ -1.26
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CLCN1P35523 988 aa7.21□□□□□ -1.26
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 MLH1P40692 756 aa7.21□□□□□ -1.26
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PNPLA4P41247 253 aa7.21□□□□□ -1.26
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 TAF6P49848 677 aa7.21□□□□□ -1.26
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PDE6CP51160 858 aa7.21□□□□□ -1.26
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 FAAP100Q0VG06 881 aa7.21□□□□□ -1.26
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ZBTB6Q15916 424 aa7.21□□□□□ -1.26
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SLC18A3Q16572 532 aa7.21□□□□□ -1.26
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ZNF394Q53GI3 561 aa7.21□□□□□ -1.26
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 XKR4Q5GH76 650 aa7.21□□□□□ -1.26
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 C10orf76Q5T2E6 689 aa7.21□□□□□ -1.26
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 C1orf53Q5VUE5 145 aa7.21□□□□□ -1.26
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 C9orf57Q5W0N0 161 aa7.21□□□□□ -1.26
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SCARA3Q6AZY7 606 aa7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms