RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414009.1

HPS1-205, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene HPS1, Length 857 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-205ENST00000414009 PDE11AQ9HCR9 933 aa15.95■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 MARCH5Q9NX47 278 aa15.95■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 CACNG4Q9UBN1 327 aa15.95■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa15.95■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 KIF4AO95239 1232 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 CXCL14O95715 111 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 TNNC2P02585 160 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 SOD2P04179 222 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 DLATP10515 647 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 KRT13P13646 458 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 CCNE1P24864 410 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 DNAJB1P25685 340 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 LRPAP1P30533 357 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 CYP24A1Q07973 514 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 ZBTB6Q15916 424 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 NFIL3Q16649 462 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 USP41Q3LFD5 358 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 CENPPQ6IPU0 288 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 TMEM174Q8WUU8 243 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 CCDC127Q96BQ5 260 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 DPP3Q9NY33 737 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 DACH1Q9UI36 760 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 ANK1P16157 1881 aa15.93■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 FSD2A1L4K1 749 aa15.93■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 CTSAP10619 480 aa15.93■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 PAX3P23760 479 aa15.93■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 GLUD2P49448 558 aa15.93■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 ERVFC1P60507 584 aa15.93■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 PSMD6Q15008 389 aa15.93■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 DUOXA2Q1HG44 320 aa15.93■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 CCDC183Q5T5S1 534 aa15.93■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 PDXDC1Q6P996 788 aa15.93■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 CEP57Q86XR8 500 aa15.93■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 WDR49Q8IV35 697 aa15.93■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 NELFBQ8WX92 580 aa15.93■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 ZBP1Q9H171 429 aa15.93■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 DMAC2Q9NW81 257 aa15.93■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 CTNND2Q9UQB3 1225 aa15.93■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 CHD9Q3L8U1 2897 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 ARHGEF37A1IGU5 675 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 F8W810 466 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 MAPK13O15264 365 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 NCK2O43639 380 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 EPB41P11171 864 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 IRS1P35568 1242 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 CREMQ03060 361 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 PAK1Q13153 545 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 CAMK2BQ13554 666 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 FAM171A1Q5VUB5 890 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 EFCAB13Q8IY85 973 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 FAM186BQ8IYM0 893 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 MLKLQ8NB16 471 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 MFSD14AQ96MC6 490 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 ZNF560Q96MR9 790 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 CGRRF1Q99675 332 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 TLE6Q9H808 572 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 INTS13Q9NVM9 706 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 ITGA11Q9UKX5 1188 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa15.91■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 C2CD2LO14523 706 aa15.91■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 FSCN2O14926 492 aa15.91■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 PHACTR2O75167 634 aa15.91■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 CLSTN1O94985 981 aa15.91■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 KRT19P08727 400 aa15.91■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 PNPLA4P41247 253 aa15.91■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 CASP4P49662 377 aa15.91■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 GUCY2FP51841 1108 aa15.91■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 AP3M2P53677 418 aa15.91■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 CAMK1Q14012 370 aa15.91■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 ZCWPW2Q504Y3 356 aa15.91■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 TCEAL5Q5H9L2 206 aa15.91■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 C9orf57Q5W0N0 161 aa15.91■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 ANKRD40Q6AI12 368 aa15.91■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 SASS6Q6UVJ0 657 aa15.91■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 DSTYKQ6XUX3 929 aa15.91■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa15.91■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 TTPALQ9BTX7 342 aa15.91■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 MKNK1Q9BUB5 465 aa15.91■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 GPR62Q9BZJ7 368 aa15.91■□□□□ 0.14
HPS1-205ENST00000414009 MTMR12Q9C0I1 747 aa15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms