RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399451.6

ANKRD28-201, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD28, Length 6,564 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-201ENST00000399451 UNC13BO14795 1591 aa22.5■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 MADDQ8WXG6 1647 aa22.5■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 RASSF10A6NK89 507 aa22.5■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 AP3B1O00203 1094 aa22.5■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 ACTR2P61160 394 aa22.5■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 SYTL3Q4VX76 610 aa22.5■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 RAD9BQ6WBX8 426 aa22.5■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 LPAR1Q92633 364 aa22.5■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 MYMKA6NI61 221 aa22.5■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 ANKS3Q6ZW76 656 aa22.5■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 MYBP10242 640 aa22.5■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 SNX17Q15036 470 aa22.5■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 KDELC2Q7Z4H8 507 aa22.5■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 WDR35Q9P2L0 1181 aa22.5■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 AGAP1Q9UPQ3 857 aa22.5■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 TPI1P60174 286 aa22.49■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 VPS72Q15906 364 aa22.49■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 CDH16O75309 829 aa22.49■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 LONP2Q86WA8 852 aa22.49■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 ANKRD7Q92527 254 aa22.49■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 TMEM143Q96AN5 459 aa22.49■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 CLMNQ96JQ2 1002 aa22.49■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 HSD17B4P51659 736 aa22.49■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 KDSRQ06136 332 aa22.49■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 PPCSQ9HAB8 311 aa22.49■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 NPHS2Q9NP85 383 aa22.49■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 FLT1P17948 1338 aa22.49■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 STXBP3O00186 592 aa22.49■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 ITGA4P13612 1032 aa22.49■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 SDE2Q6IQ49 451 aa22.49■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 EPAS1Q99814 870 aa22.49■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 TMEM117Q9H0C3 514 aa22.49■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 FHOD1Q9Y613 1164 aa22.49■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 KCNA2P16389 499 aa22.49■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa22.49■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 NEU2Q9Y3R4 380 aa22.49■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 MDH1BQ5I0G3 518 aa22.48■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 ARHGEF26Q96DR7 871 aa22.48■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa22.48■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 SERPIND1P05546 499 aa22.48■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 EDRF1Q3B7T1 1238 aa22.48■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 TBC1D19Q8N5T2 526 aa22.48■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 TRADDQ15628 312 aa22.48■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 CNPY4Q8N129 248 aa22.48■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP22.48■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa22.48■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 CHD1O14646 1710 aa22.48■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 DGAT1O75907 488 aa22.48■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 STK4Q13043 487 aa22.48■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa22.48■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 RAD51CO43502 376 aa22.48■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 STILQ15468 1287 aa22.48■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa22.48■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa22.48■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 UNC45AQ9H3U1 944 aa22.48■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 ZNF197O14709 1029 aa22.47■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 MAN1A2O60476 641 aa22.47■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 FCGRTP55899 365 aa22.47■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 TMEM132DQ14C87 1099 aa22.47■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 DNAL1Q4LDG9 190 aa22.47■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 ASAP3Q8TDY4 903 aa22.47■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 NUDT12Q9BQG2 462 aa22.47■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa22.47■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 USP31Q70CQ4 1352 aa22.47■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 PSMD3O43242 534 aa22.47■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 SGSM3Q96HU1 749 aa22.47■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 MUC3BQ9H195 1237 aa22.47■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 STKLD1Q8NE28 680 aa22.47■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 MCEEQ96PE7 176 aa22.47■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 SERPINB9P50453 376 aa22.47■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 WDR72Q3MJ13 1102 aa22.47■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 PRR5LQ6MZQ0 368 aa22.47■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 PHF20L1A8MW92 1017 aa22.47■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 OR1G1P47890 313 aa22.47■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 SNX9Q9Y5X1 595 aa22.47■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.47■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 GYPCP04921 128 aa22.47■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 INPP5AQ14642 412 aa22.47■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 SEC16BQ96JE7 1060 aa22.47■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 FAM47DPA6NHR8 397 aa22.46■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 WASHC5Q12768 1159 aa22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms