RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 FIBCD1Q8N539 461 aa31.87■■■□□ 2.69
ECHS1-201ENST00000368547 CXorf38Q8TB03 319 aa31.87■■■□□ 2.69
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ECHS1-201ENST00000368547 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP31.86■■■□□ 2.69
ECHS1-201ENST00000368547 MYOGP15173 224 aa31.86■■■□□ 2.69
ECHS1-201ENST00000368547 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP31.86■■■□□ 2.69
ECHS1-201ENST00000368547 PBX1P40424 430 aa31.86■■■□□ 2.69
ECHS1-201ENST00000368547 GSDMDP57764 484 aa31.86■■■□□ 2.69
ECHS1-201ENST00000368547 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP31.86■■■□□ 2.69
ECHS1-201ENST00000368547 C9orf57Q5W0N0 161 aa31.86■■■□□ 2.69
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ECHS1-201ENST00000368547 UROC1Q96N76 676 aa31.86■■■□□ 2.69
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ECHS1-201ENST00000368547 VNN1O95497 513 aa31.86■■■□□ 2.69
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ECHS1-201ENST00000368547 OR1G1P47890 313 aa31.86■■■□□ 2.69
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ECHS1-201ENST00000368547 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa31.86■■■□□ 2.69
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ECHS1-201ENST00000368547 AGAP1Q9UPQ3 857 aa31.86■■■□□ 2.69
ECHS1-201ENST00000368547 ANO9A1A5B4 782 aa31.85■■■□□ 2.69
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ECHS1-201ENST00000368547 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa31.85■■■□□ 2.69
ECHS1-201ENST00000368547 ITIH6Q6UXX5 1313 aa31.85■■■□□ 2.69
ECHS1-201ENST00000368547 SCN1AP35498 2009 aa31.84■■■□□ 2.69
ECHS1-201ENST00000368547 PBX3P40426 434 aa31.84■■■□□ 2.69
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ECHS1-201ENST00000368547 SLC11A1P49279 550 aa31.84■■■□□ 2.69
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ECHS1-201ENST00000368547 TRPC3Q13507 836 aa31.84■■■□□ 2.69
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ECHS1-201ENST00000368547 CCDC186Q7Z3E2 898 aa31.84■■■□□ 2.69
ECHS1-201ENST00000368547 FBXL13Q8NEE6 735 aa31.84■■■□□ 2.69
ECHS1-201ENST00000368547 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP31.84■■■□□ 2.69
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ECHS1-201ENST00000368547 TEX33O43247 280 aa31.83■■■□□ 2.69
ECHS1-201ENST00000368547 HLA-DRAP01903 254 aa31.83■■■□□ 2.69
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ECHS1-201ENST00000368547 NRP1O14786 923 aa31.82■■■□□ 2.69
ECHS1-201ENST00000368547 GALTP07902 379 aa31.82■■■□□ 2.69
ECHS1-201ENST00000368547 PBX2P40425 430 aa31.82■■■□□ 2.69
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ECHS1-201ENST00000368547 NLRC5Q86WI3 1866 aa31.82■■■□□ 2.68
ECHS1-201ENST00000368547 A0A1W2PQC6 194 aa31.82■■■□□ 2.68
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ECHS1-201ENST00000368547 LRRN2O75325 713 aa31.82■■■□□ 2.68
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ECHS1-201ENST00000368547 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP31.82■■■□□ 2.68
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ECHS1-201ENST00000368547 C3orf58Q8NDZ4 430 aa31.82■■■□□ 2.68
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ECHS1-201ENST00000368547 PBX4Q9BYU1 374 aa31.82■■■□□ 2.68
ECHS1-201ENST00000368547 RAB20Q9NX57 234 aa31.82■■■□□ 2.68
ECHS1-201ENST00000368547 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP31.82■■■□□ 2.68
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ECHS1-201ENST00000368547 CA3P07451 260 aa31.81■■■□□ 2.68
ECHS1-201ENST00000368547 LINC00271P0C7V0 271 aa31.81■■■□□ 2.68
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ECHS1-201ENST00000368547 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP31.81■■■□□ 2.68
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ECHS1-201ENST00000368547 KCNT2Q6UVM3 1135 aa31.81■■■□□ 2.68
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ECHS1-201ENST00000368547 LINC01553A4QN01 128 aa31.8■■■□□ 2.68
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ECHS1-201ENST00000368547 LRRC52Q8N7C0 313 aa31.8■■■□□ 2.68
ECHS1-201ENST00000368547 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa31.8■■■□□ 2.68
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ECHS1-201ENST00000368547 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP31.8■■■□□ 2.68
ECHS1-201ENST00000368547 GCNT4Q9P109 453 aa31.8■■■□□ 2.68
ECHS1-201ENST00000368547 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP31.8■■■□□ 2.68
ECHS1-201ENST00000368547 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP31.79■■■□□ 2.68
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ECHS1-201ENST00000368547 ELMO3Q96BJ8 720 aa31.79■■■□□ 2.68
ECHS1-201ENST00000368547 HPDLQ96IR7 371 aa31.79■■■□□ 2.68
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF560Q96MR9 790 aa31.79■■■□□ 2.68
ECHS1-201ENST00000368547 XYLT2Q9H1B5 865 aa31.79■■■□□ 2.68
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ECHS1-201ENST00000368547 ARHGEF15O94989 841 aa31.78■■■□□ 2.68
ECHS1-201ENST00000368547 ITGB1P05556 798 aa31.78■■■□□ 2.68
ECHS1-201ENST00000368547 PNPLA4P41247 253 aa31.78■■■□□ 2.68
ECHS1-201ENST00000368547 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa31.78■■■□□ 2.68
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC150Q8NCX0 1101 aa31.78■■■□□ 2.68
ECHS1-201ENST00000368547 COLEC11Q9BWP8 271 aa31.78■■■□□ 2.68
ECHS1-201ENST00000368547 AAASQ9NRG9 546 aa31.78■■■□□ 2.68
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